KH
Katherine Harris
Author with expertise in Impact of COVID-19 on Mental Health
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
342
h-index:
13
/
i10-index:
13
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Sorghum stay-green QTL individually reduce post-flowering drought-induced leaf senescence

Katherine Harris et al.Nov 6, 2006
Sorghum is an important source of food, feed, and biofuel, especially in the semi-arid tropics because this cereal is well adapted to harsh, drought-prone environments.Post-flowering drought adaptation in sorghum is associated with the stay-green phenotype.Alleles that contribute to this complex trait have been mapped to four major QTL, Stg1-Stg4, using a population derived from BT3642 and RT37000.Near-isogenic RT37000 lines containing BT3642 DNA spanning one or more of the four stay-green QTL were constructed.The size and location of BT3642 DNA regions in each RT37000 NIL were analysed using 62 DNA markers spanning the four stay-green QTL.RT37000 NILs were identified that contained BT3642 DNA completely or partially spanning Stg1, Stg2, Stg3, or Stg4.NILs were also identified that contained sub-portions of each QTL and various combinations of the four major stay-green QTL.Physiological analysis of four RT37000 NILs containing only Stg1, Stg2, Stg3, or Stg4 showed that BT3642 alleles in each of these loci could contribute to the stay-green phenotype.RT37000 NILs containing BT3642 DNA corresponding to Stg2 retained more green leaf area at maturity under terminal drought conditions than RT37000 or the other RT37000 NILs.Under postanthesis water deficit, a trend for delayed onset of leaf senescence compared with RT37000 was also exhibited by the Stg2, Stg3, and Stg4 NILs, while significantly lower rates of leaf senescence in relation to RT37000 were displayed by all of the Stg NILs to varying degrees, but particularly by the Stg2 NIL.Greener leaves at anthesis relative to RT37000, indicated by higher SPAD values, were exhibited by the Stg1 and Stg4 NILs.The RT37000 NILs created in this study provide the starting point for in-depth analysis of stay-green physiology, interaction among stay-green QTL and map-based cloning of the genes that underlie this trait.
0
Citation339
0
Save
0

Feasibility of wearable sensor signals and self-reported symptoms to prompt at-home testing for acute respiratory viruses in the USA (DETECT-AHEAD): a decentralised, randomised controlled trial

Giorgio Quer et al.Jul 24, 2024
BackgroundEarly identification of an acute respiratory infection is important for reducing transmission and enabling earlier therapeutic intervention. We aimed to prospectively evaluate the feasibility of home-based diagnostic self-testing of viral pathogens in individuals prompted to do so on the basis of self-reported symptoms or individual changes in physiological parameters detected via a wearable sensor.MethodsDETECT-AHEAD was a prospective, decentralised, randomised controlled trial carried out in a subpopulation of an existing cohort (DETECT) of individuals enrolled in a digital-only observational study in the USA. Participants aged 18 years or older were randomly assigned (1:1:1) with a block randomisation scheme stratified by under-represented in biomedical research status. All participants were offered a wearable sensor (Fitbit Sense smartwatch). Participants in groups 1 and 2 received an at-home self-test kit (Alveo be.well) for two acute respiratory viral pathogens: SARS-CoV-2 and respiratory syncytial virus. Participants in group 1 could be alerted through the DETECT study app to take the at-home test on the basis of changes in their physiological data (as detected by our algorithm) or due to self-reported symptoms; those in group 2 were prompted via the app to self-test only due to symptoms. Group 3 served as the control group, without alerts or home testing capability. The primary endpoints, assessed on an intention-to-treat basis, were the number of acute respiratory infections presented (self-reported) and diagnosed (electronic health record), and the number of participants using at-home testing in groups 1 and 2. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, NCT04336020.FindingsBetween Sept 28 and Dec 30, 2021, 450 participants were recruited and randomly assigned to group 1 (n=149), group 2 (n=151), or group 3 (n=150). 179 (40%) participants were male, 264 (59%) were female, and seven (2%) identified as other. 232 (52%) were from populations historically under-represented in biomedical research. 118 (39%) of the 300 participants in groups 1 and 2 were prompted to self-test, with 61 (52%) successfully completing self-testing. Participants were prompted to home-test more frequently due to symptoms (41 [28%] in group 1 and 51 [34%] in group 2) than due to detected physiological changes (26 [17%] in group 1). Significantly more participants in group 1 received alerts to test than did those in group 2 (67 [45%] vs 51 [34%]; p=0·047). Of the 61 individuals who were prompted to test and successfully did so, 19 (31%) tested positive for a viral pathogen—all for SARS-CoV-2. The individuals diagnosed as positive for SARS-CoV-2 in the electronic health record were eight (5%) in group 1, four (3%) in group 2, and two (1%) in group 3, but it was difficult to confirm if they were tied to symptomatic episodes documented in the trial. There were no adverse events.InterpretationIn this direct-to-participant trial, we showed early feasibility of a decentralised programme to prompt individuals to use a viral pathogen diagnostic test based on symptoms tracked in the study app or physiological changes detected using a wearable sensor. Barriers to adequate participation and performance were also identified, which would need to be addressed before large-scale implementation.FundingJanssen Pharmaceuticals.
0
Citation2
0
Save