Ezh2 (Enhancer of zeste homolog 2) protein is the enzymatic component of the Polycomb repressive complex 2 (PRC2), which represses gene expression by methylating lysine 27 of histone H3 (H3K27) and regulates cell proliferation and differentiation during embryonic development. Recently, hot-spot mutations of Ezh2 were identified in diffused large B-cell lymphomas and follicular lymphomas. To investigate if tumor growth is dependent on the enzymatic activity of Ezh2, we developed a potent and selective small molecule inhibitor, EI1, which inhibits the enzymatic activity of Ezh2 through direct binding to the enzyme and competing with the methyl group donor S-Adenosyl methionine. EI1-treated cells exhibit genome-wide loss of H3K27 methylation and activation of PRC2 target genes. Furthermore, inhibition of Ezh2 by EI1 in diffused large B-cell lymphomas cells carrying the Y641 mutations results in decreased proliferation, cell cycle arrest, and apoptosis. These results provide strong validation of Ezh2 as a potential therapeutic target for the treatment of cancer.

CFIm25 is identified as a factor that prevents messenger RNAs being shortened due to altered 3′ polyadenylation, which typically occurs when cells undergo high proliferation and correlates with increased tumorigenic activity in glioblastoma tumours. Cells undergoing high proliferation display mRNAs that are shortened as a result of decreased 3′ polyadenylation. Eric Wagner and colleagues have identified CFIm25 (a 25-kilodalton component of the cleavage factor Im complex involved in pre-mRNA 3′-processing) as a factor that prevents polyadenylation shortening. In its absence, poly(A) tails are shorter and proliferation is enhanced in about 11% of expressed mRNAs in HeLa cells. This polyadenylation shortening correlates with the upregulation of several oncogenes, and in glioblastoma cells with higher tumorigenic activity. The global shortening of messenger RNAs through alternative polyadenylation (APA) that occurs during enhanced cellular proliferation represents an important, yet poorly understood mechanism of regulated gene expression1,2. The 3′ untranslated region (UTR) truncation of growth-promoting mRNA transcripts that relieves intrinsic microRNA- and AU-rich-element-mediated repression has been observed to correlate with cellular transformation3; however, the importance to tumorigenicity of RNA 3′-end-processing factors that potentially govern APA is unknown. Here we identify CFIm25 as a broad repressor of proximal poly(A) site usage that, when depleted, increases cell proliferation. Applying a regression model on standard RNA-sequencing data for novel APA events, we identified at least 1,450 genes with shortened 3′ UTRs after CFIm25 knockdown, representing 11% of significantly expressed mRNAs in human cells. Marked increases in the expression of several known oncogenes, including cyclin D1, are observed as a consequence of CFIm25 depletion. Importantly, we identified a subset of CFIm25-regulated APA genes with shortened 3′ UTRs in glioblastoma tumours that have reduced CFIm25 expression. Downregulation of CFIm25 expression in glioblastoma cells enhances their tumorigenic properties and increases tumour size, whereas CFIm25 overexpression reduces these properties and inhibits tumour growth. These findings identify a pivotal role of CFIm25 in governing APA and reveal a previously unknown connection between CFIm25 and glioblastoma tumorigenicity.

Background & Aims Pharmacological approaches can potentially improve fatty liver condition in alcoholic and non-alcoholic fatty liver diseases. The salutary effects of reducing lipid synthesis or promoting lipid oxidation have been well reported, but the benefits of increasing lipid degradation have yet to be well explored. Macroautophagy is a cellular degradation process that can remove subcellular organelles including lipid droplets. We thus investigated whether pharmacological modulation of macroautophagy could be an effective approach to alleviate fatty liver condition and liver injury. Methods C57BL/6 mice were given ethanol via intraperitoneal injection (acute) or by a 4-week oral feeding regime (chronic), or high fat diet for 12 weeks. An autophagy enhancer, carbamazepine or rapamycin, or an autophagy inhibitor, chloroquine, was given before sacrifice. Activation of autophagy, level of hepatic steatosis, and blood levels of triglycerides, liver enzyme, glucose and insulin were measured. Results In both acute and chronic ethanol condition, macroautophagy was activated. Carbamazepine, as well as rapamycin, enhanced ethanol-induced macroautophagy in hepatocytes in vitro and in vivo. Hepatic steatosis and liver injury were exacerbated by chloroquine, but alleviated by carbamazepine. The protective effects of carbamazepine and rapamycin in reducing steatosis and in improving insulin sensitivity were also demonstrated in high fat diet-induced non-alcoholic fatty liver condition. Conclusions These findings indicate that pharmacological modulation of macroautophagy in the liver can be an effective strategy for reducing fatty liver condition and liver injury. Pharmacological approaches can potentially improve fatty liver condition in alcoholic and non-alcoholic fatty liver diseases. The salutary effects of reducing lipid synthesis or promoting lipid oxidation have been well reported, but the benefits of increasing lipid degradation have yet to be well explored. Macroautophagy is a cellular degradation process that can remove subcellular organelles including lipid droplets. We thus investigated whether pharmacological modulation of macroautophagy could be an effective approach to alleviate fatty liver condition and liver injury. C57BL/6 mice were given ethanol via intraperitoneal injection (acute) or by a 4-week oral feeding regime (chronic), or high fat diet for 12 weeks. An autophagy enhancer, carbamazepine or rapamycin, or an autophagy inhibitor, chloroquine, was given before sacrifice. Activation of autophagy, level of hepatic steatosis, and blood levels of triglycerides, liver enzyme, glucose and insulin were measured. In both acute and chronic ethanol condition, macroautophagy was activated. Carbamazepine, as well as rapamycin, enhanced ethanol-induced macroautophagy in hepatocytes in vitro and in vivo. Hepatic steatosis and liver injury were exacerbated by chloroquine, but alleviated by carbamazepine. The protective effects of carbamazepine and rapamycin in reducing steatosis and in improving insulin sensitivity were also demonstrated in high fat diet-induced non-alcoholic fatty liver condition. These findings indicate that pharmacological modulation of macroautophagy in the liver can be an effective strategy for reducing fatty liver condition and liver injury.

The long non-coding RNA Hox transcript antisense intergenic RNA (HOTAIR) was recently implicated in breast cancer metastasis and is predictive of poor prognosis in colorectal and pancreatic cancers. We recently discovered that HOTAIR is a cell cycle-related lncRNA in human glioma, and its expression is closely associated with glioma staging and poor prognosis. Although lysine specific demethylase 1 (LSD1) and polycomb repressive complex 2 (PRC2) have been demonstrated to be functional targets of HOTAIR, how HOTAIR regulates glioma cell cycle progression remains largely unknown. In this study, we found that EZH2 (predominant PRC2 complex component) inhibition blocked cell cycle progression in glioma cells, consistent with the effects elicited by HOTAIR siRNA. However, the inhibition of LSD1 did not affect cell cycle progression in glioma cells. These results suggest that HOTAIR might regulate cell cycle progression through EZH2. Our intracranial mice model also revealed delayed tumor growth in HOTAIR siRNA- and EZH2 inhibitor-treated groups. Moreover, in HOTAIR knock-down cell lines, the expression of the PRC2-binding domain of HOTAIR (5' domain) but not of the LSD1-binding domain of HOTAIR (3' domain) resulted in accelerated cell cycle progression. In conclusion, HOTAIR promotes cell cycle progression in glioma as a result of the binding of its 5' domain to the PRC2 complex.

Cardiovascular disease (CVD) is a serious comorbidity in nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). Since plasma ceramides are increased in NAFLD and sphingomyelin, a ceramide metabolite, is an independent risk factor for CVD, the role of ceramides in dyslipidemia was assessed using LDLR-/- mice, a diet-induced model of NAFLD and atherosclerosis. Mice were fed a standard or Western diet (WD), with or without myriocin, an inhibitor of ceramide synthesis. Hepatic and plasma ceramides were profiled and lipid and lipoprotein kinetics were quantified. Hepatic and intestinal expression of genes and proteins involved in insulin, lipid and lipoprotein metabolism were also determined. WD caused hepatic oxidative stress, inflammation, apoptosis, increased hepatic long-chain ceramides associated with apoptosis (C16 and C18) and decreased very-long-chain ceramide C24 involved in insulin signaling. The plasma ratio of ApoB/ApoA1 (proteins of VLDL/LDL and HDL) was increased 2-fold due to increased ApoB production. Myriocin reduced hepatic and plasma ceramides and sphingomyelin, and decreased atherosclerosis, hepatic steatosis, fibrosis, and apoptosis without any effect on oxidative stress. These changes were associated with decreased lipogenesis, ApoB production and increased HDL turnover. Thus, modulation of ceramide synthesis may lead to the development of novel strategies for the treatment of both NAFLD and its associated atherosclerosis.

Abstract Objective the dominant epitopes of T and B cells of VirB8 and VirB10 of Brucella type IV. Secretory systems were predicted and analyzed by bioinformatics, and then multi-epitope vaccines were constructed by reverse vaccination. Methods The amino acid sequences of VirB8 and VirB10 were obtained from the UniProt database, T and B cell dominant epitopes were selected and supplemented with adjuvants to construct a multi-epitope vaccine, SOPMA and RoseTTAFold were applied to predict secondary and tertiary structures respectively for immune simulations. Finally, molecular dynamics simulations of iMEV-TLR4 were then performed. Results one cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitope, five helper T lymphocyte (HTL) epitopes, two linear B cell epitopes and three conformational B cell epitopes were obtained in VirB8. 1 cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitope, 4 helper T lymphocyte (HTL) epitopes, 4 linear B cell epitopes, and 3 conformational B cell epitopes were obtained in VirB10. The resulting multiepitope vaccine is a protein with good antigenicity, hydrophilicity, and stability. Conclusion a novel brucella multiepitope vaccine was designed by reverse vaccination, and this study provides a theoretical basis for further research.

Background Sepsis-associated acute kidney injury (SA-AKI) poses an independent risk for mortality due to the absence of highly sensitive biomarkers and a specific treatment plan. Objective Investigate the association between low molecular weight heparin (LMWH) calcium therapy and prognosis in critically ill SA-AKI patients, and assess the causal relationship through Mendelian randomization (MR) analysis. Methods A single-center, retrospective, cross-sectional study included 90 SA-AKI patients and 30 septic patients without acute kidney injury (AKI) from the intensive care unit (ICU) of the First Hospital of Lanzhou University. SA-AKI patients were categorized into control or LMWH groups based on LMWH calcium usage. Primary outcome was renal function recovery, with secondary outcomes including 28-day mortality, ICU stay length, number of renal replacement therapy (RRT) recipients, and 90-day survival. MR and related sensitivity analyses explored causal effects. Results The combination of heparin-binding protein (HBP), heparanase (HPA), and neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL) demonstrated high diagnostic value for SA-AKI. MR analysis suggested a potential causal link between gene-predicted HBP and AKI (OR: 1.369, 95%CI: 1.040–1.801, p = 0.024). In the retrospective study, LMWH-treated patients exhibited improved renal function, reduced levels of HPA, HBP, Syndecan-1, and inflammation, along with enhanced immune function compared to controls. However, LMWH did not impact 28-day mortality, 90-day survival, or ICU stay length. Conclusion LMWH could enhance renal function in SA-AKI patients. MR analysis supports this causal link, underscoring the need for further validation in randomized controlled trials.