AP
Ashwathy Pillai
Author with expertise in Pancreatic Cancer Research and Treatment
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(25% Open Access)
Cited by:
547
h-index:
3
/
i10-index:
3
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

COVID-19 prevalence and mortality in patients with cancer and the effect of primary tumour subtype and patient demographics: a prospective cohort study

Lee L et al.Aug 24, 2020
BackgroundPatients with cancer are purported to have poor COVID-19 outcomes. However, cancer is a heterogeneous group of diseases, encompassing a spectrum of tumour subtypes. The aim of this study was to investigate COVID-19 risk according to tumour subtype and patient demographics in patients with cancer in the UK.MethodsWe compared adult patients with cancer enrolled in the UK Coronavirus Cancer Monitoring Project (UKCCMP) cohort between March 18 and May 8, 2020, with a parallel non-COVID-19 UK cancer control population from the UK Office for National Statistics (2017 data). The primary outcome of the study was the effect of primary tumour subtype, age, and sex and on severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) prevalence and the case–fatality rate during hospital admission. We analysed the effect of tumour subtype and patient demographics (age and sex) on prevalence and mortality from COVID-19 using univariable and multivariable models.Findings319 (30·6%) of 1044 patients in the UKCCMP cohort died, 295 (92·5%) of whom had a cause of death recorded as due to COVID-19. The all-cause case–fatality rate in patients with cancer after SARS-CoV-2 infection was significantly associated with increasing age, rising from 0·10 in patients aged 40–49 years to 0·48 in those aged 80 years and older. Patients with haematological malignancies (leukaemia, lymphoma, and myeloma) had a more severe COVID-19 trajectory compared with patients with solid organ tumours (odds ratio [OR] 1·57, 95% CI 1·15–2·15; p<0·0043). Compared with the rest of the UKCCMP cohort, patients with leukaemia showed a significantly increased case–fatality rate (2·25, 1·13–4·57; p=0·023). After correction for age and sex, patients with haematological malignancies who had recent chemotherapy had an increased risk of death during COVID-19-associated hospital admission (OR 2·09, 95% CI 1·09–4·08; p=0·028).InterpretationPatients with cancer with different tumour types have differing susceptibility to SARS-CoV-2 infection and COVID-19 phenotypes. We generated individualised risk tables for patients with cancer, considering age, sex, and tumour subtype. Our results could be useful to assist physicians in informed risk–benefit discussions to explain COVID-19 risk and enable an evidenced-based approach to national social isolation policies.FundingUniversity of Birmingham and University of Oxford.
0
Citation547
0
Save
0

Clinical utility and outcomes associated with mutations detection in liquid biopsy for patients with pancreatic ductal adenocarcinoma: Real-world data evidence from a single institution.

Mahmoud Yousef et al.Jun 1, 2024
4158 Background: The clinical utility of liquid biopsy in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) and its association with clinical outcome remains understudied. We investigated the detection rate and association of mutations with overall survival (OS) in patients with PDAC who had liquid biopsy. Methods: The Foundry software platform was used to extract clinical information and disease outcomes for patients with PDAC who underwent our in-house tumor non-informed liquid biopsy, the panel detects somatic mutations in 70 genes, copy number gains in 19 genes and gene fusions in 6 genes in circulating cell free DNA isolated from plasma. Results: Liquid biopsy was performed for 311 patients with PDAC from 2018 to 2023 with median follow-up time of 25 months, and median OS of 24 months (95%CI=21-29). 73% (N=229) of patients had metastatic disease at time of liquid biopsy. Among patients with metastatic disease at liquid biopsy, 81.2% (N=186) tested positive, but only 52.4% (N= 43) tested positive in localized disease. KRAS mutation was detected in 68% (N=148) of patients with metastatic disease, while only in 16% (N=13) for localized disease. Any mutation detection was associated with worse OS (HR=2, 95%CI=1.2-3.2, P=0.009) in metastatic disease. However, in localized disease the difference was not significant (HR=1.3, 95%CI=0.67-2.6, P=0.43). In addition, KRAS detection in metastatic disease compared to other mutations was associated with worse OS (median 16 vs 31 months, HR=2.3, 95%CI=1.4-3.8, P=0.001). The most frequent KRAS mutation detected was G12D (N=66, 40.7% of KRAS mutations) followed by G12V (N=58, 35.8%), G12R (N=15, 9.3%), and Q61 mutations (N=10, 6.2%). G12D and Q61 mutations detection was associated with worse OS (median 13 and 10 months respectively, overall P<0.001). The most frequently co-occurring mutations detected with KRAS were TP53 (N=126, 77.8%), CDKN2A (N=34, 21%), SMAD4 (N=33, 20.4%), and ARID1A (N=12, 7.4%). Among 122 and 107 patients tested for KRAS and TP53 in solid biopsy respectively, concordance rate for positive mutations in patients treated for metastatic disease was 61% and 68%, while 7% and 33% for localized disease respectively. Furthermore, among 40 Patients who underwent serial liquid biopsy testing; 25% tested positive after a negative result with disease progression, but none of the patients with positive tests converted to negative (N=22) after chemotherapy. Conclusions: Detection of any mutation in liquid biopsy was associated with worse OS in patients with metastatic PDAC. Moreover, KRASmutation detection especially G12D or Q61, is associated with worse OS compared to other mutations. Repeating liquid biopsy for patients with initial negative result at disease progression might be beneficial. These data highlight the utility and importance of liquid biopsy in patients with PDAC.