BF
Brendan Flannery
Author with expertise in Epidemiology and Pathogenesis of Respiratory Viral Infections
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
16
(94% Open Access)
Cited by:
3,386
h-index:
58
/
i10-index:
156
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Incidence of Pneumococcal Disease Due to Non–Pneumococcal Conjugate Vaccine (PCV7) Serotypes in the United States during the Era of Widespread PCV7 Vaccination, 1998–2004

Lauri Hicks et al.Oct 19, 2007
Widespread use of pneumococcal conjugate vaccine (PCV7) resulted in decreases in invasive disease among children and elderly persons. The benefits may be offset by increases in disease due to serotypes not included in the vaccine (hereafter, "nonvaccine serotypes"). We evaluated the effect of PCV7 on incidence of disease due to nonvaccine serotypes.Cases of invasive disease were identified in 8 geographic areas through the Centers for Disease Control and Prevention's Active Bacterial Core surveillance. Serotyping and susceptibility testing of isolates were performed. We calculated the incidence of disease for children aged <5 years and adults aged > or =65 years. We compared rates of serotype-specific disease before and after PCV7 was licensed for use.The annual incidence of disease due to nonvaccine serotypes increased from an average of 16.3 cases/100,000 population during prevaccine years (1998-1999) to 19.9 cases/100,000 population in 2004 for children aged <5 years (P=.01) and from 27.0 cases/100,000 population during prevaccine years to 29.8 cases/100,000 population in 2004 for adults aged > or =65 years (P=.05). Significant increases in the incidences of disease due to serotypes 3, 15, 19A, 22F, and 33F were observed among children during this period (P<.05 for each serotype); serotype 19A has become the predominant cause of invasive disease in children. The incidence of disease due to these serotypes also increased among elderly persons.The incidence of pneumococcal disease caused by nonvaccine serotypes is increasing. Ongoing surveillance is needed to monitor the magnitude of disease caused by nonvaccine serotypes, to ensure that future vaccines target the appropriate serotypes.
0

Influenza Activity — United States, 2015–16 Season and Composition of the 2016–17 Influenza Vaccine

Stacy Davlin et al.Jun 9, 2016
During the 2015-16 influenza season (October 4, 2015-May 21, 2016) in the United States, influenza activity* was lower and peaked later compared with the previous three seasons (2012-13, 2013-14, and 2014-15). Activity remained low from October 2015 until late December 2015 and peaked in mid-March 2016. During the most recent 18 influenza seasons (including this season), only two other seasons have peaked in March (2011-12 and 2005-06). Overall influenza activity was moderate this season, with a lower percentage of outpatient visits for influenza-like illness (ILI),(†) lower hospitalization rates, and a lower percentage of deaths attributed to pneumonia and influenza (P&I) compared with the preceding three seasons. Influenza A(H1N1)pdm09 viruses predominated overall, but influenza A(H3N2) viruses were more commonly identified from October to early December, and influenza B viruses were more commonly identified from mid-April through mid-May. The majority of viruses characterized this season were antigenically similar to the reference viruses representing the recommended components of the 2015-16 Northern Hemisphere influenza vaccine (1). This report summarizes influenza activity in the United States during the 2015-16 influenza season (October 4, 2015-May 21, 2016)(§) and reports the vaccine virus components recommended for the 2016-17 Northern Hemisphere influenza vaccines.
0
Citation317
0
Save
0

Annual estimates of the burden of seasonal influenza in the United States: A tool for strengthening influenza surveillance and preparedness

Melissa Rolfes et al.Jan 1, 2018
Background Estimates of influenza disease burden are broadly useful for public health, helping national and local authorities monitor epidemiologic trends, plan and allocate resources, and promote influenza vaccination. Historically, estimates of the burden of seasonal influenza in the United States, focused mainly on influenza‐related mortality and hospitalization, were generated every few years. Since the 2010‐2011 influenza season, annual US influenza burden estimates have been generated and expanded to include estimates of influenza‐related outpatient medical visits and symptomatic illness in the community. Methods We used routinely collected surveillance data, outbreak field investigations, and proportions of people seeking health care from survey results to estimate the number of illnesses, medical visits, hospitalizations, and deaths due to influenza during six influenza seasons (2010‐2011 through 2015‐2016). Results We estimate that the number of influenza‐related illnesses that have occurred during influenza season has ranged from 9.2 million to 35.6 million, including 140 000 to 710 000 influenza‐related hospitalizations. Discussion These annual efforts have strengthened public health communications products and supported timely assessment of the impact of vaccination through estimates of illness and hospitalizations averted. Additionally, annual estimates of influenza burden have highlighted areas where disease surveillance needs improvement to better support public health decision making for seasonal influenza epidemics as well as future pandemics.
0

Effects of Influenza Vaccination in the United States During the 2017–2018 Influenza Season

Melissa Rolfes et al.Jan 23, 2019
Abstract Background The severity of the 2017–2018 influenza season in the United States was high, with influenza A(H3N2) viruses predominating. Here, we report influenza vaccine effectiveness (VE) and estimate the number of vaccine-prevented influenza-associated illnesses, medical visits, hospitalizations, and deaths for the 2017–2018 influenza season. Methods We used national age-specific estimates of 2017–2018 influenza vaccine coverage and disease burden. We estimated VE against medically attended reverse-transcription polymerase chain reaction–confirmed influenza virus infection in the ambulatory setting using a test-negative design. We used a compartmental model to estimate numbers of influenza-associated outcomes prevented by vaccination. Results The VE against outpatient, medically attended, laboratory-confirmed influenza was 38% (95% confidence interval [CI], 31%–43%), including 22% (95% CI, 12%–31%) against influenza A(H3N2), 62% (95% CI, 50%–71%) against influenza A(H1N1)pdm09, and 50% (95% CI, 41%–57%) against influenza B. We estimated that influenza vaccination prevented 7.1 million (95% CrI, 5.4 million–9.3 million) illnesses, 3.7 million (95% CrI, 2.8 million–4.9 million) medical visits, 109 000 (95% CrI, 39 000–231 000) hospitalizations, and 8000 (95% credible interval [CrI], 1100–21 000) deaths. Vaccination prevented 10% of expected hospitalizations overall and 41% among young children (6 months–4 years). Conclusions Despite 38% VE, influenza vaccination reduced a substantial burden of influenza-associated illness, medical visits, hospitalizations, and deaths in the United States during the 2017–2018 season. Our results demonstrate the benefit of current influenza vaccination and the need for improved vaccines.
0

2014–2015 Influenza Vaccine Effectiveness in the United States by Vaccine Type

Richard Zimmerman et al.Oct 4, 2016
Circulating A/H3N2 influenza viruses drifted significantly after strain selection for the 2014-2015 vaccines. Also in 2014-2015, the Advisory Committee on Immunization Practices recommended preferential use of live attenuated influenza vaccine (LAIV) over inactivated influenza vaccine (IIV) among children aged 2-8 years. Vaccine effectiveness (VE) across age groups and vaccine types was examined among outpatients with acute respiratory illness at 5 US sites using a test-negative design, that compared the odds of vaccination among reverse transcription polymerase chain reaction-confirmed influenza positives and negatives. Of 9311 enrollees with complete data, 7078 (76%) were influenza negative, 1840 (19.8%) were positive for influenza A (A/H3N2, n = 1817), and 395 (4.2%) were positive for influenza B (B/Yamagata, n = 340). The overall adjusted VE was 19% (95% confidence interval [CI], 10% to 27%) and was statistically significant in all age strata except those aged 18-64 years. The adjusted VE of 6% (95%CI, -5% to 17%) against A/H3N2-associated illness was not statistically significant, unlike VE for influenza B/Yamagata, which was 55% (95%CI, 43% to 65%). Among those aged 2-8 years, VE against A/H3N2 was 15% (95%CI, -16% to 38%) for IIV and -3% (CI, -50% to 29%) for LAIV; VE against B/Yamagata was 40% (95%CI, -20% to 70%) for IIV and 74% (95%CI, 25% to 91%) for LAIV. The 2014-2015 influenza vaccines offered little protection against the predominant influenza A/H3N2 virus but were effective against influenza B. Preferential use of LAIV among young children was not supported.
0

Decline in Diarrhea Mortality and Admissions after Routine Childhood Rotavirus Immunization in Brazil: A Time-Series Analysis

Greice Carmo et al.Apr 19, 2011
In 2006, Brazil began routine immunization of infants <15 wk of age with a single-strain rotavirus vaccine. We evaluated whether the rotavirus vaccination program was associated with declines in childhood diarrhea deaths and hospital admissions by monitoring disease trends before and after vaccine introduction in all five regions of Brazil with varying disease burden and distinct socioeconomic and health indicators.National data were analyzed with an interrupted time-series analysis that used diarrhea-related mortality or hospitalization rates as the main outcomes. Monthly mortality and admission rates estimated for the years after rotavirus vaccination (2007-2009) were compared with expected rates calculated from pre-vaccine years (2002-2005), adjusting for secular and seasonal trends. During the three years following rotavirus vaccination in Brazil, rates for diarrhea-related mortality and admissions among children <5 y of age were 22% (95% confidence interval 6%-44%) and 17% (95% confidence interval 5%-27%) lower than expected, respectively. A cumulative total of ~1,500 fewer diarrhea deaths and 130,000 fewer admissions were observed among children <5 y during the three years after rotavirus vaccination. The largest reductions in deaths (22%-28%) and admissions (21%-25%) were among children younger than 2 y, who had the highest rates of vaccination. In contrast, lower reductions in deaths (4%) and admissions (7%) were noted among children two years of age and older, who were not age-eligible for vaccination during the study period.After the introduction of rotavirus vaccination for infants, significant declines for three full years were observed in under-5-y diarrhea-related mortality and hospital admissions for diarrhea in Brazil. The largest reductions in diarrhea-related mortality and hospital admissions for diarrhea were among children younger than 2 y, who were eligible for vaccination as infants, which suggests that the reduced diarrhea burden in this age group was associated with introduction of the rotavirus vaccine. These real-world data are consistent with evidence obtained from clinical trials and strengthen the evidence base for the introduction of rotavirus vaccination as an effective measure for controlling severe and fatal childhood diarrhea.
0
Citation253
0
Save
0

Community and Close Contact Exposures Associated with COVID-19 Among Symptomatic Adults ≥18 Years in 11 Outpatient Health Care Facilities — United States, July 2020

Kiva Fisher et al.Sep 10, 2020
Community and close contact exposures continue to drive the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. CDC and other public health authorities recommend community mitigation strategies to reduce transmission of SARS-CoV-2, the virus that causes COVID-19 (1,2). Characterization of community exposures can be difficult to assess when widespread transmission is occurring, especially from asymptomatic persons within inherently interconnected communities. Potential exposures, such as close contact with a person with confirmed COVID-19, have primarily been assessed among COVID-19 cases, without a non-COVID-19 comparison group (3,4). To assess community and close contact exposures associated with COVID-19, exposures reported by case-patients (154) were compared with exposures reported by control-participants (160). Case-patients were symptomatic adults (persons aged ≥18 years) with SARS-CoV-2 infection confirmed by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) testing. Control-participants were symptomatic outpatient adults from the same health care facilities who had negative SARS-CoV-2 test results. Close contact with a person with known COVID-19 was more commonly reported among case-patients (42%) than among control-participants (14%). Case-patients were more likely to have reported dining at a restaurant (any area designated by the restaurant, including indoor, patio, and outdoor seating) in the 2 weeks preceding illness onset than were control-participants (adjusted odds ratio [aOR] = 2.4; 95% confidence interval [CI] = 1.5-3.8). Restricting the analysis to participants without known close contact with a person with confirmed COVID-19, case-patients were more likely to report dining at a restaurant (aOR = 2.8, 95% CI = 1.9-4.3) or going to a bar/coffee shop (aOR = 3.9, 95% CI = 1.5-10.1) than were control-participants. Exposures and activities where mask use and social distancing are difficult to maintain, including going to places that offer on-site eating or drinking, might be important risk factors for acquiring COVID-19. As communities reopen, efforts to reduce possible exposures at locations that offer on-site eating and drinking options should be considered to protect customers, employees, and communities.
Load More