Genetic roots of multiple sclerosis The genetics underlying who develops multiple sclerosis (MS) have been difficult to work out. Examining more than 47,000 cases and 68,000 controls with multiple genome-wide association studies, the International Multiple Sclerosis Genetics Consortium identified more than 200 risk loci in MS (see the Perspective by Briggs). Focusing on the best candidate genes, including a model of the major histocompatibility complex region, the authors identified statistically independent effects at the genome level. Gene expression studies detected that every major immune cell type is enriched for MS susceptibility genes and that MS risk variants are enriched in brain-resident immune cells, especially microglia. Up to 48% of the genetic contribution of MS can be explained through this analysis. Science , this issue p. eaav7188 ; see also p. 1383

Gray matter (GM) damage and meningeal inflammation have been associated with early disease onset and a more aggressive disease course in multiple sclerosis (MS), but can these changes be identified in the patient early in the disease course?To identify possible biomarkers linking meningeal inflammation, GM damage, and disease severity, gene and protein expression were analyzed in meninges and cerebrospinal fluid (CSF) from 27 postmortem secondary progressive MS and 14 control cases. Combined cytokine/chemokine CSF profiling and 3T magnetic resonance imaging (MRI) were performed at diagnosis in 2 independent cohorts of MS patients (35 and 38 subjects) and in 26 non-MS patients.Increased expression of proinflammatory cytokines (IFNγ, TNF, IL2, and IL22) and molecules related to sustained B-cell activity and lymphoid-neogenesis (CXCL13, CXCL10, LTα, IL6, and IL10) was detected in the meninges and CSF of postmortem MS cases with high levels of meningeal inflammation and GM demyelination. Similar proinflammatory patterns, including increased levels of CXCL13, TNF, IFNγ, CXCL12, IL6, IL8, and IL10, together with high levels of BAFF, APRIL, LIGHT, TWEAK, sTNFR1, sCD163, MMP2, and pentraxin III, were detected in the CSF of MS patients with higher levels of GM damage at diagnosis.A common pattern of intrathecal (meninges and CSF) inflammatory profile strongly correlates with increased cortical pathology, both at the time of diagnosis and at death. These results suggest a role for detailed CSF analysis combined with MRI as a prognostic marker for more aggressive MS. Ann Neurol 2018 Ann Neurol 2018;83:739-755.

We assembled and analyzed genetic data of 47,351 multiple sclerosis (MS) subjects and 68,284 control subjects and establish a reference map of the genetic architecture of MS that includes 200 autosomal susceptibility variants outside the major histocompatibility complex (MHC), one chromosome X variant, and 32 independent associations within the extended MHC. We used an ensemble of methods to prioritize up to 551 potentially associated MS susceptibility genes, that implicate multiple innate and adaptive pathways distributed across the cellular components of the immune system. Using expression profiles from purified human microglia, we do find enrichment for MS genes in these brain-resident immune cells. Thus, while MS is most likely initially triggered by perturbation of peripheral immune responses the functional responses of microglia and other brain cells are also altered and may have a role in targeting an autoimmune process to the central nervous system.