BK
Brian Kobilka
Author with expertise in Structure and Function of G Protein-Coupled Receptors
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
83
(81% Open Access)
Cited by:
37,992
h-index:
136
/
i10-index:
339
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Activation and allosteric modulation of a muscarinic acetylcholine receptor

Andrew Kruse et al.Nov 19, 2013
Despite recent advances in crystallography and the availability of G-protein-coupled receptor (GPCR) structures, little is known about the mechanism of their activation process, as only the β2 adrenergic receptor (β2AR) and rhodopsin have been crystallized in fully active conformations. Here we report the structure of an agonist-bound, active state of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor stabilized by a G-protein mimetic camelid antibody fragment isolated by conformational selection using yeast surface display. In addition to the expected changes in the intracellular surface, the structure reveals larger conformational changes in the extracellular region and orthosteric binding site than observed in the active states of the β2AR and rhodopsin. We also report the structure of the M2 receptor simultaneously bound to the orthosteric agonist iperoxo and the positive allosteric modulator LY2119620. This structure reveals that LY2119620 recognizes a largely pre-formed binding site in the extracellular vestibule of the iperoxo-bound receptor, inducing a slight contraction of this outer binding pocket. These structures offer important insights into the activation mechanism and allosteric modulation of muscarinic receptors. Very little is known about how a G-protein-coupled receptor (GPCR) transitions from an inactive to an active state, but this study has solved the X-ray crystal structures of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to a high-affinity agonist in an active state and to a high-affinity agonist and a small-molecule allosteric modulator in an active state; the structures provide insights into the activation mechanism and allosteric modulation of muscarinic receptors. The structures of many G-protein-coupled receptors (GPCRs), including members of the class B and class F families, are now available but little is known about the transitions from the inactive to active states. In this study the authors solve the X-ray crystal structures of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor in the active state bound to the agonist iperoxo alone and in combination with LY2119620, a positive allosteric modulator. The structures reveal that the activated M2 receptor has an extremely small orthosteric binding site, with LY2119620 'sitting' right on top of the agonist. The authors also note that the region that makes up the allosteric site in the inactive conformation of the M2 receptor is too large to bind to LY2119620; this means that the extracellular region needs to contract (by binding to the high-affinity agonist) before LY2119620 can bind to the allosteric site. This GPCR is essential for the physiological control of cardiovascular function, cognition, and pain perception, and since allosteric sites are less conserved in sequence and structure than the orthosteric binding site, the hope is that ligands that bind to allosteric sites could be turned into drugs that selectively interact with only one of the five muscarinic receptor subtypes.
0

Structure-based discovery of opioid analgesics with reduced side effects

Aashish Manglik et al.Aug 16, 2016
Morphine is an alkaloid from the opium poppy used to treat pain. The potentially lethal side effects of morphine and related opioids—which include fatal respiratory depression—are thought to be mediated by μ-opioid-receptor (μOR) signalling through the β-arrestin pathway or by actions at other receptors. Conversely, G-protein μOR signalling is thought to confer analgesia. Here we computationally dock over 3 million molecules against the μOR structure and identify new scaffolds unrelated to known opioids. Structure-based optimization yields PZM21—a potent Gi activator with exceptional selectivity for μOR and minimal β-arrestin-2 recruitment. Unlike morphine, PZM21 is more efficacious for the affective component of analgesia versus the reflexive component and is devoid of both respiratory depression and morphine-like reinforcing activity in mice at equi-analgesic doses. PZM21 thus serves as both a probe to disentangle μOR signalling and a therapeutic lead that is devoid of many of the side effects of current opioids. Computational docking to the the μ-opioid-receptor identifies PZM21, a novel selective biased agonist that generates substantial affective analgesia in mice without altering respiration or inducing drug reinforcement. Morphine and other alkaloids from the opium poppy are μ-opioid receptor agonists that have been used to treat pain for many centuries. These authors used a computational approach to dock over three million small molecules to the μ-opioid receptor. Structure-based optimization of the most promising structures led to the identification of a potent agonist, PZM21, with exceptional subtype selectivity for the μ-opioid receptor. In mice, PZM21 generates substantial analgesia, which is fully ablated in μ-opioid receptor knockout animals. This small molecule seems to reduce the affective component of pain, without detectably altering reflexive behaviours, and has little effect on respiration.
0

Structural insights into μ-opioid receptor activation

Weijiao Huang et al.Aug 1, 2015
Activation of the μ-opioid receptor (μOR) is responsible for the efficacy of the most effective analgesics. To shed light on the structural basis for μOR activation, here we report a 2.1 Å X-ray crystal structure of the murine μOR bound to the morphinan agonist BU72 and a G protein mimetic camelid antibody fragment. The BU72-stabilized changes in the μOR binding pocket are subtle and differ from those observed for agonist-bound structures of the β2-adrenergic receptor (β2AR) and the M2 muscarinic receptor. Comparison with active β2AR reveals a common rearrangement in the packing of three conserved amino acids in the core of the μOR, and molecular dynamics simulations illustrate how the ligand-binding pocket is conformationally linked to this conserved triad. Additionally, an extensive polar network between the ligand-binding pocket and the cytoplasmic domains appears to play a similar role in signal propagation for all three G-protein-coupled receptors. X-ray crystallography and molecular dynamics simulations of the μ-opioid receptor reveal the conformational changes in the extracellular and intracellular domains of this G-protein-coupled receptor that are associated with its activation. The μ-opioid receptor is a G-protein-coupled receptor (GPCR) activated by various analgesics, endogenous endorphins and drugs of abuse such as heroin and opium. Our understanding of the mechanism by which agonist binding leads to recognition, coupling, and activation of a particular G protein subtype is incomplete. In two papers in this issue of Nature, the authors used X-ray crystallography, molecular dynamics simulations, and NMR spectroscopy to probe the structural basis for receptor activation. As well as revealing the conformational changes in the extracellular and intracellular domains of this GPCR associated with receptor activation, these studies help explain why the allosteric coupling between the agonist-binding pocket and the cytoplasmic G-protein-coupling interface of this receptor is relatively weak.
Load More