TL
Terho Lehtimäki
Author with expertise in Genomic Studies and Association Analyses
Achievements
This user has not unlocked any achievements yet.
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(20% Open Access)
Cited by:
2
h-index:
8
/
i10-index:
23
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
25

DNA methylation signatures of aggression and closely related constructs: A meta-analysis of epigenome-wide studies across the lifespan

Jenny Dongen et al.Jul 22, 2020
Abstract DNA methylation profiles of aggressive behavior may capture lifetime cumulative effects of genetic, stochastic, and environmental influences associated with aggression. Here, we report the first large meta-analysis of epigenome-wide association studies (EWAS) of aggressive behavior (N=15,324 participants). In peripheral blood samples of 14,434 participants from 18 cohorts with mean ages ranging from 7 to 68 years, 13 methylation sites were significantly associated with aggression (alpha=1.2×10 −7 ; Bonferroni correction). In cord blood samples of 2,425 children from five cohorts with aggression assessed at mean ages ranging from 4 to 7 years, 83% of these sites showed the same direction of association with childhood aggression ( r =0.74, p=0.006) but no epigenome-wide significant sites were found. Top-sites (48 at a false discovery rate of 5% in the peripherl blood meta-analysis or in a combined meta-analysis of peripheral blood and cord blood) have been associated with chemical exposures, smoking, cognition, metabolic traits, and genetic variation (mQTLs). Three genes whose expression levels were associated with top-sites were previously linked to schizophrenia and general risk tolerance. At six CpGs, DNA methylation variation in blood mirrors variation in the brain. On average 44% (range=3-82%) of the aggression–methylation association was explained by current and former smoking and BMI. These findings point at loci that are sensitive to chemical exposures with potential implications for neuronal functions. We hope these results to be a starting point for studies leading to applications as peripheral biomarkers and to reveal causal relationships with aggression and related traits.
25
Citation2
0
Save
0

Systems medicine links microbial inflammatory response with glycoprotein-associated mortality risk

Scott Ritchie et al.Apr 28, 2015
Integrative analyses of high-throughput omics data have elucidated the aetiology and pathogenesis for complex traits and diseases, and the linking of omics information to electronic health records promises new insights into human health and disease. Recent nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy biomarker profiling has implicated glycoprotein acetyls (GlycA) as a biomarker for cardiovascular risk and all-cause mortality. To elucidate biological processes contributing to GlycA- associated mortality risk, we leveraged human omics data from three population- based cohorts together with nation-wide Finnish hospital and mortality records. Elevated GlycA was associated with myriad infection-related inflammatory processes. Within individuals, elevated GlycA levels were stable over long time periods, up to a decade, and chronically elevated GlycA was also associated with modest elevation of numerous cytokines. Individuals with elevated GlycA also showed increased expression of a transcriptional sub-network, the Neutrophil Degranulation Module (NDM), suggesting an increased activity of microbe-driven immune response. Subsequent analysis of nation-wide hospitalisation and death records was consistent with a microbial basis for GlycA-associated mortality, with each standard deviation increase in GlycA raising an individual's future risk of hospitalization and death from non-localized infection by 40% and 136%, respectively. These results show that, beyond its established role in acute-phase response, elevated GlycA is more broadly a biomarker for low-grade chronic inflammation and increased neutrophil activity. Further, increased risk of susceptibility to severe microbial-infection events in healthy individuals suggests this inflammation is a contributor to mortality risk. Taken together, this study demonstrates the power of an integrative approach that combines omics data and health records to delineate the biological processes underlying a newly discovered biomarker, providing a model strategy for future systems medicine studies.