RW
Robert Walker
Author with expertise in Human Immunodeficiency Virus/Acquired Immunodeficiency Syndrome
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
10
(70% Open Access)
Cited by:
4,477
h-index:
58
/
i10-index:
117
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

HIV-1 and T cell dynamics after interruption of highly active antiretroviral therapy (HAART) in patients with a history of sustained viral suppression

Richard Davey et al.Dec 21, 1999
Identifying the immunologic and virologic consequences of discontinuing antiretroviral therapy in HIV-infected patients is of major importance in developing long-term treatment strategies for patients with HIV-1 infection. We designed a trial to characterize these parameters after interruption of highly active antiretroviral therapy (HAART) in patients who had maintained prolonged viral suppression on antiretroviral drugs. Eighteen patients with CD4 + T cell counts ≥ 350 cells/μl and viral load below the limits of detection for ≥1 year while on HAART were enrolled prospectively in a trial in which HAART was discontinued. Twelve of these patients had received prior IL-2 therapy and had low frequencies of resting, latently infected CD4 cells. Viral load relapse to >50 copies/ml occurred in all 18 patients independent of prior IL-2 treatment, beginning most commonly during weeks 2–3 after cessation of HAART. The mean relapse rate constant was 0.45 (0.20 log 10 copies) day −1 , which was very similar to the mean viral clearance rate constant after drug resumption of 0.35 (0.15 log 10 copies) day −1 ( P = 0.28). One patient experienced a relapse delay to week 7. All patients except one experienced a relapse burden to >5,000 RNA copies/ml. Ex vivo labeling with BrdUrd showed that CD4 and CD8 cell turnover increased after withdrawal of HAART and correlated with viral load whereas lymphocyte turnover decreased after reinitiation of drug treatment. Virologic relapse occurs rapidly in patients who discontinue suppressive drug therapy, even in patients with a markedly diminished pool of resting, latently infected CD4 + T cells.
0
Citation808
0
Save
0

Quality control parameters on a large dataset of regionally dissected human control brains for whole genome expression studies

Daniah Trabzuni et al.Aug 17, 2011
J. Neurochem. (2011) 119 , 275–282. Abstract We are building an open‐access database of regional human brain expression designed to allow the genome‐wide assessment of genetic variability on expression. Array and RNA sequencing technologies make assessment of genome‐wide expression possible. Human brain tissue is a challenging source for this work because it can only be obtained several and variable hours post‐mortem and after varying agonal states. These variables alter RNA integrity in a complex manner. In this report, we assess the effect of post‐mortem delay, agonal state and age on gene expression, and the utility of pH and RNA integrity number as predictors of gene expression as measured on 1266 Affymetrix Exon Arrays. We assessed the accuracy of the array data using QuantiGene, as an independent non‐PCR‐based method. These quality control parameters will allow database users to assess data accuracy. We report that within the parameters of this study post‐mortem delay, agonal state and age have little impact on array quality, array data are robust to variable RNA integrity, and brain pH has only a small effect on array performance. QuantiGene gave very similar expression profiles as array data. This study is the first step in our initiative to make human, regional brain expression freely available.
0
Citation227
0
Save