WK
W.H. Kao
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
18
(83% Open Access)
Cited by:
11,036
h-index:
81
/
i10-index:
182
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genetic variants in novel pathways influence blood pressure and cardiovascular disease risk

Georg Ehret et al.Sep 9, 2011
Compared to other common complex diseases, it has proved remarkably difficult to establish the genetic basis of blood-pressure elevation. A multi-stage genome-wide association study involving 200,000 individuals of European descent provides some of the missing detail in the genetic picture. The study identified 16 relevant loci, of which only 6 contain genes previously known or suspected to regulate blood pressure. An association was found between hypertension, the thickness of the left ventricular wall, stroke and coronary artery disease, but not kidney disease or kidney function. Comparison with data from more than 75,000 people of East Asian, South Asian and African ancestries confirmed that many of the variants identified in European-ancestry subjects also influence blood pressure in other populations. Blood pressure is a heritable trait1 influenced by several biological pathways and responsive to environmental stimuli. Over one billion people worldwide have hypertension (≥140 mm Hg systolic blood pressure or ≥90 mm Hg diastolic blood pressure)2. Even small increments in blood pressure are associated with an increased risk of cardiovascular events3. This genome-wide association study of systolic and diastolic blood pressure, which used a multi-stage design in 200,000 individuals of European descent, identified sixteen novel loci: six of these loci contain genes previously known or suspected to regulate blood pressure (GUCY1A3–GUCY1B3, NPR3–C5orf23, ADM, FURIN–FES, GOSR2, GNAS–EDN3); the other ten provide new clues to blood pressure physiology. A genetic risk score based on 29 genome-wide significant variants was associated with hypertension, left ventricular wall thickness, stroke and coronary artery disease, but not kidney disease or kidney function. We also observed associations with blood pressure in East Asian, South Asian and African ancestry individuals. Our findings provide new insights into the genetics and biology of blood pressure, and suggest potential novel therapeutic pathways for cardiovascular disease prevention.
0
Citation1,948
0
Save
0

Twelve type 2 diabetes susceptibility loci identified through large-scale association analysis

Benjamin Voight et al.Jun 27, 2010
Mark McCarthy and colleagues identify twelve new risk loci for type 2 diabetes through a large-scale genome-wide association and replication study in individuals of European ancestry. The identified loci affect both beta-cell function and insulin action and are enriched for genes involved in cell cycle regulation. By combining genome-wide association data from 8,130 individuals with type 2 diabetes (T2D) and 38,987 controls of European descent and following up previously unidentified meta-analysis signals in a further 34,412 cases and 59,925 controls, we identified 12 new T2D association signals with combined P < 5 × 10−8. These include a second independent signal at the KCNQ1 locus; the first report, to our knowledge, of an X-chromosomal association (near DUSP9); and a further instance of overlap between loci implicated in monogenic and multifactorial forms of diabetes (at HNF1A). The identified loci affect both beta-cell function and insulin action, and, overall, T2D association signals show evidence of enrichment for genes involved in cell cycle regulation. We also show that a high proportion of T2D susceptibility loci harbor independent association signals influencing apparently unrelated complex traits.
0
Citation1,756
0
Save
0

MYH9 is associated with nondiabetic end-stage renal disease in African Americans

W.H. Kao et al.Sep 11, 2008
Linda Kao and colleagues use admixture mapping to identify risk variants in MYH9 associated with nondiabetic end-stage renal disease in African Americans. The risk variants are more common in populations with West African ancestry and contribute to the excess burden of end-stage kidney diseases in these populations. A similar finding is reported in an accompanying paper by Cheryl Winkler and colleagues. As end-stage renal disease (ESRD) has a four times higher incidence in African Americans compared to European Americans, we hypothesized that susceptibility alleles for ESRD have a higher frequency in the West African than the European gene pool. We carried out a genome-wide admixture scan in 1,372 ESRD cases and 806 controls and found a highly significant association between excess African ancestry and nondiabetic ESRD (lod score = 5.70) but not diabetic ESRD (lod = 0.47) on chromosome 22q12. Each copy of the European ancestral allele conferred a relative risk of 0.50 (95% CI = 0.39–0.63) compared to African ancestry. Multiple common SNPs (allele frequencies ranging from 0.2 to 0.6) in the gene encoding nonmuscle myosin heavy chain type II isoform A (MYH9) were associated with two to four times greater risk of nondiabetic ESRD and accounted for a large proportion of the excess risk of ESRD observed in African compared to European Americans.
0
Citation631
0
Save
0

Genetic variation in GIPR influences the glucose and insulin responses to an oral glucose challenge

Richa Saxena et al.Jan 17, 2010
Richard Watanabe and colleagues of the MAGIC consortium report meta-analyses of genome-wide association studies to glucose levels two hours after an oral glucose challenge. They identify variants in GIPR associated with glucose and insulin responses. Glucose levels 2 h after an oral glucose challenge are a clinical measure of glucose tolerance used in the diagnosis of type 2 diabetes. We report a meta-analysis of nine genome-wide association studies (n = 15,234 nondiabetic individuals) and a follow-up of 29 independent loci (n = 6,958–30,620). We identify variants at the GIPR locus associated with 2-h glucose level (rs10423928, β (s.e.m.) = 0.09 (0.01) mmol/l per A allele, P = 2.0 × 10−15). The GIPR A-allele carriers also showed decreased insulin secretion (n = 22,492; insulinogenic index, P = 1.0 × 10−17; ratio of insulin to glucose area under the curve, P = 1.3 × 10−16) and diminished incretin effect (n = 804; P = 4.3 × 10−4). We also identified variants at ADCY5 (rs2877716, P = 4.2 × 10−16), VPS13C (rs17271305, P = 4.1 × 10−8), GCKR (rs1260326, P = 7.1 × 10−11) and TCF7L2 (rs7903146, P = 4.2 × 10−10) associated with 2-h glucose. Of the three newly implicated loci (GIPR, ADCY5 and VPS13C), only ADCY5 was found to be associated with type 2 diabetes in collaborating studies (n = 35,869 cases, 89,798 controls, OR = 1.12, 95% CI 1.09–1.15, P = 4.8 × 10−18).
0
Citation621
0
Save
0

Perioperative glycemic control and the risk of infectious complications in a cohort of adults with diabetes.

Sherita Golden et al.Sep 1, 1999
OBJECTIVE: Although hyperglycemia is hypothesized to increase the short-term risk of infection, this hypothesis has not been well tested in a clinical setting. This study was designed to assess the relationship of perioperative glycemic control to the subsequent risk of infectious complications. RESEARCH DESIGN AND METHODS: A total of 411 adults with diabetes who underwent coronary artery surgery from 1990 to 1995 in the cardiac surgery service of an urban university hospital were included in a nonconcurrent prospective cohort study based on chart review. Perioperative glycemic control was characterized by the mean of six capillary glucose measurements taken during the 36-h interval following surgery. The major outcomes studied were infections of leg and chest wounds, pneumonia, and urinary tract infections. RESULTS: Mean postoperative glucose levels ranged from 121 to 352 mg/dl and were divided into quartiles: quartile 1 (121-206 mg/dl), quartile 2 (207-229 mg/dl), quartile 3 (230-252 mg/dl), and quartile 4 (253352 mg/dl). After simultaneous adjustment for age, sex, race, underlying comorbidity, acute severity of illness, and the length of the stay in the surgical intensive care unit, patients with higher mean capillary glucose readings were at increased risk of developing infections. Compared with people in the lowest quartile of postoperative glucose, those in quartiles 2 (relative odds of infection [95% CI] = 1.17 [0.57-2.40]), 3 (1.86 [0.94-3.68]), and 4 (1.78 [0.86-3.47]) were at progressively higher risk for infection (P = 0.05 for trend). CONCLUSIONS: In patients with diabetes who undergo coronary artery surgery, postoperative hyperglycemia is an independent predictor of short-term infectious complications. Physicians should consider a glucose concentration target of &lt; or =200 mg/dl to reduce the risk of infection.
0

Common variants in KCNN3 are associated with lone atrial fibrillation

Patrick Ellinor et al.Feb 21, 2010
Patrick Ellinor and colleagues report a genome-wide association study identifying variants in KCNN3 associated to lone atrial fibrillation. Atrial fibrillation (AF) is the most common sustained arrhythmia. Previous studies have identified several genetic loci associated with typical AF. We sought to identify common genetic variants underlying lone AF. This condition affects a subset of individuals without overt heart disease and with an increased heritability of AF. We report a meta-analysis of genome-wide association studies conducted using 1,335 individuals with lone AF (cases) and 12,844 unaffected individuals (referents). Cases were obtained from the German AF Network, Heart and Vascular Health Study, the Atherosclerosis Risk in Communities Study, the Cleveland Clinic and Massachusetts General Hospital. We identified an association on chromosome 1q21 to lone AF (rs13376333, adjusted odds ratio = 1.56; P = 6.3 × 10−12), and we replicated this association in two independent cohorts with lone AF (overall combined odds ratio = 1.52, 95% CI 1.40–1.64; P = 1.83 × 10−21). rs13376333 is intronic to KCNN3, which encodes a potassium channel protein involved in atrial repolarization.
0
Citation463
0
Save
Load More