XL
Xiaorong Li
Author with expertise in Genomic Landscape of Cancer and Mutational Signatures
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
13
(62% Open Access)
Cited by:
447
h-index:
49
/
i10-index:
257
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Lactate Inhibits Lipolysis in Fat Cells through Activation of an Orphan G-protein-coupled Receptor, GPR81

Changlu Liu et al.Dec 2, 2008
+10
S
J
C
Lactic acid is a well known metabolic by-product of intense exercise, particularly under anaerobic conditions. Lactate is also a key source of energy and an important metabolic substrate, and it has also been hypothesized to be a signaling molecule directing metabolic activity. Here we show that GPR81, an orphan G-protein-coupled receptor highly expressed in fat, is in fact a sensor for lactate. Lactate activates GPR81 in its physiological concentration range of 1–20 mm and suppresses lipolysis in mouse, rat, and human adipocytes as well as in differentiated 3T3-L1 cells. Adipocytes from GPR81-deficient mice lack an antilipolytic response to lactate but are responsive to other antilipolytic agents. Lactate specifically induces internalization of GPR81 after receptor activation. Site-directed mutagenesis of GPR81 coupled with homology modeling demonstrates that classically conserved key residues in the transmembrane binding domains are responsible for interacting with lactate. Our results indicate that lactate suppresses lipolysis in adipose tissue through a direct activation of GPR81. GPR81 may thus be an attractive target for the treatment of dyslipidemia and other metabolic disorders. Lactic acid is a well known metabolic by-product of intense exercise, particularly under anaerobic conditions. Lactate is also a key source of energy and an important metabolic substrate, and it has also been hypothesized to be a signaling molecule directing metabolic activity. Here we show that GPR81, an orphan G-protein-coupled receptor highly expressed in fat, is in fact a sensor for lactate. Lactate activates GPR81 in its physiological concentration range of 1–20 mm and suppresses lipolysis in mouse, rat, and human adipocytes as well as in differentiated 3T3-L1 cells. Adipocytes from GPR81-deficient mice lack an antilipolytic response to lactate but are responsive to other antilipolytic agents. Lactate specifically induces internalization of GPR81 after receptor activation. Site-directed mutagenesis of GPR81 coupled with homology modeling demonstrates that classically conserved key residues in the transmembrane binding domains are responsible for interacting with lactate. Our results indicate that lactate suppresses lipolysis in adipose tissue through a direct activation of GPR81. GPR81 may thus be an attractive target for the treatment of dyslipidemia and other metabolic disorders. GPR81 (1Lee D.K. Nguyen T. Lynch K.R. Cheng R. Vanti W.B. Arkhitko O. Lewis T. Evans J.F. George S.R. O'Dowd B.F. Gene (Amst.).. 2001; 275: 83-91Google Scholar) is an orphan G-protein-coupled receptor that is highly homologous to GPR109a and GPR109b. GPR109a and GPR109b were recently identified as receptors for niacin (also known as nicotinic acid) (2Tunaru S. Kero J. Schaub A. Wufka C. Blaukat A. Pfeffer K. Offermanns S. Nat. Med... 2003; 9: 352-355Google Scholar, 3Wise A. Foord S.M. Fraser N.J. Barnes A.A. Elshourbagy N. Eilert M. Ignar D.M. Murdock P.R. Steplewski K. Green A. Brown A.J. Dowell S.J. Szekeres P.G. Hassall D.G. Marshall F.H. Wilson S. Pike N.B. J. Biol. Chem... 2003; 278: 9869-9874Google Scholar) and subsequently characterized as receptors for the endogenous ketone body β-hydroxybutyrate (4Taggart A.K. Kero J. Gan X. Cai T.Q. Cheng K. Ippolito M. Ren N. Kaplan R. Wu K. Wu T.J. Jin L. Liaw C. Chen R. Richman J. Connolly D. Offermanns S. Wright S.D. Waters M.G. J. Biol. Chem... 2005; 280: 26649-26652Google Scholar). Niacin has been used clinically for a half-century as an effective treatment for dyslipidemia (5Garg A. Grundy S.M. J. Am. Med. Assoc... 1990; 264: 723-726Google Scholar); however, its utility is somewhat hampered by a target-related effect on dendritic Langerhans cells, which release prostaglandin D2 in response to GPR109a stimulation, resulting in a cutaneous flushing response (6Benyó Z. Gille A. Kero J. Csiky M. Suchánková M.C. Nüsing R.M. Moers A. Pfeffer K. Offermanns S. J. Clin. Invest... 2005; 115: 3634-3640Google Scholar, 7Benyó Z. Gille A. Bennett C.L. Clausen B.E. Offermanns S. Mol. Pharmacol... 2006; 70: 1844-1849Google Scholar, 8Cheng K. Wu T.J. Wu K.K. Sturino C. Metters K. Gottesdiener K. Wright S.D. Wang Z. O'Neill G. Lai E. Waters M.G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A... 2006; 103: 6682-6687Google Scholar). GPR81 is highly expressed in fat, similar to GPR109a, but is not expressed significantly in spleen; nor is it highly detected in any other tissue, and it has thus been hypothesized to be a potential target for the treatment of dyslipidemia that would be analogous to GPR109a/niacin but without the potential side effects (9Ge H. Weiszmann J. Reagan J.D. Gupte J. Baribault H. Gyuris T. Chen J.L. Tian H. Li Y. J. Lipid Res... 2008; 49: 797-803Google Scholar). In this report, we demonstrate the initial identification of the ligand activity for GPR81 from the rat tissue extracts, the purification of l-lactate from porcine brain as the source of the ligand activity, and the pharmacological characterization of l-lactate as a ligand for GPR81. In addition, we show that in its physiological concentration range, l-lactate effectively inhibits lipolysis in adipocytes from humans, mice, and rats. Adipocytes from GPR81-deficient mice lack responses to l-lactate, indicating that the antilipolytic effect of l-lactate is mediated by GPR81. Despite a long history of being considered as waste or a by-product of metabolism, l-lactate has maintained some attention as a potential signaling molecule (10Sola-Penna M. IUBMB Life.. 2008; 49: 797-803Google Scholar). As early as the 1960s, researchers have demonstrated significant effects of lactate on adipocytes (11Björntorp P. Acta Med. Scand... 1965; 178: 253-255Google Scholar); however, the mechanism by which this occurs has remained unknown. Our finding in this report provides a molecular basis for the ability of lactate to modulate lipolysis in adipocytes and establishes a new target opportunity for the treatment of dyslipidemia. Chemicals—All chemicals tested as ligands for GPR81 were purchased from Sigma. Identification of GPR81 Ligand Activity from Rat Tissues—Different rat tissues (5 g/tissue) were homogenized in cold (–30 °C) 80% ethanol at a tissue/solvent ratio of 1:8. The extracts were centrifuged at 10,000 × g for 30 min. The supernatants were collected, and volumes were reduced using a rotary evaporator at 30 °C. The remaining solution was centrifuged at 10,000 × g for 30 min at 4 °C. The supernatant was then passed through a C-18 Sep-pack column (Bond Elut; Varian), and the flow-through was collected and dried in a lyophilizer. The dried sample was reextracted with pure ethanol, and the supernatant was dried in a rotary evaporator, reconstituted in water, and tested for activation of GTPγS 4The abbreviations used are: GTPγS, guanosine 5′-3-O-(thio)triphosphate; PTX, pertussis toxin; PBS, phosphate-buffered saline; FFA, free fatty acid; ELISA, enzyme-linked immunosorbent assay; GPCR, G protein-coupled receptor; DCA, dichloroacetate; RT, reverse transcription; GHB, γ-hydroxybutyric acid; CHO, Chinese hamster ovary. incorporation, as described previously (12Liu C. Eriste E. Sutton S. Chen J. Roland B. Kuei C. Farmer N. Jörnvall H. Sillard R. Lovenberg T.W. J. Biol. Chem... 2003; 278: 50754-50764Google Scholar), in cell membranes expressing the recombinant human GPR81. Purification of GPR81 Ligand from Porcine Brain—To purify the GPR81 ligand from porcine brain, 200 g of frozen porcine brain (Pel-Freez Biologicals) were homogenized under similar conditions as the rat tissues. The extract was centrifuged, the supernatant was collected, and the volume was reduced on a Rotovap at 30 °C to about 200 ml. The sample was centrifuged at 10,000 × g for 30 min, and the supernatant was loaded onto a C-18 Sep-pack column from Varian. The flow-through was dried in a lyophilizer and dissolved in 2 ml of distilled water. The sample was adjusted to pH 3 with concentrated HCl before loading to a Restek AllureOA column (300 × 10 mm, 5 μm, 60 Å). Preparative HPLC was run on a Waters Alliance 2790 system (flow rate 4 ml/min; mobile phases: 1 mm HCl in water (A) and acetonitrile (B); gradient: 0–10 min, 100% A). Fractions were collected and neutralized with NaOH before being tested in a GTPγS binding assay to identify the active fraction. The active fraction was lyophilized and dissolved in 0.5 ml of D2O. The pH of the sample was adjusted to 8 with NaOH, and NMR data were acquired on a Bruker DRX600 spectrometer at 40 °C (1H, 13C APT, COSY, HSQC). NMR data were also obtained for a sample containing 15 mg of pure (l-)sodium lactate (purchased from Sigma) under the same conditions. Molecular Cloning and Recombinant Expression of GPR81 from Different Species—GPR81 genes from humans, mice, rats, dogs, pigs, cows, and monkeys were PCR-amplified using primers listed in supplemental Table 1 and respective genomic DNAs as the templates. The PCR products were then cloned in a mammalian expression vector pCIneo (Promega), and the insert regions were sequenced to confirm the sequence identities. The expression vectors were either transiently expressed in CHO-K1 cells or stably expressed in SK-N-MC/CRE-β-gal cells as described (13Liu C. Chen J. Kuei C. Sutton S. Nepomuceno D. Bonaventure P. Lovenberg T.W. Mol. Pharmacol... 2005; 67: 231-240Google Scholar). Measuring l-Lactate from Cell Culture Media and Tissue Extracts—3T3-L1 cells were differentiated in 24-well tissue culture plates for 15 days. The adipocytes were washed using lipolysis washing buffer (Zen-Bio, Inc.) and replaced with 500 μl of lipolysis assay buffer (Zen-Bio) plus additional glucose (25 mm) with or without 5 μm recombinant human insulin (Sigma). 3T3-L1 adipocytes were then incubated in a 37 °C cell culture incubator for 3 h, and lactate production was determined using a lactate assay kit (Eton Bioscience, San Diego, CA). To measure lactate contents in tissues, different rat tissues were extracted with cold 80% ethanol (tissue/solvent ratio 1:8) and centrifuged at 10,000 × g at 4 °C for 30 min. The supernatants were collected and diluted with water at different dilutions. The lactate contents were then assayed using the lactate assay kit (Eton Bioscience). Pharmacological Characterization of l-Lactate as the Ligand for GPR81—To characterize agonists for GPR81, CHO cells transiently expressing GPR81 from different species were tested using different compounds as agonists in a GTPγS binding assay. For cAMP accumulation studies, SK-N-MC/CRE-β-gal cells stably expressing human GPR81 were treated with various concentrations of l-lactate and then stimulated with forskolin. cAMP accumulation was measured as previously described (12Liu C. Eriste E. Sutton S. Chen J. Roland B. Kuei C. Farmer N. Jörnvall H. Sillard R. Lovenberg T.W. J. Biol. Chem... 2003; 278: 50754-50764Google Scholar). For pertussis toxin (PTX) treatment, cells transfected with GPR81 were treated with PTX (100 ng/ml) overnight before assaying the receptor activity. Receptor Internalization Studies—A V5 N-terminally tagged human GPR81 expression construct was constructed by adding a V5 tag (MGKPIPNPLLGLDST) coding region at the 5′ end of the human GPR81 coding region. The DNA construct was sequenced to confirm the sequence identity. The DNA construct was transfected into CHO cells. One day after transfection, the cells were cultured in low glucose medium (50% minimum essential medium Eagle plus 50% PBS and 1% bovine serum albumin) for 3 h and then incubated with anti-V5 antibody (Invitrogen) at a concentration of 2 μg/ml diluted in the low glucose medium (described above) for 20 min in a tissue culture incubator. To detect cell surface staining of V5-GPR81 on live cells, cells were washed 3 times and then incubated with Cy3-labeled goat anti-mouse IgG. To study lactate-induced GPR81 internalization, following the incubation with anti-V5 antibody, l-lactate (final concentration 25 mm) was added to stimulate the receptor internalization for 30 min. The cells were then either digested by trypsin (0.05% diluted in low glucose medium without BSA) or not for 5 min to remove the cell surface anti-V5 antibody and washed three times with PBS. Finally, the cells were fixed with paraformaldehyde and permeabilized with Triton X-100, and internalized anti-V5 antibody was visualized by staining with a Cy3-labeled goat anti-mouse IgG antibody and viewed under a fluorescent microscope. Western Blot Analysis of Erk Phosphorylation—SK-N-MC/CRE-β-gal cells stably expressing human GPR81 were treated with or without PTX (100 ng/ml) overnight. The cells were then treated either with or with out l-lactate (10 mm) for 5 min, and cell lysates were subjected to Western blot analysis using anti-phosphorylated Erk antibody (Santa Cruz Biotechnology, Inc., Santa Cruz, CA) to detect phosphorylated Erk levels. The membrane was then stripped and reblotted with anti-Erk antibody (Santa Cruz Biotechnology) for total Erk levels. SK-N-MC/CRE-β-gal cells without GPR81 were used as control. Mutagenesis Studies—Human GPR81 with a FLAG tag at the C terminus was used as the template for mutagenesis by a standard protocol. The mutant receptors were then recombinantly expressed and assayed for their responses to l-lactate in a GTPγS binding assay. All of the mutant GPR81 protein expression was verified by anti-FLAG staining. Generation of GPR81 Knock-out Mouse—GPR81-deficient mice were generated by Deltagen (San Mateo, CA). The transmembrane domain 2 of mouse GPR81 coding region (100 bp) is replaced by a 7-kb IRES-lacZ-neo cassette. Adipocyte Lipolysis Studies—3T3-L1 preadipocytes were grown in 24-well tissue culture plates and differentiated as described previously (14Lee G. Elwood F. McNally J. Weiszmann J. Lindstrom M. Amaral K. Nakamura M. Miao S. Cao P. Learned R.M. Chen J.L. Li Y. J. Biol. Chem... 2002; 277: 19649-19657Google Scholar) for 15 days. Human subcutaneous adipocytes grown and differentiated in vitro in 24-well tissue culture plates were purchased from Zen-Bio. Differentiated 3T3-L1 and human primary adipocytes were washed with lipolysis washing buffer (Zen-Bio) and incubated in lipolysis assay buffer (500 μl/well; Zen-Bio) at 37 °C in a tissue culture incubator. Three hours (3T3-L1 adipocytes) or 5 h (human primary adipocytes) after incubation, glycerol and free fatty acid (FFA) content in the assay buffer were determined using a free glycerol reagent (Sigma) or a fatty acid kit (Zen-Bio). To study lipolysis in the primary mature adipocytes, subcutaneous or epididymal fat tissues were dissected from Sprague-Dawley rats or mice with 129SvJ/C57Bl/6J background. The mature adipocytes were isolated, and lipolysis studies were performed as described previously (9Ge H. Weiszmann J. Reagan J.D. Gupte J. Baribault H. Gyuris T. Chen J.L. Tian H. Li Y. J. Lipid Res... 2008; 49: 797-803Google Scholar). Samples were taken hourly, and glycerol production and fatty acid release were determined using a free glycerol reagent (Sigma) or a fatty acid measuring kit (Zen-Bio). For human and rat adipocytes, isoproterenol was added to a final concentration of 0.5 μm to all samples to stimulate lipolysis. For 3T3-L1 adipocytes and mature adipocytes isolated from mice, lipolysis studies were performed without isoproterenol. Quantitative RT-PCR Analysis of mRNA Expression—PCR primers for the indicated genes (supplemental Table 2) were used to analyze specified mRNA expression using a method described previously (15Liu C. Kuei C. Sutton S. Chen J. Bonaventure P. Wu J. Nepomuceno D. Kamme F. Tran D. Zhu J. Wilkinson T. Bathgate R. Eriste E. Sillard R. Lovenberg T.W. J. Biol. Chem... 2005; 280: 292-300Google Scholar). cDNAs for human, rat, and mouse tissues that were used for GPR81 mRNA quantification were purchased from Clontech (Palo Alto, CA). cDNAs from differentiated or undifferentiated 3T3-L1 cells were made in house by a standard protocol. Detection of GPR81 Protein Expression in Mouse Tissues or Cells—A chicken antibody against mouse GPR81 (antibody MA) made against a C-terminal region of the mouse GPR81 (amino acid sequence DGANRSQRPSDGQW) was coated on an ELISA plate at a concentration of 1 μg/ml. The plate was blocked with blocking buffer (phosphate-buffered saline solution plus 0.1% Tween 20 (PBST) and 3% nonfat dry milk). Crude plasma membrane was prepared from different tissues from either wild type or GPR81-deficient mice or 3T3-L1 cells and solubilized with lysis buffer (50 mm Tris-HCl, 100 mm NaCl plus 1% Triton X-100). The lysates were centrifuged at 2000 × g at 4 °C for 5 min, and the clear supernatants were aliquoted into an MA antibody-coated ELISA plate in triplicates. The plate was then incubated at 4 °C overnight with shaking on a platform. The plate was washed with PBST three times and then incubated with a rabbit anti-mouse GPR81 antibody (antibody MB) against a different region of the C terminus of mouse GPR81 (amino acid sequence SLKPKRPGRTKTRRSEEMPISNLC), which was diluted into the blocking buffer at a final concentration of 1 μg/ml. The plates were incubated at room temperature for 2 h and washed with PBST followed by the incubation with a horseradish peroxidase-conjugated secondary antibody (goat anti-rabbit IgG) diluted (at a final concentration of 100 ng/ml) in blocking buffer for 2 h at room temperature. The plate was again washed with PBST and developed as described in standard ELISA protocols. Series dilutions of cell lysates from COS-7 cells expressing recombinant mouse GPR81 were included in the assay as the standards for the quantification of the relative expression levels of GPR81 from different tissues or cells. The final relative expression levels of GPR81 from different tissues were normalized by the tissue weights or the cells pellet weights for 3T3-L1 cells. Molecular Modeling—The primary sequence alignment between bovine rhodopsin 1HZX (Protein Data Bank code) and GPR81 was determined using the program ClustalW (16Higgins D. Thompson J.D. Higgins D.G. Gibson T.J. Nucleic Acids Res... 1994; 22: 4673-4680Google Scholar). The helical alignment was further examined and refined based on the multiple sequence alignment of family A GPCRs, as described elsewhere (17Mirzadegan T. Benko G. Filipek S. Palczewski K. Biochemistry.. 2003; 42: 2759-2767Google Scholar). The rhodopsin structure (1HZX) was used as a template, and based on the sequence alignment, the appropriate residues of the helices of the rhodopsin were changed to the corresponding amino acid of the GPR81 using the Insight I Homology tools (distributed by Accelrys Software Inc.). The amino acid side chains were energy-minimized and placed in a reasonable conformation. For this study, the loops were discarded, and only the transmembrane bundle was used to describe the putative small molecule-binding site. The final structure was minimized with a limited cycle using the Accelrys Discover software and CVFF force field. All of the nonbonded heavy atom clashes were removed by energy minimization of the final structure. A manual docking of the ligand was followed by further energy minimization of the complex. Identification and Purification of l-Lactate as a Ligand for GPR81—As an effort to identify the endogenous ligand(s) for orphan GPCR GPR81, we tested extracts from different rat tissues for ligand activity in GPR81-transfected cells. Surprisingly, the results showed that all tissue extracts produced apparent activity to stimulate [35S]GTPγS binding in GPR81-expressing cell membranes (Fig. 1A) but not in control cells (not shown), with the highest activities observed in tissue extracts of heart, pancreas, and brain. To purify the ligand for GPR81, porcine brain was extracted to provide substantially more material than was accessible via rat brain tissue. The majority of the porcine brain extract was lyophilized, redissolved in 1 mm HCl, and fractionated with a Restek AllureOA column. Iterative chromatography cycles resulted in a final separation and a single peak containing the active component (Fig. 1B). NMR structural analysis of the fraction with active component showed that both its 1H and 13C APT spectra are identical to that of l-lactate (Fig. 1C). The peak assignment is further supported by COSY and HSQC experiments (data not shown). The purity of the fraction was over 98% by both 1H and 13C NMR. Direct measurement of l-lactate contents in the tissue extracts shows that lactate content in the tissue extracts (supplemental Fig. 1) is consistent with the GPR81 ligand activities. Pharmacological Characterization of l-Lactate as a Ligand for GPR81—To confirm that l-lactate is indeed an agonist ligand for GPR81, commercial l-lactate at various concentrations was tested for activation of GPR81 using both GTPγS binding and direct inhibition of cAMP accumulation. The results show that l-lactate stimulates GTPγS binding with an EC50 value of about 5 mm (Fig. 2A and Table 1) in cells transfected with human GPR81 (but not in control cells or cells expressing the niacin receptors (GPR109a or GPR109b)) (Fig. 2A). In SK-N-MC/CRE-β-gal cells (a cell line harboring a β-galactosidase gene under the control of the cAMP-responsive element) stably expressing GPR81, l-lactate inhibits forskolin-induced cAMP accumulation (EC50 = 4.16 ± 0.53 mm), whereas it has no effect in control SK-N-MC/CRE-β-gal cells (Fig. 2B). Both the GTPγS binding and inhibition of cAMP accumulation suggest that GPR81 is coupled to Gi/o proteins. This hypothesis is supported by the observation that pertussis toxin inhibits l-lactate stimulated GTPγS binding (Fig. 2C) and Erk phosphorylation (Fig. 2D). Cells expressing GPR81 also showed higher basal Erk phosphorylation compared with control cells, and pertussis toxin treatment reduced the basal Erk phosphorylation (Fig. 2D). This may reflect either a constitutive level of activation of the receptor or an endogenous lactate tone within the cell/tissue, since essentially all cells produce l-lactate dependent upon metabolic conditions.TABLE 1GPR81 from different mammalian species and their EC50 values for l-lactateGPR81 from different speciesGenBank™ accession numberPercentage of homology/identity to human GPR81EC50 value for l-lactate%mmHumanEU809458100/1004.87 ± 0.64Mouse long formEU80945987/816.73 ± 0.73Mouse short formEU80946087/816.94 ± 0.84Rat long formEU80946188/816.26 ± 0.92Rat short formEU80946288/816.58 ± 0.81DogEU80946390/843.71 ± 0.47PigEU80946490/835.62 ± 0.68CowEU80946588/804.95 ± 0.42MonkeyEU80946697/954.05 ± 0.58 Open table in a new tab To investigate whether l-lactate stimulates the internalization of GPR81, we engineered a GPR81-expressing construct with a V5 tag fused to the N terminus of GPR81. V5-tagged-GPR81 responded appropriately to l-lactate stimulation as measured by GTPγS stimulation, and the dose-response curve was indistinguishable from the wild type receptor (supplemental Fig. 2). To detect the cell surface expression of V5-tagged GPR81, live cells were stained with anti-V5 antibody by diluting the antibodies into the cell culture medium. The results show that although no signal was detected in the control cells (Fig. 3A), clear cell surface staining of V5-GPR81 expression was detected from V5-GPR81-transfected cells (Fig. 3B). To measure receptor internalization, cells expressing V5-tagged GPR81 were first incubated with anti-V5 antibody, followed by l-lactate stimulation. The cells were then fixed and permeabilized, and the localizations of anti-V5 antibody-labeled receptors were detected with Cy3-labeled secondary antibody. The results show that l-lactate stimulates GPR81 redistribution in the cells. Compared with untreated cells (Fig. 3C), in l-lactate-treated cells, V5-GPR81 staining appeared at high intensity in intracellular organelles (Fig. 3D), indicating that l-lactate stimulates GPR81 internalization. Confirming this conclusion, in a parallel experiment, we treated the cells with trypsin following anti-V5 antibody incubation to remove the uninternalized antibody. The internalized anti-V5 antibody was then stained using a Cy3-labeled goat anti-mouse IgG antibody in the presence of permeabilization reagent. Our results show that although trypsin digestion reduces V5-GPR81 staining in cells without l-lactate treatment (Fig. 3E), the high intensity staining in l-lactate-treated cells appears in intracellular organelles and is resistant to trypsin digestion (Fig. 3F), indicating that they are internalized V5-GPR81. To investigate whether l-lactate can also activate GPR81 from different mammalian species, the mouse and rat GPR81 were cloned. Compared with the human GPR81, both mouse and rat GPR81 coding regions are longer at the 5′-end, encoding an additional 8 amino acids at the N terminus. However, the ATG site corresponding to the human GPR81 translation initiation is still conserved in the mouse and rat GPR81 cDNAs. Two clones for both mouse and rat GPR81 were cloned, respectively, with one clone starting with the first ATG site (designated GPR81L) and another clone using the second ATG site (corresponding to the ATG site in the human GPR81 translation initiation site, designated GPR81s). There was no observed difference between the pharmacology for the GPR81L and GPR81s clones (data not shown). Therefore, the GPR81L clones were used for all subsequent studies. We further cloned GPR81 from monkeys, dogs, pigs, and cows. Overall, GPR81 genes from different mammalian species are highly conserved (>80% sequence identity). The GenBank™ accession numbers for GPR81 genes from different species are listed in Table 1. Pharmacological characterization of recombinant GPR81 from different species demonstrated that they all respond to l-lactate through stimulation of GTPγS incorporation in membranes (Table 1), indicating conservation of the phenomenon in different species. We next tested a series of related acids as ligands for GPR81 (Table 2). Our results show that α-hydroxybutyrate, glycolate, α-hydroxyisobutyrate, and γ-hydroxybutyrate are also low affinity agonists for GPR81. In contrast, d-lactate, α-hydroxycaproic acid, malate, tartrate, and propionate are weak partial agonists for GPR81, whereas niacin, pyruvate, β-hydroxybutyrate, acetate, γ-aminobutyric acid, and butyrate are not active (Table 2). l-Lactate was unable to activate either GPR109a or GPR109b (Fig. 2A). In addition, we found that dichloroacetate (DCA) and trifluoroacetate were capable of activating GPR81 (Table 2), albeit as partial agonists.TABLE 2EC50 values and Emax of compounds tested as ligands for human GPR81CompoundsEC50 for GPR81Emaxmm% of l-lactatel-Lactate4.87 ± 0.64100GHB15.3 ± 2.14110dl-α-Hydroxybutyrate8.51 ± 1.5192Glycolate9.64 ± 1.3585Trifluoroacetate5.41 ± 0.6862α-Hydroxyisobutyrate7.83 ± 1.4357DCA3.54 ± 0.5735dl-α-Hydroxycaproic acid> 2045aAgonistic activities have been observed for those compounds, but the EC50 values for those compounds are not calculated, because the dose-response curves for those compounds did not reach plateaus. The highest responses stimulated by those ligands (up to 50 mm) are shown as the percentage of the maximum response stimulated by l-lactate.Malate> 2035aAgonistic activities have been observed for those compounds, but the EC50 values for those compounds are not calculated, because the dose-response curves for those compounds did not reach plateaus. The highest responses stimulated by those ligands (up to 50 mm) are shown as the percentage of the maximum response stimulated by l-lactate.Tartrate> 2027aAgonistic activities have been observed for those compounds, but the EC50 values for those compounds are not calculated, because the dose-response curves for those compounds did not reach plateaus. The highest responses stimulated by those ligands (up to 50 mm) are shown as the percentage of the maximum response stimulated by l-lactate.d-Lactate> 2020aAgonistic activities have been observed for those compounds, but the EC50 values for those compounds are not calculated, because the dose-response curves for those compounds did not reach plateaus. The highest responses stimulated by those ligands (up to 50 mm) are shown as the percentage of the maximum response stimulated by l-lactate.Propionate> 2015aAgonistic activities have been observed for those compounds, but the EC50 values for those compounds are not calculated, because the dose-response curves for those compounds did not reach plateaus. The highest responses stimulated by those ligands (up to 50 mm) are shown as the percentage of the maximum response stimulated by l-lactate.FormiateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDcND, not determined.AcetateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDPyruvateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDCitrateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDButyrateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDdl-β-HydroxybutyrateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds (except niacin) when tested at concentrations up to 50 mm. Niacin was tested with the highest concentration of 10 mm.NDSuccinateNAbNA, no activity. No agonistic activity was observed for these compounds
1

Sparse Modeling of Genomic Landscape Identifies Pathogenic Processes and Therapeutic Targets in Metastatic Breast Cancer

Mingliang Pu et al.Aug 31, 2023
+6
F
L
M
ABSTRACT Breast cancer is a heterogeneous disease and ranks as one of the most lethal and frequently detected disease in the world. It poses significant challenges for precision therapy. To better decipher the patterns of heterogeneous nature in human genome and converge them into common functionals, mutational signatures are introduced to define the types of DNA damage, repair and replicative mechanisms that shape the genomic landscape of each cancer patient. In this study, we developed a deep learning (DL) model, MetaWise 2.0, based on pruning technology that improved model generalization with deep sparsity. We applied it to patient samples from multiple sequencing studies, and identified statistically significant mutational signatures associated with metastatic progression using Shapley additive explanations (SHAP). We also employed gene cumulative contribution abundance analysis to link the mutational signatures with relevant genes, which could unearth the shared molecular mechanisms behind tumorigenesis and metastasis of each patient and lead to novel therapeutic target identification. Our study illustrates that MetaWise 2.0 is an effective DL tool for discovering clinically meaningful mutational signatures in metastatic breast cancer (MBC) and relating them directly to relevant biological functions and gene targets. These findings could facilitate the development of novel therapeutic strategies and improve the clinical outcomes for individual patients.
0

Copper-ion-complexed palygorskite as a novel nanozyme with enhanced peroxidase-like activity for sensitive colorimetric sensing

Ping Chen et al.Sep 1, 2024
+6
X
H
P
0

The socioeconomic burden of severe mental disorder in China, 2014-2017: a prevalence study

Mengxue Xie et al.Dec 6, 2019
+4
J
K
M
Mental illness is a chronic disease with high morbidity and mortality rate, resulting in heavy economic burden for family and society, especially the severe ones. Chinese government has taken a series of action on the treatment and management of severe mental disorder (SMD), but the scale of economic burden caused by SMD was still unclear. In this paper, we applied prevalence-based bottom-up approach to estimate the direct and indirect economic burden of SMD in Southwest China from 2014 to 2017. We used the sampled inpatient medical record data of patient with SMD to calculate the total direct cost and estimated the indirect economic burden using human capital approach.The total ecomonic burden of SMD was USD9,733 million and direct burden was contiributed for 7.5% as USD734.5 million in four years total. The growth rate of direct medical cost was declined due to the health policy reform and total cost control policy. The indirect cost was rapidly increased in four years when estimated with DALYs reported in GBD2010 and resulting USD8,998.6 million. We next estimated the indirect burden using sample DALYs and occupation wage cost approach as sensitive analysis. We found that the indirect burden was sensitive to the key variable and the estimation approach, but the estimates share same increasing trend but with different velocity. Our study suggests that SMD in China have posed substantial economic burden at individual and social levels, with the appropriate estimation of total economic burden, our reaserch would attract more attention and be helpful for health resources distribution.
0

Hemiprotonic ph-ph+ with two targets inhibits metastatic breast cancer and concurrent candidiasis

Jingli Li et al.Jun 26, 2024
+5
D
Z
J
Concurrent infection in breast cancer patients is the direct cause of the high mortality rate of the disease. However, there is no available method to increase the survival rate until now. To address the problem, we propose one drug with two target strategy to treat the refractory disease. A small chemical, ph-ph+, was attempted to be used in the study to explore the feasibility of the approach in anticancer and antifungus at the same time. The results showed that ph-ph+ could prevent the proliferation and metastasis of breast cancer cells, and kill C. albicans simultaneously. The molecular mechanism was associated with the activation of an evolutionarily conserved protease CLpP in the cancer and C. albicans cells. Also, the signaling pathway mediated by PLAGL2 that highly expressed in cancer cells participated in preventing cell metastasis and inducing apoptosis of ph-ph+. The one drug with dual targets inhibited the growth and metastasis of the cancer cells, and meanwhile eliminated C. albicans in tissues in the experimental animals. The results suggested that ph-ph+ with dual targets of CLpP and PLAGL2 would be a feasible approach to prolong the survival rate in patients with metastatic breast cancer and pathogenic infection.
0

Liposome‐Based Permeable Eyedrops for Effective Posterior Segment Drug Delivery

Yi Dong et al.Jun 12, 2024
+5
J
Y
Y
Abstract Topical eyedrop administration is identified as an ideal non‐invasive strategy for ocular drug delivery. However, multiple complex ocular barriers greatly restrict their effectiveness in the treatment of posterior ocular disease. Herein, a liposome‐based permeable eyedrops (pDrops) capable of overcoming multiple ocular barriers and achieving efficient posterior drug delivery is presented. pDrops have a core‐shell structure in which drugs are encapsulated inside the liposome core with a chitosan shell. This chitosan coating significantly enhances the pDrops’ binding to mucin in tears and facilitates the temporary opening of tight junctions in cornea/conjunctive epithelial cells, thereby achieving prolonged preocular retention and enhanced posterior segment drug delivery. In this study, hydrophilic ganciclovir (GCV) and hydrophobic curcumin (CUR) are employed as model drugs. Upon topical instillation, pDrops effectively overcome ocular barriers and delivered GCV to the posterior segment in both rat and rabbit eyes. Notably, CUR delivery by pDrops demonstrates significantly enhanced therapeutic efficacy in light‐damaged retina of mice. Considering that pDrops can deliver both hydrophobic and hydrophilic drugs to the posterior segment of the eye, it can potentially become a feasible platform for the non‐invasive delivery of various drug molecules and improve the treatment efficiency of posterior ocular diseases.
0

Multiomic Screening Unravels the Immunometabolic Signatures and Drug Targets of Age-Related Macular Degeneration

Xu Chen et al.May 10, 2024
+5
Q
X
X
Abstract Age-related macular degeneration (AMD) is a significant cause of visual impairment in the aging population, with the pathophysiology driven by a complex interplay of genetics, environmental influences and immunometabolic factors. These immunometabolic mechanisms, in particular, those distinguishing between the dry and wet forms of AMD, remain incompletely understood. Utilizing an integrated multiomic approach, incorporating Mendelian Randomization (MR) and single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), we have effectively delineated distinct immunometabolic pathways implicated in the development of AMD. Our comprehensive analysis indicates that the androgen-IL10RA-CD16+ monocyte axis could protect against wet AMD. We have also identified several immune and metabolic signatures unique to each AMD subtype, with TNFα and Notch signaling pathways being central to disease progression. Furthermore, our analysis, leveraging expression Quantitative Trait Loci (eQTLs) from the Genotype-Tissue Expression (GTEx) project coupled with MR, have highlighted genes such as MTOR , PLA2G7 , MAPKAPK3 , ANGPTL1 , and ARNT as prospective therapeutic targets. The therapeutic potential of these candidate genes was validated with observations from existing drug trial databases. Our robust genetic and transcriptomic approach has identified promising directions for novel AMD interventions, emphasizing the significance of an integrated multiomic approach in tackling this important cause of visual impairment.
1

Deep Learning model accurately classifies metastatic tumors from primary tumors based on mutational signatures

Weisheng Zheng et al.Oct 3, 2022
+5
M
J
W
Abstract Metastatic propagation is the leading cause of death for most cancers. Prediction and elucidation of metastatic process is crucial for the therapeutic treatment of cancers. Even though somatic mutations have been directly linked to tumorigenesis and metastasis, it is less explored whether the metastatic events can be identified through genomic mutation signatures, a concise representation of the mutational processes. Here, applying mutation signatures as input features calculated from Whole-Exome Sequencing (WES) data of TCGA and other metastatic cohorts, we developed MetaWise, a Deep Neural Network (DNN) model. This model accurately classified metastatic tumors from primary tumors. Signatures of non-coding mutations also have a major impact on the model performance. SHapley Additive exPlanations (SHAP) and Local Surrogate (LIME) analysis into the MetaWise model identified several mutational signatures directly correlated to metastatic spread in cancers, including APOBEC-mutagenesis, UV-induced signatures and DNA damage response deficiency signatures.
0

Enhancing bone regeneration and immunomodulation via gelatin methacryloyl hydrogel-encapsulated exosomes from osteogenic pre-differentiated mesenchymal stem cells

Xiaorong Li et al.May 29, 2024
+4
J
Y
X
Mesenchymal stem cell-derived exosomes (MSC-Exos) have emerged as promising candidates for cell-free therapy in tissue regeneration. However, the native osteogenic and angiogenic capacities of MSC-Exos are often insufficient to repair critical-sized bone defects, and the underlying immune mechanisms remain elusive. Furthermore, achieving sustained delivery and stable activity of MSC-Exos at the defect site is essential for optimal therapeutic outcomes. Here, we extracted exosomes from osteogenically pre-differentiated human bone marrow mesenchymal stem cells (hBMSCs) by ultracentrifugation and encapsulated them in gelatin methacryloyl (GelMA) hydrogel to construct a composite scaffold. The resulting exosome-encapsulated hydrogel exhibited excellent mechanical properties and biocompatibility, facilitating sustained delivery of MSC-Exos. Osteogenic pre-differentiation significantly enhanced the osteogenic and angiogenic properties of MSC-Exos, promoting osteogenic differentiation of hBMSCs and angiogenesis of human umbilical vein endothelial cells (HUVECs). Furthermore, MSC-Exos induced polarization of Raw264.7 cells from a pro-inflammatory phenotype to an anti-inflammatory phenotype under simulated inflammatory conditions, thereby creating an immune microenvironment conducive to osteogenesis. RNA sequencing and bioinformatics analysis revealed that MSC-Exos activate the p53 pathway through targeted delivery of internal microRNAs and regulate macrophage polarization by reducing DNA oxidative damage. Our study highlights the potential of osteogenic exosome-encapsulated composite hydrogels for the development of cell-free scaffolds in bone tissue engineering.
0

A Dataset for Constructing the Network Pharmacology of Overactive Bladder and Its Application to Reveal the Potential Therapeutic Targets of Rhynchophylline

Tie Yan et al.Sep 24, 2024
+7
Y
J
T
Objectives: Network pharmacology is essential for understanding the multi-target and multi-pathway therapeutic mechanisms of traditional Chinese medicine. This study aims to evaluate the influence of database quality on target identification and to explore the therapeutic potential of rhynchophylline (Rhy) in treating overactive bladder (OAB). Methods: An OAB dataset was constructed through extensive literature screening. Using this dataset, we applied network pharmacology to predict potential targets for Rhy, which is known for its therapeutic effects but lacks a well-defined target profile. Predicted targets were validated through in vitro experiments, including DARTS and CETSA. Results: Our analysis identified Rhy as a potential modulator of the M3 receptor and TRPM8 channel in the treatment of OAB. Validation experiments confirmed the interaction between Rhy and these targets. Additionally, the GeneCards database predicted other targets that are not directly linked to OAB, corroborated by the literature. Conclusions: We established a more accurate and comprehensive dataset of OAB targets, enhancing the reliability of target identification for drug treatments. This study underscores the importance of database quality in network pharmacology and contributes to the potential therapeutic strategies for OAB.
Load More