AimsThe aims of the study were, first, to critically evaluate lipoprotein(a) [Lp(a)] as a cardiovascular risk factor and, second, to advise on screening for elevated plasma Lp(a), on desirable levels, and on therapeutic strategies.

Coronary heart disease (CHD) is a major cause of death in Western countries. We used genome-wide association scanning to identify a 58-kilobase interval on chromosome 9p21 that was consistently associated with CHD in six independent samples (more than 23,000 participants) from four Caucasian populations. This interval, which is located near the CDKN2A and CDKN2B genes, contains no annotated genes and is not associated with established CHD risk factors such as plasma lipoproteins, hypertension, or diabetes. Homozygotes for the risk allele make up 20 to 25% of Caucasians and have a approximately 30 to 40% increased risk of CHD.

High levels of lipoprotein(a) are associated with increased risk of myocardial infarction (MI).To assess whether genetic data are consistent with this association being causal.Three studies of white individuals from Copenhagen, Denmark, were used: the Copenhagen City Heart Study (CCHS), a prospective general population study with 16 years of follow-up (1991-2007, n = 8637, 599 MI events); the Copenhagen General Population Study (CGPS), a cross-sectional general population study (2003-2006, n = 29 388, 994 MI events); and the Copenhagen Ischemic Heart Disease Study (CIHDS), a case-control study (1991-2004, n = 2461, 1231 MI events).Plasma lipoprotein(a) levels, lipoprotein(a) kringle IV type 2 (KIV-2) size polymorphism genotype, and MIs recorded from 1976 through July 2007 for all participants.In the CCHS, multivariable-adjusted hazard ratios (HRs) for MI for elevated lipoprotein(a) levels were 1.2 (95% confidence interval [CI], 0.9-1.6; events/10,000 person-years, 59) for levels between the 22nd and 66th percentile, 1.6 (95% CI, 1.1-2.2; events/10,000 person-years, 75) for the 67th to 89th percentile, 1.9 (95% CI, 1.2-3.0; events/10,000 person-years, 84) for the 90th to 95th percentile, and 2.6 (95% CI, 1.6-4.1; events/10,000 person-years, 108) for levels greater than the 95th percentile, respectively, vs levels less than the 22nd percentile (events/10,000 person-years, 55) (trend P < .001). Numbers of KIV-2 repeats (sum of repeats on both alleles) ranged from 6 to 99 and on analysis of variance explained 21% and 27% of all variation in plasma lipoprotein(a) levels in the CCHS and CGPS, respectively. Mean lipoprotein(a) levels were 56, 31, 20, and 15 mg/dL for the first, second, third, and fourth quartiles of KIV-2 repeats in the CCHS, respectively (trend P < .001); corresponding values in the CGPS were 60, 34, 22, and 19 mg/dL (trend P < .001). In the CCHS, multivariable-adjusted HRs for MI were 1.5 (95% CI, 1.2-1.9; events/10,000 person-years, 75), 1.3 (95% CI, 1.0-1.6; events/10,000 person-years, 66), and 1.1 (95% CI, 0.9-1.4; events/10,000 person-years, 57) for individuals in the first, second, and third quartiles, respectively, as compared with individuals in the fourth quartile of KIV-2 repeats (events/10,000 person-years, 51) (trend P < .001). Corresponding odds ratios were 1.3 (95% CI, 1.1-1.5), 1.1 (95% CI, 0.9-1.3), and 0.9 (95% CI, 0.8-1.1) in the CGPS (trend P = .005), and 1.4 (95% CI, 1.1-1.7), 1.2 (95% CI, 1.0-1.6), and 1.3 (95% CI, 1.0-1.6) in the CIHDS (trend P = .01). Genetically elevated lipoprotein(a) was associated with an HR of 1.22 (95% CI, 1.09-1.37) per doubling of lipoprotein(a) level on instrumental variable analysis, while the corresponding value for plasma lipoprotein(a) levels on Cox regression was 1.08 (95% CI, 1.03-1.12).These data are consistent with a causal association between elevated lipoprotein(a) levels and increased risk of MI.

Helen Hobbs, Jonathan Cohen and colleagues identify a nonsynonymous variant in TM6SF2 associated with susceptibility to nonalcoholic fatty acid liver disease. They further show that knockdown of Tm6sf2 in mice results in increased liver triglyceride content and reduced very-low-density lipoprotein (VLDL) secretion, suggesting that impaired TM6SF2 function contributes causally to disease risk. Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is the most common form of liver disease. To elucidate the molecular basis of NAFLD, we performed an exome-wide association study of liver fat content. Three variants were associated with higher liver fat levels at the exome-wide significance level of 3.6 × 10−7: two in PNPLA3, an established locus for NAFLD, and one (encoding p.Glu167Lys) in TM6SF2, a gene of unknown function. The TM6SF2 variant encoding p.Glu167Lys was also associated with higher circulating levels of alanine transaminase, a marker of liver injury, and with lower levels of low-density lipoprotein–cholesterol (LDL-C), triglycerides and alkaline phosphatase in 3 independent populations (n > 80,000). When recombinant protein was expressed in cultured hepatocytes, 50% less Glu167Lys TM6SF2 protein was produced relative to wild-type TM6SF2. Adeno-associated virus–mediated short hairpin RNA knockdown of Tm6sf2 in mice increased liver triglyceride content by threefold and decreased very-low-density lipoprotein (VLDL) secretion by 50%. Taken together, these data indicate that TM6SF2 activity is required for normal VLDL secretion and that impaired TM6SF2 function causally contributes to NAFLD.

Homozygous familial hypercholesterolaemia (HoFH) is a rare life-threatening condition characterized by markedly elevated circulating levels of low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C) and accelerated, premature atherosclerotic cardiovascular disease (ACVD). Given recent insights into the heterogeneity of genetic defects and clinical phenotype of HoFH, and the availability of new therapeutic options, this Consensus Panel on Familial Hypercholesterolaemia of the European Atherosclerosis Society (EAS) critically reviewed available data with the aim of providing clinical guidance for the recognition and management of HoFH. Early diagnosis of HoFH and prompt initiation of diet and lipid-lowering therapy are critical. Genetic testing may provide a definitive diagnosis, but if unavailable, markedly elevated LDL-C levels together with cutaneous or tendon xanthomas before 10 years, or untreated elevated LDL-C levels consistent with heterozygous FH in both parents, are suggestive of HoFH. We recommend that patients with suspected HoFH are promptly referred to specialist centres for a comprehensive ACVD evaluation and clinical management. Lifestyle intervention and maximal statin therapy are the mainstays of treatment, ideally started in the first year of life or at an initial diagnosis, often with ezetimibe and other lipid-modifying therapy. As patients rarely achieve LDL-C targets, adjunctive lipoprotein apheresis is recommended where available, preferably started by age 5 and no later than 8 years. The number of therapeutic approaches has increased following approval of lomitapide and mipomersen for HoFH. Given the severity of ACVD, we recommend regular follow-up, including Doppler echocardiographic evaluation of the heart and aorta annually, stress testing and, if available, computed tomography coronary angiography every 5 years, or less if deemed necessary. This EAS Consensus Panel highlights the need for early identification of HoFH patients, prompt referral to specialized centres, and early initiation of appropriate treatment. These recommendations offer guidance for a wide spectrum of clinicians who are often the first to identify patients with suspected HoFH.

The aim of this study was to test the hypothesis that elevated nonfasting remnant cholesterol is a causal risk factor for ischemic heart disease independent of reduced high-density lipoprotein (HDL) cholesterol. Elevated remnant cholesterol is associated with elevated levels of triglyceride-rich lipoproteins and with reduced HDL cholesterol, and all are associated with ischemic heart disease. A total of 73,513 subjects from Copenhagen were genotyped, of whom 11,984 had ischemic heart disease diagnosed between 1976 and 2010. Fifteen genetic variants were selected, affecting: 1) nonfasting remnant cholesterol alone; 2) nonfasting remnant cholesterol and HDL cholesterol combined; 3) HDL cholesterol alone; or 4) low-density lipoprotein (LDL) cholesterol alone as a positive control. The variants were used in a Mendelian randomization design. The causal odds ratio for a 1 mmol/l (39 mg/dl) genetic increase of nonfasting remnant cholesterol was 2.8 (95% confidence interval [CI]: 1.9 to 4.2), with a corresponding observational hazard ratio of 1.4 (95% CI: 1.3 to 1.5). For the ratio of nonfasting remnant cholesterol to HDL cholesterol, corresponding values were 2.9 (95% CI: 1.9 to 4.6) causal and 1.2 (95% CI 1.2 to 1.3) observational for a 1-U increase. However, for HDL cholesterol, corresponding values were 0.7 (95% CI: 0.4 to 1.4) causal and 1.6 (95% CI: 1.4 to 1.7) observational for a 1 mmol/l (39 mg/dl) decrease. Finally, for LDL cholesterol, corresponding values were 1.5 (95% CI: 1.3 to 1.6) causal and 1.1 (95% CI: 1.1 to 1.2) observational for a 1 mmol/l (39 mg/dl) increase. A nonfasting remnant cholesterol increase of 1 mmol/l (39 mg/dl) is associated with a 2.8-fold causal risk for ischemic heart disease, independent of reduced HDL cholesterol. This implies that elevated cholesterol content of triglyceride-rich lipoprotein particles causes ischemic heart disease. However, because pleiotropic effects of the genetic variants studied cannot be totally excluded, these findings need to be confirmed using additional genetic variants and/or randomized intervention trials.

High plasma levels of nonfasting triglycerides are associated with an increased risk of ischemic cardiovascular disease. Whether lifelong low levels of nonfasting triglycerides owing to mutations in the gene encoding apolipoprotein C3 (APOC3) are associated with a reduced risk of ischemic cardiovascular disease in the general population is unknown.

Loss-of-function variants in the angiopoietin-like 3 gene (ANGPTL3) have been associated with decreased plasma levels of triglycerides, low-density lipoprotein (LDL) cholesterol, and high-density lipoprotein (HDL) cholesterol. It is not known whether such variants or therapeutic antagonism of ANGPTL3 are associated with a reduced risk of atherosclerotic cardiovascular disease.

Myocardial infarction (MI), a leading cause of death around the world, displays a complex pattern of inheritance. When MI occurs early in life, genetic inheritance is a major component to risk. Previously, rare mutations in low-density lipoprotein (LDL) genes have been shown to contribute to MI risk in individual families, whereas common variants at more than 45 loci have been associated with MI risk in the population. Here we evaluate how rare mutations contribute to early-onset MI risk in the population. We sequenced the protein-coding regions of 9,793 genomes from patients with MI at an early age (≤50 years in males and ≤60 years in females) along with MI-free controls. We identified two genes in which rare coding-sequence mutations were more frequent in MI cases versus controls at exome-wide significance. At low-density lipoprotein receptor (LDLR), carriers of rare non-synonymous mutations were at 4.2-fold increased risk for MI; carriers of null alleles at LDLR were at even higher risk (13-fold difference). Approximately 2% of early MI cases harbour a rare, damaging mutation in LDLR; this estimate is similar to one made more than 40 years ago using an analysis of total cholesterol. Among controls, about 1 in 217 carried an LDLR coding-sequence mutation and had plasma LDL cholesterol > 190 mg dl(-1). At apolipoprotein A-V (APOA5), carriers of rare non-synonymous mutations were at 2.2-fold increased risk for MI. When compared with non-carriers, LDLR mutation carriers had higher plasma LDL cholesterol, whereas APOA5 mutation carriers had higher plasma triglycerides. Recent evidence has connected MI risk with coding-sequence mutations at two genes functionally related to APOA5, namely lipoprotein lipase and apolipoprotein C-III (refs 18, 19). Combined, these observations suggest that, as well as LDL cholesterol, disordered metabolism of triglyceride-rich lipoproteins contributes to MI risk.

Coronary heart disease (CHD), the commonest cause of death worldwide, is highly heritable, but the DNA sequence variations associated with elevated cardiovascular risk are largely unknown. The investigators planned a genome-wide associational study based on 100,000 single nucleotide polymorphisms and involving 3 sequential case-control comparisons made at a nominal significance threshold of P < 0.025. The study population included more than 23,000 participants from 4 Caucasian populations. Cases had severe, premature CHD starting before age 60 years and leading to coronary artery revascularization. Controls were healthy Caucasian men over age 65 and women over age 70 who lacked symptoms and a history of CHD. Individuals with diabetes or hypercholesterolemia were excluded. A 58-kilobase interval on chromosome 9p21 was consistently associated with CHD. The interval is near the CDKN2A and CDKN2B genes. It contains no annotated genes and is not associated with established CHD risk factors such as diabetes, plasma lipoproteins, or hypertension. Between 20% and 25% of Caucasians are homozygous for the risk allele, and they have an approximately 30%–40% increased risk of CHD. Mechanisms for the association between the risk allele and CHD remain incompletely understood. The allele might promote the development of atherosclerotic plaque, augment thrombogenesis, or increase the tendency of plaques to rupture. The association persisted after controlling for numerous possible confounding factors including age, gender, plasma lipid levels, blood pressure, diabetes, and plasma levels of C-reactive protein. The researchers believe that the effect of the risk allele on chromosome 9 on CHD is not mediated by established risk factors for cardiovascular disease. The present findings support the use of the whole-genome association approach for studying conditions as complex as CHD.