JZ
John‐Anker Zwart
Author with expertise in Migraine Pathophysiology and Treatment
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
25
h-index:
46
/
i10-index:
124
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
3

A Saturated Map of Common Genetic Variants Associated with Human Height from 5.4 Million Individuals of Diverse Ancestries

Loïc Yengo et al.Jan 10, 2022
+569
C
T
L
ABSTRACT Common SNPs are predicted to collectively explain 40-50% of phenotypic variation in human height, but identifying the specific variants and associated regions requires huge sample sizes. Here we show, using GWAS data from 5.4 million individuals of diverse ancestries, that 12,111 independent SNPs that are significantly associated with height account for nearly all of the common SNP-based heritability. These SNPs are clustered within 7,209 non-overlapping genomic segments with a median size of ~90 kb, covering ~21% of the genome. The density of independent associations varies across the genome and the regions of elevated density are enriched for biologically relevant genes. In out-of-sample estimation and prediction, the 12,111 SNPs account for 40% of phenotypic variance in European ancestry populations but only ~10%-20% in other ancestries. Effect sizes, associated regions, and gene prioritization are similar across ancestries, indicating that reduced prediction accuracy is likely explained by linkage disequilibrium and allele frequency differences within associated regions. Finally, we show that the relevant biological pathways are detectable with smaller sample sizes than needed to implicate causal genes and variants. Overall, this study, the largest GWAS to date, provides an unprecedented saturated map of specific genomic regions containing the vast majority of common height-associated variants.
3
Citation16
0
Save
0

Biological and clinical insights from genetics of insomnia symptoms

Jacqueline Lane et al.Feb 2, 2018
+39
Y
H
J
ABSTRACT Insomnia is a common disorder linked with adverse long-term medical and psychiatric outcomes, but underlying pathophysiological processes and causal relationships with disease are poorly understood. Here we identify 57 loci for self-reported insomnia symptoms in the UK Biobank (n=453,379) and confirm their impact on self-reported insomnia symptoms in the HUNT study (n=14,923 cases, 47,610 controls), physician diagnosed insomnia in Partners Biobank (n=2,217 cases, 14,240 controls), and accelerometer-derived measures of sleep efficiency and sleep duration in the UK Biobank (n=83,726). Our results suggest enrichment of genes involved in ubiquitin-mediated proteolysis, phototransduction and muscle development pathways and of genes expressed in multiple brain regions, skeletal muscle and adrenal gland. Evidence of shared genetic factors is found between frequent insomnia symptoms and restless legs syndrome, aging, cardio-metabolic, behavioral, psychiatric and reproductive traits. Evidence is found for a possible causal link between insomnia symptoms and coronary heart disease, depressive symptoms and subjective well-being. One Sentence Summary We identify 57 genomic regions associated with insomnia pointing to the involvement of phototransduction and ubiquitination and potential causal links to CAD and depression.
0
Citation9
0
Save
0

Meta-analysis of 375,000 individuals identifies 38 susceptibility loci for migraine

Padhraig Gormley et al.Nov 3, 2015
+107
B
V
P
Migraine is a debilitating neurological disorder affecting around 1 in 7 people worldwide, but its molecular mechanisms remain poorly understood. Some debate exists over whether migraine is a disease of vascular dysfunction, or a result of neuronal dysfunction with secondary vascular changes. Genome-wide association (GWA) studies have thus far identified 13 independent loci associated with migraine. To identify new susceptibility loci, we performed the largest genetic study of migraine to date, comprising 59,674 cases and 316,078 controls from 22 GWA studies. We identified 45 independent single nucleotide polymorphisms (SNPs) significantly associated with migraine risk (P < 5 x 10-8) that map to 38 distinct genomic loci, including 28 loci not previously reported and the first locus identified on chromosome X. Furthermore, a subset analysis for migraine without aura (MO) identified seven of the same loci as from the full sample, whereas no loci reached genome-wide significance in the migraine with aura (MA) subset. In subsequent computational analyzes, the identified loci showed enrichment for genes expressed in vascular and smooth muscle tissues, consistent with a predominant theory of migraine that highlights vascular etiologies.
0

Genome-wide association analysis of excessive daytime sleepiness identifies 42 loci that suggest phenotypic subgroups

Heming Wang et al.Oct 26, 2018
+42
K
Y
H
Excessive daytime sleepiness (EDS) affects 10-20% of the population and is associated with substantial functional deficits. We identified 42 loci for self-reported EDS in GWAS of 452,071 individuals from the UK Biobank, with enrichment for genes expressed in brain tissues and in neuronal transmission pathways. We confirmed the aggregate effect of a genetic risk score of 42 SNPs on EDS in independent Scandinavian cohorts and on other sleep disorders (restless leg syndrome, insomnia) and sleep traits (duration, chronotype, accelerometer-derived sleep efficiency and daytime naps or inactivity). Strong genetic correlations were also seen with obesity, coronary heart disease, psychiatric diseases, cognitive traits and reproductive ageing. EDS variants clustered into two predominant composite phenotypes - sleep propensity and sleep fragmentation - with the former showing stronger evidence for enriched expression in central nervous system tissues, suggesting two unique mechanistic pathways. Mendelian randomization analysis indicated that higher BMI is causally associated with EDS risk, but EDS does not appear to causally influence BMI.
0

Prevalence and risk of psychiatric disorders in young people: prospective cohort study exploring the role of childhood trauma (the HUNT study)

Helle Stangeland et al.Aug 8, 2024
+6
M
H
H
Background Better knowledge about childhood trauma as a risk factor for psychiatric disorders in young people could help strengthen the timeliness and effectiveness of prevention and treatment efforts. Aims To estimate the prevalence and risk of psychiatric disorders in young people following exposure to childhood trauma, including interpersonal violence. Method This prospective cohort study followed 8199 adolescents (age range 12–20 years) over 13–15 years, into young adulthood (age range 25–35 years). Data about childhood trauma exposure from adolescents participating in the Trøndelag Health Study (HUNT, 2006–2008) were linked to data about subsequent development of psychiatric disorders from the Norwegian Patient Registry (2008–2021). Results One in four (24.3%) adolescents were diagnosed with a psychiatric disorder by young adulthood. Regression analyses showed consistent and significant relationships between childhood exposure to both interpersonal violence and other potentially traumatic events, and subsequent psychiatric disorders and psychiatric comorbidity. The highest estimates were observed for childhood exposure to two or more types of interpersonal violence (polyvictimisation), and development of psychotic disorders (odds ratio 3.41, 95% CI 1.93–5.72), stress and adjustment disorders (odds ratio 4.20, 95% CI 3.05–5.71), personality disorders (odds ratio 3.98, 95% CI 2.70–5.76), alcohol-related disorders (odds ratio 3.28, 95% CI 2.06–5.04) and drug-related disorders (odds ratio 4.67, 95% CI 2.87–7.33). Conclusions These findings emphasise the importance of integrating knowledge about childhood trauma as a potent risk factor for psychopathology into the planning and implementation of services for children, adolescents and young adults.
0

HMG-CoA reductase is a potential therapeutic target for migraine: a mendelian randomization study

Kang Qu et al.May 27, 2024
+69
P
M
K
Abstract Statins are thought to have positive effects on migraine but existing data are inconclusive. We aimed to evaluate the causal effect of such drugs on migraines using Mendelian randomization. We used four types of genetic instruments as proxies for HMG-CoA reductase inhibition. We included the expression quantitative trait loci of the HMG-CoA reductase gene and genetic variation within or near the HMG-CoA reductase gene region. Variants were associated with low-density lipoprotein cholesterol, apolipoprotein B, and total cholesterol. Genome-wide association study summary data for the three lipids were obtained from the UK Biobank. Comparable data for migraine were obtained from the International Headache Genetic Consortium and the FinnGen Consortium. Inverse variance weighting method was used for the primary analysis. Additional analyses included pleiotropic robust methods, colocalization, and meta-analysis. Genetically determined high expression of HMG-CoA reductase was associated with an increased risk of migraines (OR = 1.55, 95% CI 1.30–1.84, P = 6.87 × 10 −7 ). Similarly, three genetically determined HMG-CoA reductase-mediated lipids were associated with an increased risk of migraine. These conclusions were consistent across meta-analyses. We found no evidence of bias caused by pleiotropy or genetic confounding factors. These findings support the hypothesis that statins can be used to treat migraine.