Estimates of foodborne illness can be used to direct food safety policy and interventions. We used data from active and passive surveillance and other sources to estimate that each year 31 major pathogens acquired in the United States caused 9.4 million episodes of foodborne illness (90% credible interval [CrI] 6.6-12.7 million), 55,961 hospitalizations (90% CrI 39,534-75,741), and 1,351 deaths (90% CrI 712-2,268). Most (58%) illnesses were caused by norovirus, followed by nontyphoidal Salmonella spp. (11%), Clostridium perfringens (10%), and Campylobacter spp. (9%). Leading causes of hospitalization were nontyphoidal Salmonella spp. (35%), norovirus (26%), Campylobacter spp. (15%), and Toxoplasma gondii (8%). Leading causes of death were nontyphoidal Salmonella spp. (28%), T. gondii (24%), Listeria monocytogenes (19%), and norovirus (11%). These estimates cannot be compared with prior (1999) estimates to assess trends because different methods were used. Additional data and more refined methods can improve future estimates.

BackgroundFollowing the emergency use authorisation of the Pfizer–BioNTech mRNA COVID-19 vaccine BNT162b2 (international non-proprietary name tozinameran) in Israel, the Ministry of Health (MoH) launched a campaign to immunise the 6·5 million residents of Israel aged 16 years and older. We estimated the real-world effectiveness of two doses of BNT162b2 against a range of SARS-CoV-2 outcomes and to evaluate the nationwide public-health impact following the widespread introduction of the vaccine.MethodsWe used national surveillance data from the first 4 months of the nationwide vaccination campaign to ascertain incident cases of laboratory-confirmed SARS-CoV-2 infections and outcomes, as well as vaccine uptake in residents of Israel aged 16 years and older. Vaccine effectiveness against SARS-CoV-2 outcomes (asymptomatic infection, symptomatic infection, and COVID-19-related hospitalisation, severe or critical hospitalisation, and death) was calculated on the basis of incidence rates in fully vaccinated individuals (defined as those for whom 7 days had passed since receiving the second dose of vaccine) compared with rates in unvaccinated individuals (who had not received any doses of the vaccine), with use of a negative binomial regression model adjusted for age group (16–24, 25–34, 35–44, 45–54, 55–64, 65–74, 75–84, and ≥85 years), sex, and calendar week. The proportion of spike gene target failures on PCR test among a nationwide convenience-sample of SARS-CoV-2-positive specimens was used to estimate the prevelance of the B.1.1.7 variant.FindingsDuring the analysis period (Jan 24 to April 3, 2021), there were 232 268 SARS-CoV-2 infections, 7694 COVID-19 hospitalisations, 4481 severe or critical COVID-19 hospitalisations, and 1113 COVID-19 deaths in people aged 16 years or older. By April 3, 2021, 4 714 932 (72·1%) of 6 538 911 people aged 16 years and older were fully vaccinated with two doses of BNT162b2. Adjusted estimates of vaccine effectiveness at 7 days or longer after the second dose were 95·3% (95% CI 94·9–95·7; incidence rate 91·5 per 100 000 person-days in unvaccinated vs 3·1 per 100 000 person-days in fully vaccinated individuals) against SARS-CoV-2 infection, 91·5% (90·7–92·2; 40·9 vs 1·8 per 100 000 person-days) against asymptomatic SARS-CoV-2 infection, 97·0% (96·7–97·2; 32·5 vs 0·8 per 100 000 person-days) against symptomatic COVID-19, 97·2% (96·8–97·5; 4·6 vs 0·3 per 100 000 person-days) against COVID-19-related hospitalisation, 97·5% (97·1–97·8; 2·7 vs 0·2 per 100 000 person-days) against severe or critical COVID-19-related hospitalisation, and 96·7% (96·0–97·3; 0·6 vs 0·1 per 100 000 person-days) against COVID-19-related death. In all age groups, as vaccine coverage increased, the incidence of SARS-CoV-2 outcomes declined. 8006 of 8472 samples tested showed a spike gene target failure, giving an estimated prevalence of the B.1.1.7 variant of 94·5% among SARS-CoV-2 infections.InterpretationTwo doses of BNT162b2 are highly effective across all age groups (≥16 years, including older adults aged ≥85 years) in preventing symptomatic and asymptomatic SARS-CoV-2 infections and COVID-19-related hospitalisations, severe disease, and death, including those caused by the B.1.1.7 SARS-CoV-2 variant. There were marked and sustained declines in SARS-CoV-2 incidence corresponding to increasing vaccine coverage. These findings suggest that COVID-19 vaccination can help to control the pandemic.FundingNone.

BackgroundVaccine effectiveness studies have not differentiated the effect of the delta (B.1.617.2) variant and potential waning immunity in observed reductions in effectiveness against SARS-CoV-2 infections. We aimed to evaluate overall and variant-specific effectiveness of BNT162b2 (tozinameran, Pfizer–BioNTech) against SARS-CoV-2 infections and COVID-19-related hospital admissions by time since vaccination among members of a large US health-care system.MethodsIn this retrospective cohort study, we analysed electronic health records of individuals (≥12 years) who were members of the health-care organisation Kaiser Permanente Southern California (CA, USA), to assess BNT162b2 vaccine effectiveness against SARS-CoV-2 infections and COVID-19-related hospital admissions for up to 6 months. Participants were required to have 1 year or more previous membership of the organisation. Outcomes comprised SARS-CoV-2 PCR-positive tests and COVID-19-related hospital admissions. Effectiveness calculations were based on hazard ratios from adjusted Cox models. This study was registered with ClinicalTrials.gov, NCT04848584.FindingsBetween Dec 14, 2020, and Aug 8, 2021, of 4 920 549 individuals assessed for eligibility, we included 3 436 957 (median age 45 years [IQR 29–61]; 1 799 395 [52·4%] female and 1 637 394 [47·6%] male). For fully vaccinated individuals, effectiveness against SARS-CoV-2 infections was 73% (95% CI 72–74) and against COVID-19-related hospital admissions was 90% (89–92). Effectiveness against infections declined from 88% (95% CI 86–89) during the first month after full vaccination to 47% (43–51) after 5 months. Among sequenced infections, vaccine effectiveness against infections of the delta variant was high during the first month after full vaccination (93% [95% CI 85–97]) but declined to 53% [39–65] after 4 months. Effectiveness against other (non-delta) variants the first month after full vaccination was also high at 97% (95% CI 95–99), but waned to 67% (45–80) at 4–5 months. Vaccine effectiveness against hospital admissions for infections with the delta variant for all ages was high overall (93% [95% CI 84–96]) up to 6 months.InterpretationOur results provide support for high effectiveness of BNT162b2 against hospital admissions up until around 6 months after being fully vaccinated, even in the face of widespread dissemination of the delta variant. Reduction in vaccine effectiveness against SARS-CoV-2 infections over time is probably primarily due to waning immunity with time rather than the delta variant escaping vaccine protection.FundingPfizer.

Abstract Each year, >9 million foodborne illnesses are estimated to be caused by major pathogens acquired in the United States. Preventing these illnesses is challenging because resources are limited and linking individual illnesses to a particular food is rarely possible except during an outbreak. We developed a method of attributing illnesses to food commodities that uses data from outbreaks associated with both simple and complex foods. Using data from outbreak-associated illnesses for 1998–2008, we estimated annual US foodborne illnesses, hospitalizations, and deaths attributable to each of 17 food commodities. We attributed 46% of illnesses to produce and found that more deaths were attributed to poultry than to any other commodity. To the extent that these estimates reflect the commodities causing all foodborne illness, they indicate that efforts are particularly needed to prevent contamination of produce and poultry. Methods to incorporate data from other sources are needed to improve attribution estimates for some commodities and agents.

Strains of salmonella that are resistant to antimicrobial agents have become a worldwide health problem. A distinct strain of Salmonella enterica serotype typhimurium, known as definitive type 104 (DT104), is resistant to ampicillin, chloramphenicol, streptomycin, sulfonamides, and tetracycline and has become a major cause of illness in humans and animals in Europe, especially the United Kingdom.To characterize typhimurium DT104 infections in the United States, we analyzed data collected by local and state health departments and public health laboratories between 1979 and 1996 in national surveys of the antimicrobial-drug resistance of salmonella. Selected typhimurium isolates with the five-drug pattern of resistance were phage typed.The prevalence of typhimurium isolates with the five-drug pattern of resistance increased from 0.6 percent in 1979-1980 to 34 percent in 1996. In 1994-1995, such isolates were identified in samples from 36 of the 46 surveillance sites (78 percent). Thirty-nine of 43 typhimurium isolates with the five-drug pattern of resistance identified in 1994-1995 and 1996 were phage type DT104 or a closely related phage type.Multidrug-resistant typhimurium DT104 has become a widespread pathogen in the United States. More prudent use of antimicrobial agents in farm animals and more effective disease prevention on farms are necessary to reduce the dissemination of multidrug-resistant typhimurium DT104 and to slow the emergence of resistance to additional agents in this and other strains of salmonella.

Abstract Estimates of foodborne illness can be used to direct food safety policy and interventions. We used data from active and passive surveillance and other sources to estimate that each year 31 major pathogens acquired in the United States caused 9.4 million episodes of foodborne illness (90% credible interval [CrI] 6.6–12.7 million), 55,961 hospitalizations (90% CrI 39,534–75,741), and 1,351 deaths (90% CrI 712–2,268). Most (58%) illnesses were caused by norovirus, followed by nontyphoidal Salmonella spp. (11%), Clostridium perfringens (10%), and Campylobacter spp. (9%). Leading causes of hospitalization were nontyphoidal Salmonella spp. (35%), norovirus (26%), Campylobacter spp. (15%), and Toxoplasma gondii (8%). Leading causes of death were nontyphoidal Salmonella spp. (28%), T. gondii (24%), Listeria monocytogenes (19%), and norovirus (11%). These estimates cannot be compared with prior (1999) estimates to assess trends because different methods were used. Additional data and more refined methods can improve future estimates.

The emergence of resistance to antimicrobial agents within the salmonellae is a worldwide problem that has been associated with the use of antibiotics in livestock. Resistance to ceftriaxone and the fluoroquinolones, which are used to treat invasive salmonella infections, is rare in the United States. We analyzed the molecular characteristics of a ceftriaxone-resistant strain of Salmonella enterica serotype typhimurium isolated from a 12-year-old boy with fever, abdominal pain, and diarrhea.

Data collected by the CDC through a collaborative surveillance program for collection and periodic reporting of data concerning the occurrence and causes of foodborne disease outbreaks (FBDOs) are reviewed for the period from January 1988 through December 1992. An FBDO is defined as the occurrence of two or more cases of a similar illness resulting from the ingestion of a common food. Before 1992 only one case of intoxication by chemical or other nonbacterial toxin, marine toxin, or Clostridium botulinum toxin as a result of the ingestion of food was required to constitute an FBDO. Since 1992 two or more cases have been required. State and local public health departments have primary responsibility for identifying and investigating FBDOs. State and territorial health departments report these outbreaks to CDC on a standard form. During the 1988-1992 period a total of 2,423 outbreaks of foodborne disease were reported (451 in 1988, 505 in 1989, 532 in 1990, 528 in 1991, and 407 in 1992). These outbreaks caused a reported 77,373 persons to become ill. Among outbreaks for which the etiology was determined, bacterial pathogens caused the largest percentage of outbreaks (79%) and the largest percentage of cases (90%). Salmonella serotype Enteritidis accounted for the largest number of outbreaks, cases, and deaths; most of these outbreaks were attributed to eating undercooked, infected eggs. Chemical and other nonbacterial agents caused 14% of outbreaks and 2% of cases; parasites, 2% of outbreaks and 1% of cases; and viruses, 4% of outbreaks and 6% of cases. The number of FBDOs reported per year did not change substantially during the first four years but declined in 1992 as a result of the revised definition of an outbreak. During this reporting period S. Enteritidis continued to be a major cause of morbidity and mortality. In addition, multistate outbreaks caused by contaminated produce and outbreaks caused by Escherichia coli O157:H7 became more prominent.

A study was undertaken to determine the survival patterns of Salmonella montevideo G4639 on and in tomatoes during storage and the efficacy of chlorine treatment on inactivation of the pathogen. The population of S. montevideo on the surfaces of inoculated tomatoes stored at 10 degrees C did not change significantly (P < 0.05) throughout an 18-day storage period. Significant increases in population occurred within 7 days and within 1 day when tomatoes were stored at 20 and 30 degrees C, respectively. A significantly higher number of cells was taken up by the core tissue of tomatoes tempered at 25 degrees C when the tomatoes were dipped in a suspension at 10 degrees C compared with the number taken up when the tomatoes were dipped in cell suspensions tempered at 25 or 37 degrees C. Populations remained constant throughout subsequent storage for 8 days at 10 degrees C, regardless of the temperature differential between tomatoes and the dip suspension. Storage of tomatoes at 20 degrees C, however, resulted in significant increases in populations of S. montevideo. Populations of the pathogen on the surfaces and in the core tissues of tomatoes were significantly reduced by dipping for 2 min in a solution containing 60 or 110 ppm (60 or 110 micrograms/ml) chlorine, respectively; however, treatment in solution containing 320 ppm chlorine did not result in complete inactivation. Populations of S. montevideo remained unchanged in chopped tomatoes stored at 5 degrees C for 216 h (9 days) but increased significantly after storage for 96 or 22 h at 20 or 30 degrees C, respectively.(ABSTRACT TRUNCATED AT 250 WORDS)

Background. Most human infections are caused by closely related serotypes within 1 species of Salmonella. Few data are available on differences in severity of disease among common serotypes.