JR
Jinjun Ran
Author with expertise in Modeling the Dynamics of COVID-19 Pandemic
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
2,270
h-index:
27
/
i10-index:
49
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (2019-nCoV) in China, from 2019 to 2020: A data-driven analysis in the early phase of the outbreak

Shi Zhao et al.Jan 30, 2020
+8
J
Q
S
BackgroundsAn ongoing outbreak of a novel coronavirus (2019-nCoV) pneumonia hit a major city in China, Wuhan, December 2019 and subsequently reached other provinces/regions of China and other countries. We present estimates of the basic reproduction number, R0, of 2019-nCoV in the early phase of the outbreak.MethodsAccounting for the impact of the variations in disease reporting rate, we modelled the epidemic curve of 2019-nCoV cases time series, in mainland China from January 10 to January 24, 2020, through the exponential growth. With the estimated intrinsic growth rate (γ), we estimated R0 by using the serial intervals (SI) of two other well-known coronavirus diseases, MERS and SARS, as approximations for the true unknown SI.FindingsThe early outbreak data largely follows the exponential growth. We estimated that the mean R0 ranges from 2.24 (95%CI: 1.96–2.55) to 3.58 (95%CI: 2.89–4.39) associated with 8-fold to 2-fold increase in the reporting rate. We demonstrated that changes in reporting rate substantially affect estimates of R0.ConclusionThe mean estimate of R0 for the 2019-nCoV ranges from 2.24 to 3.58, and is significantly larger than 1. Our findings indicate the potential of 2019-nCoV to cause outbreaks.
0

Estimating the Unreported Number of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Cases in China in the First Half of January 2020: A Data-Driven Modelling Analysis of the Early Outbreak

Shi Zhao et al.Feb 1, 2020
+8
Q
S
S
In December 2019, an outbreak of respiratory illness caused by a novel coronavirus (2019-nCoV) emerged in Wuhan, China and has swiftly spread to other parts of China and a number of foreign countries. The 2019-nCoV cases might have been under-reported roughly from 1 to 15 January 2020, and thus we estimated the number of unreported cases and the basic reproduction number, R0, of 2019-nCoV.We modelled the epidemic curve of 2019-nCoV cases, in mainland China from 1 December 2019 to 24 January 2020 through the exponential growth. The number of unreported cases was determined by the maximum likelihood estimation. We used the serial intervals (SI) of infection caused by two other well-known coronaviruses (CoV), Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and Middle East Respiratory Syndrome (MERS) CoVs, as approximations of the unknown SI for 2019-nCoV to estimate R0.We confirmed that the initial growth phase followed an exponential growth pattern. The under-reporting was likely to have resulted in 469 (95% CI: 403-540) unreported cases from 1 to 15 January 2020. The reporting rate after 17 January 2020 was likely to have increased 21-fold (95% CI: 18-25) in comparison to the situation from 1 to 17 January 2020 on average. We estimated the R0 of 2019-nCoV at 2.56 (95% CI: 2.49-2.63).The under-reporting was likely to have occurred during the first half of January 2020 and should be considered in future investigation.
0

Chronic Low-Grade Inflammation and Brain Structure in the Middle-Aged and Elderly Adults

Yujia Bao et al.Jul 18, 2024
+4
Y
X
Y
Low-grade inflammation (LGI) mainly acted as the mediator of the association of obesity and inflammatory diet with numerous chronic diseases, including neuropsychiatric diseases. However, the evidence about the effect of LGI on brain structure is limited but important, especially in the context of accelerating aging. This study was then designed to close the gap, and we leveraged a total of 37,699 participants from the UK Biobank and utilized inflammation score (INFLA-score) to measure LGI. We built the longitudinal relationships of INFLA-score with brain imaging phenotypes using multiple linear regression models. We further analyzed the interactive effects of specific covariates. The results showed high level inflammation reduced the volumes of the subcortex and cortex, especially the globus pallidus (β [95% confidence interval] = −0.062 [−0.083, −0.041]), thalamus (−0.053 [−0.073, −0.033]), insula (−0.052 [−0.072, −0.032]), superior temporal gyrus (−0.049 [−0.069, −0.028]), lateral orbitofrontal cortex (−0.047 [−0.068, −0.027]), and others. Most significant effects were observed among urban residents. Furthermore, males and individuals with physical frailty were susceptive to the associations. The study provided potential insights into pathological changes during disease progression and might aid in the development of preventive and control targets in an age-friendly city to promote great health and well-being for sustainable development goals.
0
Citation1
0
Save
0

Global burden of enteric infections related foodborne diseases, 1990–2021: findings from the Global Burden of Disease study 2021

Tianyun Li et al.Jan 1, 2024
+7
Y
N
T
Understanding the global burden of enteric infections is crucial for prioritizing control strategies for foodborne and waterborne diseases. This study aimed to assess the global burden of enteric infections in 2021 and identify risk factors from One Health aspects.
0

Associations of long-term exposure to low-level PM2.5 and brain disorders in 260,922 middle-aged and older adults

Ne Qiang et al.Jun 25, 2024
+5
Y
Y
N
Long-term exposure to high-level ambient PM2.5 was associated with increased risks of brain disorders, while the associations remain uncertain of the exposure lower than current air quality standards in numerous countries. This study aimed to assess the effects of PM2.5 exposure on the brain system in the population with annual mean concentrations ≤15 μg/m3. We analyzed data from 260,922 participants without preexisting brain diseases at baseline in the UK Biobank. The geographical distribution of PM2.5 in 2010 was estimated by a land use regression model and linked with individual residential address. We investigated associations of ambient PM2.5 with incident neurological (dementia, Parkinson's diseases [PD], epilepsy, and migraine) and psychiatric (major depressive disorder [MDD] and anxiety disorder) diseases through Cox proportional hazard models. We further estimated the links with brain imaging phenotypes by neuroimaging analysis. Results showed that in the population with PM2.5 concentrations ≤15 μg/m3, each interquartile range (IQR, 1.28 μg/m3) increment in PM2.5 was related to incidence risks of dementia, epilepsy, migraine, MDD, and anxiety disorder with hazard ratios of 1.08 (95% confidence interval (CI): 1.03, 1.13), 1.12 (1.05, 1.20), 1.07 (1.00, 1.13), 1.06 (1.03, 1.09), and 1.05 (1.02, 1.08), respectively. We did not observe a significant association with PD. The association with dementia was stronger among the population with poor cardiovascular health (measured by Life's Essential 8) than the counterpart (P for interaction=0.037). Likewise, per IQR increase was associated with specific brain imaging phenotypes, including volumes of total brain (β=-0.036; 95% CI: -0.050, -0.022), white matter (-0.030; -0.046, -0.014), grey matter (-0.030; -0.042, -0.017), respectively. The findings suggest long-term exposure to ambient PM2.5 at low-level still has an adverse impact on the neuro-psychiatric system. The brain-relevant epidemiological assessment suggests that each country should update the standard for ambient PM2.5 following the World Health Organization Air Quality Guidelines 2021.
0

Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (2019-nCoV) in China, from 2019 to 2020: A data-driven analysis in the early phase of the outbreak

Shi Zhao et al.Jan 24, 2020
+8
W
L
S
Backgrounds An ongoing outbreak of a novel coronavirus (2019-nCoV) pneumonia hit a major city of China, Wuhan, December 2019 and subsequently reached other provinces/regions of China and countries. We present estimates of the basic reproduction number, R , of 2019-nCoV in the early phase of the outbreak.Methods Accounting for the impact of the variations in disease reporting rate, we modelled the epidemic curve of 2019-nCoV cases time series, in mainland China from January 10 to January 24, 2020, through the exponential growth. With the estimated intrinsic growth rate ( γ ), we estimated R by using the serial intervals (SI) of two other well-known coronavirus diseases, MERS and SARS, as approximations for the true unknown SI.Findings The early outbreak data largely follows the exponential growth. We estimated that the mean R ranges from 2.24 (95%CI: 1.96-2.55) to 3.58 (95%CI: 2.89-4.39) associated with 8-fold to 2-fold increase in the reporting rate. We demonstrated that changes in reporting rate substantially affect estimates of R .Conclusion The mean estimate of R for the 2019-nCoV ranges from 2.24 to 3.58, and significantly larger than 1. Our findings indicate the potential of 2019-nCoV to cause outbreaks.