Abstract This article is the second in a series of two publications relating to the European Crohn’s and Colitis Organisation [ECCO] evidence-based consensus on the management of Crohn’s disease. The first article covers medical management; the present article addresses surgical management, including preoperative aspects and drug management before surgery. It also provides technical advice for a variety of common clinical situations. Both articles together represent the evidence-based recommendations of the ECCO for Crohn’s disease and an update of previous guidelines.

Chapter 4: Scores for Inflammatory Bowel Disease 4.1 Clinical and endoscopic scoring systems in IBD Statement 4.1.ECCO-ESGAR Diagnostics GL (2018) Clinical indices are useful for standardizing disease activity.However, despite widespread use, no score has been validated in clinical practice [EL5] Clinical and endoscopic scoring systems in ulcerative colitisThere are several scoring systems presently available to classify disease severity in ulcerative colitis (UC) within the multiple domains of disease activity, which aid objective assessment of disease and guide therapeutic and monitoring strategies [1,2].Although somewhat limited by subjective definitions, their strength lies in the potential to monitor patient progress over time [1].The Simple Colitis Clinical Activity Index (SCCAI) [2, 3] and the Paediatric Ulcerative Colitis Activity Index (PUCAI) [4] are reliable and responsive scores with clear definitions for clinical response and remission (see Tables).SCCAI scores range between 0 and 19 points and include nocturnal bowel movements and faecal urgency, which affect patient quality-of-life (QoL) [3].An SCCAI score <2 indicates clinical remission and a decrease of >1.5 points from baseline correlates with patient-defined significant improvement [5].The Mayo Clinic Index (Partial Mayo Clinic Index and endoscopic subscore) and Ulcerative Colitis Disease Activity Index (UCDAI) are a composite assessment of clinical symptoms (stool frequency and rectal bleeding) and endoscopic severity (Table x) [6,7].While these indices are not validated, the Mayo Clinic Index is easy to apply and has been used for assessing therapeutic endpoints in adult clinical trials [8].Clinical improvement is defined as the reduction of baseline scores by ≥3 points and clinical remission as an overall score ≤2 (and no individual subscore >1) or UCDAI ≤1 [6][7][8].A Partial Mayo Score (PMS) <1 indicates remission [1].The PMS has been shown to correlate well with the full scoring system [9,10].The Truelove and Witts Severity Index was described in 1955 [11].Its elements reflect levels of systemic toxicity and provide objective criteria for assessment of acute severe colitis, need for hospitalization, and corticosteroid therapy [2] (Table y).The Lichtiger Index is a Supplementary Table 3. Disease activity in ulcerative colitis, adapted from Truelove and Witts [11] Mild Moderate 'between mild and severe' Severe Bloody stools/day

Abstract This article is the second in a series of two publications on the European Crohn’s and Colitis Organisation [ECCO] evidence-based consensus on the management of Crohn’s disease. The first article covers medical management; the present article addresses surgical management, including preoperative aspects and drug management before surgery. It also provides technical advice for a variety of common clinical situations. Both articles together represent the evidence-based recommendations of the ECCO for Crohn’s disease and an update of prior ECCO guidelines.

The overproduction of cells and subsequent production of debris is a universal principle of neurodevelopment. Here we show an additional feature of the developing nervous system that causes neural debris - promoted by the sacrificial nature of embryonic microglia that irreversibly become phagocytic after clearing other neural debris. Described as long-lived, microglia colonize the embryonic brain and persist into adulthood. Using transgenic zebrafish to investigate the microglia debris during brain construction, we identified that unlike other neural cell-types that die in developmental stages after they have expanded, necroptotic-dependent microglial debris is prevalent when microglia are expanding in the zebrafish brain. Time-lapse imaging of microglia demonstrates that this debris is cannibalized by other microglia. To investigate features that promote microglia death and cannibalism, we used time-lapse imaging and fate-mapping strategies to track the lifespan of individual developmental microglia. These approaches revealed that instead of embryonic microglia being long-lived cells that completely digest their phagocytic debris, once most developmental microglia in zebrafish become phagocytic they eventually die, including ones that are cannibalistic. These results establish a paradox -- which we tested by increasing neural debris and manipulating phagocytosis -- that once most microglia in the embryo become phagocytic, they die, create debris and then are cannibalized by other microglia, resulting in more phagocytic microglia that are destined to die.

Abstract To identify potential therapeutic stop-gaps for SARS-CoV-2, we evaluated a library of 1,670 approved and reference compounds in an unbiased, cellular image-based screen for their ability to suppress the broad impacts of the SARS-CoV-2 virus on phenomic profiles of human renal cortical epithelial cells using deep learning. In our assay, remdesivir is the only antiviral tested with strong efficacy, neither chloroquine nor hydroxychloroquine have any beneficial effect in this human cell model, and a small number of compounds not currently being pursued clinically for SARS-CoV-2 have efficacy. We observed weak but beneficial class effects of β-blockers, mTOR/PI3K inhibitors and Vitamin D analogues and a mild amplification of the viral phenotype with β-agonists.