Impact on tuberculosis diagnostic during COVID-19 pandemic in a tertiary care hospital

Abstract

The aim of this study is to review how did the first three COVID-19 waves affected the diagnostic of tuberculosis and to describe the extra-pulmonary Mycobacterium tuberculosis complex (TB) diagnosis. A retrospective observational study was done during the first three waves of pandemic to ascertain the impact on TB samples and to recover the extra-pulmonary TB cases we included the first two years of COVID-19. All relevant data was recovered from hospital and Clinical Microbiology records. Prepandemic period showed an average of 44 samples per week for TB study; during the first three waves this number dropped to 23.1 per week. A reduction of 67.7% of pulmonary TB diagnosis was observed and an increase of 33.3% diagnosis of extra-pulmonary TB was noted when comparing pre-pandemic and pandemic period. The number of declared cases and samples for TB diagnosis dropped during the first three COVID-19 waves due to the overstretched Public Health System which could lead to a delay in diagnosis, treatment and to the spread of TB disease in the general population. Surveillance programs should be reinforced to avoid this. El objetivo de este estudio fue revisar cómo afectaron las primeras tres olas de la pandemia COVID-19 al diagnóstico de tuberculosis y describir el diagnóstico de las infecciones extrapulmonares causadas por Mycobacterium tuberculosis complex (TB). Se realizó un estudio observacional y retrospectivo durante el periodo que incluye las tres primeras olas de la pandemia para valorar el impacto en las muestras de TB y para valorar el diagnóstico de las TB extrapulmonares se amplió el periodo de estudio para incluir los 2 primeros años de la COVID-19. Todos los datos relevantes se extrajeron de la base de datos del hospital y del Servicio de Microbiología y Parasitología Clínica. En el periodo prepandémico se recibían una media de 44 muestras por semana para el estudio de TB; durante las tres primeras olas ese número cayó a 23,1 por semana. Se observó una reducción del 67,7% en el diagnóstico de la TB pulmonar y un aumento del 33,3% en el diagnóstico de la TB extrapulmonar cuando se comparó con los datos prepandemia. El número de casos declarados y el número de muestras para el diagnóstico de TB cayó durante las tres primeras olas del COVID-19 debido a la saturación del Sistema Nacional de Salud, lo que podría llevar a un retraso en el diagnóstico, tratamiento y a un aumento de la transmisión en la población general. Los sistemas de vigilancia deberían reforzarse para evitar esto.