AK
Ashok Kumar
Author with expertise in Molecular Mechanisms of DNA Damage Response
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(57% Open Access)
Cited by:
1,311
h-index:
24
/
i10-index:
45
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Cancer-preventing attributes of probiotics: an update

Manoj Kumar et al.Feb 26, 2010
Cancer is a serious global public health problem. Cancer incidence and mortality have been steadily rising throughout the past century in most places of the world. There are several epidemiological evidences that support a protective role of probiotics against cancer. Lactic acid bacteria and their probioactive cellular substances exert many beneficial effects in the gastrointestinal tract, and also release various enzymes into the intestinal lumen and exert potential synergistic (LAB) effects on digestion and alleviate symptoms of intestinal malabsorption. Consumption of fermented dairy products with LAB may elicit anti-tumor effects. These effects are attributed to the inhibition of mutagenic activity, the decrease in several enzymes implicated in the generation of carcinogens, mutagens, or tumor-promoting agents, suppression of tumors, and epidemiology correlating dietary regimes and cancer. Specific cellular components in lactic acid bacteria seem to induce strong adjuvant effects including modulation of cell-mediated immune responses, activation of the reticulo-endothelial system, augmentation of cytokine pathways, and regulation of interleukins and tumor necrosis factors. Studies on the effect of probiotic consumption on cancer appear promising, since recent in vitro and in vivo studies have indicated that probiotic bacteria might reduce the risk, incidence and number of tumors of the colon, liver and bladder. The protective effect against cancer development may be ascribed to binding of mutagens by intestinal bacteria, may suppress the growth of bacteria that convert procarcinogens into carcinogens, thereby reducing the amount of carcinogens in the intestine, reduction of the enzymes β-glucuronidase and β-glucosidase and deconjugation of bile acids, or merely by enhancing the immune system of the host. There are isolated reports citing that administration of LAB results in increased activity of anti-oxidative enzymes or by modulating circulatory oxidative stress that protects cells against carcinogen-induced damage. These include glutathione-S-transferase, glutathione, glutathione reductase, glutathione peroxidase, superoxide dismutase and catalase. However, there is no direct experimental evidence for cancer suppression in human subjects as a result of the consumption of probiotic cultures in fermented or unfermented dairy products, but there is a wealth of indirect evidence based largely on laboratory studies.
0
Citation260
0
Save
0

Circular RNA: The evolving potential in the disease world

Aarti Sharma et al.Sep 19, 2024
Circular RNAs (circRNAs), a new star of noncoding RNAs, are a group of endogenous RNAs that form a covalently closed circle and occur widely in the mammalian genome. Most circRNAs are conserved throughout species and frequently show stage-specific expression during various stages of tissue development. CircRNAs were a mystery discovery, as they were initially believed to be a product of splicing errors; however, subsequent research has shown that circRNAs can perform various functions and help in the regulation of splicing and transcription, including playing a role as microRNA (miRNA) sponges. With the application of high throughput next-generation technologies, circRNA hotspots were discovered. There are emerging indications that explain the association of circRNAs with human diseases, like cancers, developmental disorders, and inflammation, and circRNAs may be a new potential biomarker for the diagnosis and treatment outcome of various diseases, including cancer. After the discoveries of miRNAs and long noncoding RNAs, circRNAs are now acting as a novel research entity of interest in the field of RNA disease biology. In this review, we aim to focus on major updates on the biogeny and metabolism of circRNAs, along with their possible/established roles in major human diseases.
0

COX‐2 Inhibitor Prediction With KNIME: A Codeless Automated Machine Learning‐Based Virtual Screening Workflow

Powsali Ghosh et al.Jan 11, 2025
Cyclooxygenase-2 (COX-2) is an enzyme that plays a crucial role in inflammation by converting arachidonic acid into prostaglandins. The overexpression of enzyme is associated with conditions such as cancer, arthritis, and Alzheimer's disease (AD), where it contributes to neuroinflammation. In silico virtual screening is pivotal in early-stage drug discovery; however, the absence of coding or machine learning expertise can impede the development of reliable computational models capable of accurately predicting inhibitor compounds based on their chemical structure. In this study, we developed an automated KNIME workflow for predicting the COX-2 inhibitory potential of novel molecules by building a multi-level ensemble model constructed with five machine learning algorithms (i.e., Logistic Regression, K-Nearest Neighbors, Decision Tree, Random Forest, and Extreme Gradient Boosting) and various molecular and fingerprint descriptors (i.e., AtomPair, Avalon, MACCS, Morgan, RDKit, and Pattern). Post-applicability domain filtering, the final majority voting-based ensemble model achieved 90.0% balanced accuracy, 87.7% precision, and 86.4% recall on the external validation set. The freely accessible workflow empowers users to swiftly and effortlessly predict COX-2 inhibitors, eliminating the need for any prior knowledge in machine learning, coding, or statistical modeling, significantly broadening its accessibility. While beginners can seamlessly use the tool as is, experienced KNIME users can leverage it as a foundation to build advanced workflows, driving further research and innovation.
0

Development of Polymeric Micelles for Combined Delivery of Luteolin and Doxorubicin for Cancer Therapy

Saad Alshamrani et al.Jan 1, 2024
Background: Luteolin (LUT) is a bioactive compound with several pharmacological activities including anticancer effect.Doxorubicin (DOX) is an anthracycline chemotherapeutic drug that have proven to be effective in treating various types of cancers.Polymeric micelles (PMs) containing biologically active materials have emerged as prospective dosage forms with high drug-loading, which can add therapeutic benefit to the poorly water-soluble compounds and novel chemical entities.PMs are effective in delivering several drugs, such as anticancer drugs, antifungal drugs, flavonoids and drugs targeting the brain.The aim of the current study is to develop PMs for LUT and DOX as a combined delivery system for cancer therapy.Methods: PMs were prepared using 2.5% of each of LUT and DOX with varying compositions of Poloxamer 188, Poloxamer 407, Vitamin E (TPGS), Poloxamer 123 and Gellucire 44/14 at room temperature.Particle size, polydispersity index, zeta potential, were achieved using Zetasizer Nano particle size analyzer and the sizes were further confirmed with transmission electron microscopy (TEM).Prepared PMs were further characterized using powder X-ray diffraction (PXRD) and fourier transform infrared spectroscopy (FTIR).An MTT assay was performed on breast cancer (MCF-7) cells and liver cancer (HepG2) cells to determine the cytotoxic effect of the different PMs formulations.Results: PMs were successfully developed and optimized using 74.3% Poloxamer 407 with 20.7% Vitamin E (TPGS), and 70% Poloxamer 407 with 25% Gellucire 44/14, respectively.The droplet size and polydispersity index were found to be 62.03 ± 3.99 nm, 91.96 ± 5.80 nm and 0.33 ± 0.05, 0.59± 0.03, respectively for PMs containing TPGS and Gellucire 44/14.Zeta potentials of the PMs containing TPGS and Gellucire 44/14 were recorded as -2.27 ±0.11mV and -7.78 ± 0.10 mV, respectively.The PMs showed a spherical structure with approximately 50-90 nm range evident by TEM analysis.The PXRD spectra of PMs powder presented the amorphization of LUT and DOX.The FTIR spectra of LUT-loaded and DOX-loaded PMs were identical, suggesting consistent PMs composition.The MTT assay showed that the representative combined drug loaded PMs treatment led to a reduction in the viability of MCF-7 and HepG2 cells compared to drug free PMs and pure LUT, DOX alone.Conclusions: PMs with LUT and DOX exhibited significant cytotoxic effects against breast and liver cancer cells and could thus be an important new pharmaceutical formulation to treat cancer.