Many countries are currently studying the possibility of mass vaccination against varicella. The objective of this study was to provide a comprehensive picture of the pre-vaccine epidemiology of the varicella zoster virus (VZV) to aid in the design of immunization programs and to adequately measure the impact of vaccination. Population-based data including physician visit claims, sentinel surveillance and hospitalization data from Canada and the United Kingdom were analysed. The key epidemiological characteristics of varicella and zoster (age specific consultation rates, seasonality, force of infection, hospitalization rates and inpatient days) were compared. Results show that the overall epidemiology of varicella and zoster is remarkably similar between the two countries. The major difference being that, contrary to Canada, the epidemiology of varicella seems to be changing in the United Kingdom with an important decrease in the average age at infection that coincides with a significant increase in children attending preschool. Furthermore, differences exist in the seasonality between the United Kingdom and Canada, which seem to be primarily due to the school calendar. These results illustrate that school and preschool contact patterns play an important role in the dynamics of varicella. Finally, our results provide baseline estimates of varicella and zoster incidence and morbidity for VZV vaccine effectiveness and cost-effectiveness studies.

Abstract We evaluated the percentage of hospitalizations for acute respiratory tract infections in children <3 years of age attributable to human metapneumovirus (HMPV) and other respiratory viruses in a prospective study during winter and spring 2002. We used real-time polymerase chain assays and other conventional diagnostic methods to detect HMPV, human respiratory syncytial virus (HRSV), and influenza viruses in nasopharyngeal aspirates of children. HMPV was detected in 12 (6%) of the 208 children hospitalized for acute respiratory tract infections, HRSV in 118 (57%), and influenza A in 49 (24%). Bronchiolitis was diagnosed in 8 (68%) and pneumonitis in 2 (17%) of HMPV-infected children; of those with HRSV infection, pneumonitis was diagnosed in 99 (84%) and bronchiolitis in 30 (25%). None of the HMPV-infected children was admitted to an intensive-care unit, whereas 15% of those with HRSV or influenza A infections were admitted. HMPV is an important cause of illness in young children with a similar, although less severe, clinical presentation to that of HRSV.

Background Influenza vaccine effectiveness (VE) is generally interpreted in the context of vaccine match/mismatch to circulating strains with evolutionary drift in the latter invoked to explain reduced protection. During the 2012–13 season, however, detailed genotypic and phenotypic characterization shows that low VE was instead related to mutations in the egg-adapted H3N2 vaccine strain rather than antigenic drift in circulating viruses. Methods/Findings Component-specific VE against medically-attended, PCR-confirmed influenza was estimated in Canada by test-negative case-control design. Influenza A viruses were characterized genotypically by amino acid (AA) sequencing of established haemagglutinin (HA) antigenic sites and phenotypically through haemagglutination inhibition (HI) assay. H3N2 viruses were characterized in relation to the WHO-recommended, cell-passaged vaccine prototype (A/Victoria/361/2011) as well as the egg-adapted strain as per actually used in vaccine production. Among the total of 1501 participants, influenza virus was detected in 652 (43%). Nearly two-thirds of viruses typed/subtyped were A(H3N2) (394/626; 63%); the remainder were A(H1N1)pdm09 (79/626; 13%), B/Yamagata (98/626; 16%) or B/Victoria (54/626; 9%). Suboptimal VE of 50% (95%CI: 33–63%) overall was driven by predominant H3N2 activity for which VE was 41% (95%CI: 17–59%). All H3N2 field isolates were HI-characterized as well-matched to the WHO-recommended A/Victoria/361/2011 prototype whereas all but one were antigenically distinct from the egg-adapted strain as per actually used in vaccine production. The egg-adapted strain was itself antigenically distinct from the WHO-recommended prototype, and bore three AA mutations at antigenic sites B [H156Q, G186V] and D [S219Y]. Conversely, circulating viruses were identical to the WHO-recommended prototype at these positions with other genetic variation that did not affect antigenicity. VE was 59% (95%CI:16–80%) against A(H1N1)pdm09, 67% (95%CI: 30–85%) against B/Yamagata (vaccine-lineage) and 75% (95%CI: 29–91%) against B/Victoria (non-vaccine-lineage) viruses. Conclusions These findings underscore the need to monitor vaccine viruses as well as circulating strains to explain vaccine performance. Evolutionary drift in circulating viruses cannot be regulated, but influential mutations introduced as part of egg-based vaccine production may be amenable to improvements.

In three case-control studies and a household transmission cohort, Danuta Skowronski and colleagues find an association between prior seasonal flu vaccination and increased risk of 2009 pandemic H1N1 flu.

Binary file ES_Abstracts_Final_ECDC.txt matches

Background. The 2014–2015 influenza season was distinguished by an epidemic of antigenically-drifted A(H3N2) viruses and vaccine components identical to 2013–2014. We report 2014–2015 vaccine effectiveness (VE) from Canada and explore contributing agent–host factors. Methods. VE against laboratory-confirmed influenza was derived using a test-negative design among outpatients with influenza-like illness. Sequencing identified amino acid mutations at key antigenic sites of the viral hemagglutinin protein. Results. Overall, 815/1930 (42%) patients tested influenza-positive: 590 (72%) influenza A and 226 (28%) influenza B. Most influenza A viruses with known subtype were A(H3N2) (570/577; 99%); 409/460 (89%) sequenced viruses belonged to genetic clade 3C.2a and 39/460 (8%) to clade 3C.3b. Dominant clade 3C.2a viruses bore the pivotal mutations F159Y (a cluster-transition position) and K160T (a predicted gain of glycosylation) compared to the mismatched clade 3C.1 vaccine. VE against A(H3N2) was −17% (95% confidence interval [CI], −50% to 9%) overall with clade-specific VE of −13% (95% CI, −51% to 15%) for clade 3C.2a but 52% (95% CI, −17% to 80%) for clade 3C.3b. VE against A(H3N2) was 53% (95% CI, 10% to 75%) for patients vaccinated in 2014-2015 only, significantly lower at −32% (95% CI, −75% to 0%) if also vaccinated in 2013–2014 and −54% (95% CI, −108% to −14%) if vaccinated each year since 2012–2013. VE against clade-mismatched B(Yamagata) viruses was 42% (95% CI, 10% to 62%) with less-pronounced reduction from prior vaccination compared to A(H3N2). Conclusions. Variation in the viral genome and negative effects of serial vaccination likely contributed to poor influenza vaccine performance in 2014–2015.

Abstract The standard dosing of the Pfizer/BioNTech BNT162b2 mRNA vaccine validated in clinical trials includes two doses administered three weeks apart. While the decision by some public health authorities to space the doses because of limiting supply has raised concerns about vaccine efficacy, data indicate that a single dose is up to 90% effective starting 14 days after its administration. We analyzed humoral and T cells responses three weeks after a single dose of this mRNA vaccine. Despite the proven efficacy of the vaccine at this time point, no neutralizing activity were elicited in SARS-CoV-2 naïve individuals. However, we detected strong anti-receptor binding domain (RBD) and Spike antibodies with Fc-mediated effector functions and cellular responses dominated by the CD4 + T cell component. A single dose of this mRNA vaccine to individuals previously infected by SARS-CoV-2 boosted all humoral and T cell responses measured, with strong correlations between T helper and antibody immunity. Neutralizing responses were increased in both potency and breadth, with distinctive capacity to neutralize emerging variant strains. Our results highlight the importance of vaccinating uninfected and previously-infected individuals and shed new light into the potential role of Fc-mediated effector functions and T cell responses in vaccine efficacy. They also provide support to spacing the doses of two-vaccine regimens to vaccinate a larger pool of the population in the context of vaccine scarcity against SARS-CoV-2.

SUMMARY Continuous emergence of SARS-CoV-2 variants of concern (VOC) is fueling the COVID-19 pandemic. Omicron (B.1.1.529), is rapidly spreading worldwide. The large number of mutations in its Spike raised concerns about a major antigenic drift that could significantly decrease vaccine efficacy and infection-induced immunity. A long interval between BNT162b2 mRNA doses was shown to elicit antibodies that efficiently recognize Spikes from different VOCs. Here we evaluated the recognition of Omicron Spike by plasma from a cohort of SARS-CoV-2 naïve and previously-infected individuals that received their BNT162b2 mRNA vaccine 16-weeks apart. Omicron Spike was recognized less efficiently than D614G, Alpha, Beta, Gamma and Delta Spikes. We compared to plasma activity from participants receiving a short (4-weeks) interval regimen. Plasma from individuals of the long interval cohort recognized and neutralized better the Omicron Spike compared to those that received a short interval. Whether this difference confers any clinical benefit against Omicron remains unknown.

COVID-19 vaccination has been associated with anaphylaxis and hypersensitivity reactions. Infectious disease physicians and allergists in the Canadian Special Immunization Clinic (SIC) Network developed guidance for evaluating patients with adverse events following immunization (AEFI) including suspected hypersensitivity. This study evaluated management and adverse event recurrence following subsequent COVID-19 vaccinations.