DB
Daniel Brennan
Author with expertise in Kidney Transplantation
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(83% Open Access)
Cited by:
5,836
h-index:
73
/
i10-index:
261
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Identification of a Novel Polyomavirus from Patients with Acute Respiratory Tract Infections

Anne Gaynor et al.May 1, 2007
We report the identification of a novel polyomavirus present in respiratory secretions from human patients with symptoms of acute respiratory tract infection. The virus was initially detected in a nasopharyngeal aspirate from a 3-year-old child from Australia diagnosed with pneumonia. A random library was generated from nucleic acids extracted from the nasopharyngeal aspirate and analyzed by high throughput DNA sequencing. Multiple DNA fragments were cloned that possessed limited homology to known polyomaviruses. We subsequently sequenced the entire virus genome of 5,229 bp, henceforth referred to as WU virus, and found it to have genomic features characteristic of the family Polyomaviridae. The genome was predicted to encode small T antigen, large T antigen, and three capsid proteins: VP1, VP2, and VP3. Phylogenetic analysis clearly revealed that the WU virus was divergent from all known polyomaviruses. Screening of 2,135 patients with acute respiratory tract infections in Brisbane, Queensland, Australia, and St. Louis, Missouri, United States, using WU virus–specific PCR primers resulted in the detection of 43 additional specimens that contained WU virus. The presence of multiple instances of the virus in two continents suggests that this virus is geographically widespread in the human population and raises the possibility that the WU virus may be a human pathogen.
0
Citation683
0
Save
0

Incidence of BK with Tacrolimus Versus Cyclosporine and Impact of Preemptive Immunosuppression Reduction

Daniel Brennan et al.Mar 1, 2005
Our purposes were to determine the incidence of BK viruria, viremia or nephropathy with tacrolimus (FK506) versus cyclosporine (CyA) and whether intensive monitoring and discontinuation of mycophenolate (MMF) or azathioprine (AZA), upon detection of BK viremia, could prevent BK nephropathy. We randomized 200 adult renal transplant recipients to FK506 (n = 134) or CyA (n = 66). Urine and blood were collected weekly for 16 weeks and at months 5, 6, 9 and 12 and analyzed for BK by polymerase chain reaction (PCR). By 1 year, 70 patients (35%) developed viruria and 23 (11.5%) viremia; neither were affected independently by FK506, CyA, MMF or AZA. Viruria was highest with FK506-MMF (46%) and lowest with CyA-MMF (13%), p = 0.005. Viruria >/= 9.5 log(10) copies/mL was associated with a 3-fold increased risk of viremia and a 13-fold increased risk of sustained viremia. After reduction of immunosuppression, viremia resolved in 95%, without increased acute rejection, allograft dysfunction or graft loss. No BK nephropathy was observed. Choice of calcineurin inhibitor or adjuvant immunosuppression, independently, did not affect BK viruria or viremia. Viruria was highest with FK506-MMF and lowest with CyA-MMF. Monitoring and preemptive withdrawal of immunosuppression were associated with resolution of viremia and absence of BK nephropathy without acute rejection or graft loss.
0
Citation660
0
Save
0

Conversion From Calcineurin Inhibitors to Sirolimus Maintenance Therapy in Renal Allograft Recipients: 24-Month Efficacy and Safety Results From the CONVERT Trial

Francesco Schena et al.Jan 20, 2009
The efficacy and safety of converting maintenance renal transplant recipients from calcineurin inhibitors (CNIs) to sirolimus (SRL) was evaluated.Eight hundred thirty renal allograft recipients, 6 to 120 months posttransplant and receiving cyclosporine or tacrolimus, were randomly assigned to continue CNI (n=275) or convert from CNI to SRL (n=555). Primary endpoints were calculated Nankivell glomerular filtration rate (GFR; stratified at baseline: 20-40 vs. >40 mL/min) and the cumulative rates of biopsy-confirmed acute rejection (BCAR), graft loss, or death at 12 months. Enrollment in the 20 to 40 mL/min stratum was halted prematurely because of a higher incidence of safety endpoints in the SRL conversion arm.Intent-to-treat analyses at 12 and 24 months showed no significant treatment difference in GFR in the baseline GFR more than 40 mL/min stratum. On-therapy analysis of this cohort showed significantly higher GFR at 12 and 24 months after SRL conversion. Rates of BCAR, graft survival, and patient survival were similar between groups. Median urinary protein-to-creatinine ratios (UPr/Cr) were similar at baseline but increased significantly after SRL conversion. Malignancy rates were significantly lower at 12 and 24 months after SRL conversion. Post hoc analyses identified a subgroup with baseline GFR more than 40 mL/min and UPr/Cr less than or equal to 0.11, whose risk-benefit profile was more favorable after conversion than that for the overall SRL conversion cohort.At 2 years, SRL conversion among patients with baseline GFR more than 40 mL/min was associated with excellent patient and graft survival, no difference in BCAR, increased urinary protein excretion, and a lower incidence of malignancy compared with CNI continuation. Superior renal function was observed among patients who remained on SRL through 12 to 24 months, particularly in the subgroup of patients with baseline GFR more than 40 mL/min and UPr/Cr less than or equal to 0.11.
0
Citation567
0
Save
0

Cell-Free DNA and Active Rejection in Kidney Allografts

Roy Bloom et al.Mar 9, 2017
Histologic analysis of the allograft biopsy specimen is the standard method used to differentiate rejection from other injury in kidney transplants. Donor-derived cell-free DNA (dd-cfDNA) is a noninvasive test of allograft injury that may enable more frequent, quantitative, and safer assessment of allograft rejection and injury status. To investigate this possibility, we prospectively collected blood specimens at scheduled intervals and at the time of clinically indicated biopsies. In 102 kidney recipients, we measured plasma levels of dd-cfDNA and correlated the levels with allograft rejection status ascertained by histology in 107 biopsy specimens. The dd-cfDNA level discriminated between biopsy specimens showing any rejection (T cell–mediated rejection or antibody-mediated rejection [ABMR]) and controls (no rejection histologically), P <0.001 (receiver operating characteristic area under the curve [AUC], 0.74; 95% confidence interval [95% CI], 0.61 to 0.86). Positive and negative predictive values for active rejection at a cutoff of 1.0% dd-cfDNA were 61% and 84%, respectively. The AUC for discriminating ABMR from samples without ABMR was 0.87 (95% CI, 0.75 to 0.97). Positive and negative predictive values for ABMR at a cutoff of 1.0% dd-cfDNA were 44% and 96%, respectively. Median dd-cfDNA was 2.9% (ABMR), 1.2% (T cell–mediated types ≥IB), 0.2% (T cell–mediated type IA), and 0.3% in controls ( P =0.05 for T cell–mediated rejection types ≥IB versus controls). Thus, dd-cfDNA may be used to assess allograft rejection and injury; dd-cfDNA levels <1% reflect the absence of active rejection (T cell–mediated type ≥IB or ABMR) and levels >1% indicate a probability of active rejection.
0
Citation411
0
Save
0

A Risk Prediction Model for Delayed Graft Function in the Current Era of Deceased Donor Renal Transplantation

William Irish et al.Sep 27, 2010
Delayed graft function (DGF) impacts short‐ and long‐term outcomes. We present a model for predicting DGF after renal transplantation. A multivariable logistic regression analysis of 24 337 deceased donor renal transplant recipients (2003–2006) was performed. We developed a nomogram, depicting relative contribution of risk factors, and a novel web‐based calculator (http://www.transplantcalculator.com/DGF) as an easily accessible tool for predicting DGF. Risk factors in the modern era were compared with their relative impact in an earlier era (1995–1998). Although the impact of many risk factors remained similar over time, weight of immunological factors attenuated, while impact of donor renal function increased by 2‐fold. This may reflect advances in immunosuppression and increased utilization of kidneys from expanded criteria donors (ECDs) in the modern era. The most significant factors associated with DGF were cold ischemia time, donor creatinine, body mass index, donation after cardiac death and donor age. In addition to predicting DGF, the model predicted graft failure. A 25–50% probability of DGF was associated with a 50% increased risk of graft failure relative to a DGF risk <25%, whereas a >50% DGF risk was associated with a 2‐fold increased risk of graft failure. This tool is useful for predicting DGF and long‐term outcomes at the time of transplant. Delayed graft function (DGF) impacts short‐ and long‐term outcomes. We present a model for predicting DGF after renal transplantation. A multivariable logistic regression analysis of 24 337 deceased donor renal transplant recipients (2003–2006) was performed. We developed a nomogram, depicting relative contribution of risk factors, and a novel web‐based calculator (http://www.transplantcalculator.com/DGF) as an easily accessible tool for predicting DGF. Risk factors in the modern era were compared with their relative impact in an earlier era (1995–1998). Although the impact of many risk factors remained similar over time, weight of immunological factors attenuated, while impact of donor renal function increased by 2‐fold. This may reflect advances in immunosuppression and increased utilization of kidneys from expanded criteria donors (ECDs) in the modern era. The most significant factors associated with DGF were cold ischemia time, donor creatinine, body mass index, donation after cardiac death and donor age. In addition to predicting DGF, the model predicted graft failure. A 25–50% probability of DGF was associated with a 50% increased risk of graft failure relative to a DGF risk <25%, whereas a >50% DGF risk was associated with a 2‐fold increased risk of graft failure. This tool is useful for predicting DGF and long‐term outcomes at the time of transplant.
0

Prophylactic Versus Preemptive Oral Valganciclovir for the Management of Cytomegalovirus Infection in Adult Renal Transplant Recipients

Jad Khoury et al.Jun 19, 2006
Prophylaxis reduces cytomegalovirus (CMV) disease, but is associated with increased costs and risks for side effects, viral resistance and late onset CMV disease. Preemptive therapy avoids drug costs but requires frequent monitoring and may not prevent complications of asymptomatic CMV replication. Kidney transplant recipients at risk for CMV (D+/R-, D+/R+, D-/R+) were randomized to prophylaxis (valganciclovir 900 mg q.d. for 100 days, n = 49) or preemptive therapy (900 mg b.i.d. for 21 days, n = 49) for CMV DNAemia (CMV DNA level >2000 copies/mL in ≥ 1 whole blood specimens by quantitative PCR) assessed weekly for 16 weeks and at 5, 6, 9 and 12 months. More patients in the preemptive group, 29 (59%) than in the prophylaxis group, 14 (29%) developed CMV DNAemia, p = 0.004. Late onset of CMV DNAemia (>100 days after transplant) occurred in 11 (24%) randomized to prophylaxis, and none randomized to preemptive therapy. Symptomatic infection occurred in five patients, four (3 D+/R- and 1 D+/R+) in the prophylactic group and one (D+/R-) in the preemptive group. Peak CMV levels were highest in the D+/R- patients. Both strategies were effective in preventing symptomatic CMV. Overall costs were similar and insensitive to wide fluctuations in costs of either monitoring or drug. Prophylaxis reduces cytomegalovirus (CMV) disease, but is associated with increased costs and risks for side effects, viral resistance and late onset CMV disease. Preemptive therapy avoids drug costs but requires frequent monitoring and may not prevent complications of asymptomatic CMV replication. Kidney transplant recipients at risk for CMV (D+/R-, D+/R+, D-/R+) were randomized to prophylaxis (valganciclovir 900 mg q.d. for 100 days, n = 49) or preemptive therapy (900 mg b.i.d. for 21 days, n = 49) for CMV DNAemia (CMV DNA level >2000 copies/mL in ≥ 1 whole blood specimens by quantitative PCR) assessed weekly for 16 weeks and at 5, 6, 9 and 12 months. More patients in the preemptive group, 29 (59%) than in the prophylaxis group, 14 (29%) developed CMV DNAemia, p = 0.004. Late onset of CMV DNAemia (>100 days after transplant) occurred in 11 (24%) randomized to prophylaxis, and none randomized to preemptive therapy. Symptomatic infection occurred in five patients, four (3 D+/R- and 1 D+/R+) in the prophylactic group and one (D+/R-) in the preemptive group. Peak CMV levels were highest in the D+/R- patients. Both strategies were effective in preventing symptomatic CMV. Overall costs were similar and insensitive to wide fluctuations in costs of either monitoring or drug.
0
Citation324
0
Save
0

Subthreshold rejection activity in many kidney transplants currently classified as having no rejection

Philip Halloran et al.Aug 1, 2024
Most kidney transplant patients who undergo biopsies are classified as having no rejection based on consensus thresholds. However, we hypothesized that because these patients have normal adaptive immune systems, T cell-mediated rejection (TCMR) and antibody-mediated rejection (ABMR) may exist as subthreshold activity in some transplants currently classified as no rejection. To examine this question, we studied genome-wide microarray results from 5086 kidney transplant biopsies (4170 patients). An updated archetypal analysis designated 56% of biopsies as no rejection. Subthreshold molecular TCMR and/or ABMR activity molecular activity was detectable as elevated classifier scores in many biopsies classified as no rejection, with ABMR activity in many TCMR biopsies and TCMR activity in many ABMR biopsies. In biopsies classified as no rejection histologically and molecularly, molecular TCMR classifier scores correlated with increases in histologic TCMR features and molecular injury, lower eGFR, and higher risk of graft loss, and molecular ABMR activity correlated with increased glomerulitis and donor-specific antibody. No rejection biopsies with high subthreshold TCMR or ABMR activity had a higher probability of having TCMR or ABMR respectively diagnosed in a future biopsy. We conclude that many kidney transplant recipients have unrecognized subthreshold TCMR or ABMR activity, with significant implications for future problems.
Load More