BC
Benjamin Cowling
Author with expertise in Influenza Virus Research and Epidemiology
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
60
(90% Open Access)
Cited by:
42,467
h-index:
107
/
i10-index:
550
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia

Qun Li et al.Jan 29, 2020
The initial cases of novel coronavirus (2019-nCoV)-infected pneumonia (NCIP) occurred in Wuhan, Hubei Province, China, in December 2019 and January 2020. We analyzed data on the first 425 confirmed cases in Wuhan to determine the epidemiologic characteristics of NCIP.We collected information on demographic characteristics, exposure history, and illness timelines of laboratory-confirmed cases of NCIP that had been reported by January 22, 2020. We described characteristics of the cases and estimated the key epidemiologic time-delay distributions. In the early period of exponential growth, we estimated the epidemic doubling time and the basic reproductive number.Among the first 425 patients with confirmed NCIP, the median age was 59 years and 56% were male. The majority of cases (55%) with onset before January 1, 2020, were linked to the Huanan Seafood Wholesale Market, as compared with 8.6% of the subsequent cases. The mean incubation period was 5.2 days (95% confidence interval [CI], 4.1 to 7.0), with the 95th percentile of the distribution at 12.5 days. In its early stages, the epidemic doubled in size every 7.4 days. With a mean serial interval of 7.5 days (95% CI, 5.3 to 19), the basic reproductive number was estimated to be 2.2 (95% CI, 1.4 to 3.9).On the basis of this information, there is evidence that human-to-human transmission has occurred among close contacts since the middle of December 2019. Considerable efforts to reduce transmission will be required to control outbreaks if similar dynamics apply elsewhere. Measures to prevent or reduce transmission should be implemented in populations at risk. (Funded by the Ministry of Science and Technology of China and others.).
0

Rational use of face masks in the COVID-19 pandemic

Luzhao Feng et al.Mar 20, 2020
Since the outbreak of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the virus that caused coronavirus disease 2019 (COVID-19), the use of face masks has become ubiquitous in China and other Asian countries such as South Korea and Japan. Some provinces and municipalities in China have enforced compulsory face mask policies in public areas; however, China's national guideline has adopted a risk-based approach in offering recommendations for using face masks among health-care workers and the general public. We compared face mask use recommendations by different health authorities (panel). Despite the consistency in the recommendation that symptomatic individuals and those in health-care settings should use face masks, discrepancies were observed in the general public and community settings.1WHOCoronavirus disease (COVID-19) advice for the public: when and how to use masks.https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public/when-and-how-to-use-masksDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar, 2State Council, ChinaGuidelines for the selection and use of different types of masks for preventing new coronavirus infection in different populations 2020 (in Chinese).http://www.gov.cn/xinwen/2020-02/05/content_5474774.htmDate: Feb 5, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar, 3The Department of Health, Hong KongGuidelines on prevention of coronavirus disease 2019 (COVID-19) for the general public.https://www.chp.gov.hk/files/pdf/nid_guideline_general_public_en.pdfDate: Mar 13, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar, 4Ministry of Health, SingaporeUpdates on COVID-19 (coronavirus disease 2019) local situation.https://www.moh.gov.sg/covid-19Date accessed: March 17, 2020Google Scholar, 5Ministry of HealthLabour and Wellfare, JapanQ & A on coronavirus 2019 (COVID-19): when should I wear a facemask?.https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00014.htmlDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar, 6CDCCoronavirus Disease 2019 (COVID-19): steps to prevent illness.https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/prevention-treatment.htmlDate accessed: March 17, 2020Google Scholar, 7National Health ServiceAre face masks useful for preventing coronavirus?.https://www.nhs.uk/conditions/coronavirus-covid-19/common-questions/Date: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar, 8Federal Ministry of Health, GermanyDaily updates on the coronavirus: is wearing a surgical mask, as protection against acute respiratory infections, useful for members of the general public?.https://www.bundesgesundheitsministerium.de/en/press/2020/coronavirus.htmlDate: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar For example, the US Surgeon General advised against buying masks for use by healthy people. One important reason to discourage widespread use of face masks is to preserve limited supplies for professional use in health-care settings. Universal face mask use in the community has also been discouraged with the argument that face masks provide no effective protection against coronavirus infection.PanelRecommendations on face mask use in community settingsWHO1WHOCoronavirus disease (COVID-19) advice for the public: when and how to use masks.https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public/when-and-how-to-use-masksDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar•If you are healthy, you only need to wear a mask if you are taking care of a person with suspected SARS-CoV-2 infection.China2State Council, ChinaGuidelines for the selection and use of different types of masks for preventing new coronavirus infection in different populations 2020 (in Chinese).http://www.gov.cn/xinwen/2020-02/05/content_5474774.htmDate: Feb 5, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar•People at moderate risk *People at moderate risk of infection include those working in areas of high population density (eg, hospitals, train stations), those have been or live with somebody who is quarantined, and administrative staff, police, security, and couriers whose work is related to COVID-19. of infection: surgical or disposable mask for medical use. *People at moderate risk of infection include those working in areas of high population density (eg, hospitals, train stations), those have been or live with somebody who is quarantined, and administrative staff, police, security, and couriers whose work is related to COVID-19.•People at low risk †People at low risk of infection include those staying in areas of high population density (eg, supermarket, shopping mall), who work indoors, who seek health care in medical institutions (other than fever clinics), and gatherings of children aged 3–6 years and school students. of infection: disposable mask for medical use. †People at low risk of infection include those staying in areas of high population density (eg, supermarket, shopping mall), who work indoors, who seek health care in medical institutions (other than fever clinics), and gatherings of children aged 3–6 years and school students.•People at very low risk ‡People at very low risk of infection include those who mostly stay at home, who do outdoor activities, and who work or study in well-ventilated areas. of infection: do not have to wear a mask or can wear non-medical mask (such as cloth mask). ‡People at very low risk of infection include those who mostly stay at home, who do outdoor activities, and who work or study in well-ventilated areas.Hong Kong3The Department of Health, Hong KongGuidelines on prevention of coronavirus disease 2019 (COVID-19) for the general public.https://www.chp.gov.hk/files/pdf/nid_guideline_general_public_en.pdfDate: Mar 13, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar•Surgical masks can prevent transmission of respiratory viruses from people who are ill. It is essential for people who are symptomatic (even if they have mild symptoms) to wear a surgical mask.•Wear a surgical mask when taking public transport or staying in crowded places. It is important to wear a mask properly and practice good hand hygiene before wearing and after removing a mask.Singapore4Ministry of Health, SingaporeUpdates on COVID-19 (coronavirus disease 2019) local situation.https://www.moh.gov.sg/covid-19Date accessed: March 17, 2020Google Scholar•Wear a mask if you have respiratory symptoms, such as a cough or runny nose.Japan5Ministry of HealthLabour and Wellfare, JapanQ & A on coronavirus 2019 (COVID-19): when should I wear a facemask?.https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00014.htmlDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar•The effectiveness of wearing a face mask to protect yourself from contracting viruses is thought to be limited. If you wear a face mask in confined, badly ventilated spaces, it might help avoid catching droplets emitted from others but if you are in an open-air environment, the use of face mask is not very efficient.USA6CDCCoronavirus Disease 2019 (COVID-19): steps to prevent illness.https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/prevention-treatment.htmlDate accessed: March 17, 2020Google Scholar•Centers for Disease Control and Prevention does not recommend that people who are well wear a face mask (including respirators) to protect themselves from respiratory diseases, including COVID-19.•US Surgeon General urged people on Twitter to stop buying face masks.UK7National Health ServiceAre face masks useful for preventing coronavirus?.https://www.nhs.uk/conditions/coronavirus-covid-19/common-questions/Date: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar•Face masks play a very important role in places such as hospitals, but there is very little evidence of widespread benefit for members of the public.Germany8Federal Ministry of Health, GermanyDaily updates on the coronavirus: is wearing a surgical mask, as protection against acute respiratory infections, useful for members of the general public?.https://www.bundesgesundheitsministerium.de/en/press/2020/coronavirus.htmlDate: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar•There is not enough evidence to prove that wearing a surgical mask significantly reduces a healthy person's risk of becoming infected while wearing it. According to WHO, wearing a mask in situations where it is not recommended to do so can create a false sense of security because it might lead to neglecting fundamental hygiene measures, such as proper hand hygiene. WHO1WHOCoronavirus disease (COVID-19) advice for the public: when and how to use masks.https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/advice-for-public/when-and-how-to-use-masksDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar •If you are healthy, you only need to wear a mask if you are taking care of a person with suspected SARS-CoV-2 infection. China2State Council, ChinaGuidelines for the selection and use of different types of masks for preventing new coronavirus infection in different populations 2020 (in Chinese).http://www.gov.cn/xinwen/2020-02/05/content_5474774.htmDate: Feb 5, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar •People at moderate risk *People at moderate risk of infection include those working in areas of high population density (eg, hospitals, train stations), those have been or live with somebody who is quarantined, and administrative staff, police, security, and couriers whose work is related to COVID-19. of infection: surgical or disposable mask for medical use. *People at moderate risk of infection include those working in areas of high population density (eg, hospitals, train stations), those have been or live with somebody who is quarantined, and administrative staff, police, security, and couriers whose work is related to COVID-19.•People at low risk †People at low risk of infection include those staying in areas of high population density (eg, supermarket, shopping mall), who work indoors, who seek health care in medical institutions (other than fever clinics), and gatherings of children aged 3–6 years and school students. of infection: disposable mask for medical use. †People at low risk of infection include those staying in areas of high population density (eg, supermarket, shopping mall), who work indoors, who seek health care in medical institutions (other than fever clinics), and gatherings of children aged 3–6 years and school students.•People at very low risk ‡People at very low risk of infection include those who mostly stay at home, who do outdoor activities, and who work or study in well-ventilated areas. of infection: do not have to wear a mask or can wear non-medical mask (such as cloth mask). ‡People at very low risk of infection include those who mostly stay at home, who do outdoor activities, and who work or study in well-ventilated areas. Hong Kong3The Department of Health, Hong KongGuidelines on prevention of coronavirus disease 2019 (COVID-19) for the general public.https://www.chp.gov.hk/files/pdf/nid_guideline_general_public_en.pdfDate: Mar 13, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar •Surgical masks can prevent transmission of respiratory viruses from people who are ill. It is essential for people who are symptomatic (even if they have mild symptoms) to wear a surgical mask.•Wear a surgical mask when taking public transport or staying in crowded places. It is important to wear a mask properly and practice good hand hygiene before wearing and after removing a mask. Singapore4Ministry of Health, SingaporeUpdates on COVID-19 (coronavirus disease 2019) local situation.https://www.moh.gov.sg/covid-19Date accessed: March 17, 2020Google Scholar •Wear a mask if you have respiratory symptoms, such as a cough or runny nose. Japan5Ministry of HealthLabour and Wellfare, JapanQ & A on coronavirus 2019 (COVID-19): when should I wear a facemask?.https://www.mhlw.go.jp/stf/seisakunitsuite/bunya/kenkou_iryou/dengue_fever_qa_00014.htmlDate: 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar •The effectiveness of wearing a face mask to protect yourself from contracting viruses is thought to be limited. If you wear a face mask in confined, badly ventilated spaces, it might help avoid catching droplets emitted from others but if you are in an open-air environment, the use of face mask is not very efficient. USA6CDCCoronavirus Disease 2019 (COVID-19): steps to prevent illness.https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/about/prevention-treatment.htmlDate accessed: March 17, 2020Google Scholar •Centers for Disease Control and Prevention does not recommend that people who are well wear a face mask (including respirators) to protect themselves from respiratory diseases, including COVID-19.•US Surgeon General urged people on Twitter to stop buying face masks. UK7National Health ServiceAre face masks useful for preventing coronavirus?.https://www.nhs.uk/conditions/coronavirus-covid-19/common-questions/Date: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar •Face masks play a very important role in places such as hospitals, but there is very little evidence of widespread benefit for members of the public. Germany8Federal Ministry of Health, GermanyDaily updates on the coronavirus: is wearing a surgical mask, as protection against acute respiratory infections, useful for members of the general public?.https://www.bundesgesundheitsministerium.de/en/press/2020/coronavirus.htmlDate: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar •There is not enough evidence to prove that wearing a surgical mask significantly reduces a healthy person's risk of becoming infected while wearing it. According to WHO, wearing a mask in situations where it is not recommended to do so can create a false sense of security because it might lead to neglecting fundamental hygiene measures, such as proper hand hygiene. However, there is an essential distinction between absence of evidence and evidence of absence. Evidence that face masks can provide effective protection against respiratory infections in the community is scarce, as acknowledged in recommendations from the UK and Germany.7National Health ServiceAre face masks useful for preventing coronavirus?.https://www.nhs.uk/conditions/coronavirus-covid-19/common-questions/Date: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar, 8Federal Ministry of Health, GermanyDaily updates on the coronavirus: is wearing a surgical mask, as protection against acute respiratory infections, useful for members of the general public?.https://www.bundesgesundheitsministerium.de/en/press/2020/coronavirus.htmlDate: 2020Date accessed: March 5, 2020Google Scholar However, face masks are widely used by medical workers as part of droplet precautions when caring for patients with respiratory infections. It would be reasonable to suggest vulnerable individuals avoid crowded areas and use surgical face masks rationally when exposed to high-risk areas. As evidence suggests COVID-19 could be transmitted before symptom onset, community transmission might be reduced if everyone, including people who have been infected but are asymptomatic and contagious, wear face masks. Recommendations on face masks vary across countries and we have seen that the use of masks increases substantially once local epidemics begin, including the use of N95 respirators (without any other protective equipment) in community settings. This increase in use of face masks by the general public exacerbates the global supply shortage of face masks, with prices soaring,9WHOShortage of personal protective equipment endangering health workers worldwide.https://www.who.int/news-room/detail/03-03-2020-shortage-of-personal-protective-equipment-endangering-health-workers-worldwideDate: March 3, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar and risks supply constraints to frontline health-care professionals. As a response, a few countries (eg, Germany and South Korea) banned exportation of face masks to prioritise local demand.10Tsang A EU seeks solidarity as nations restrict medical exports.https://www.nytimes.com/2020/03/07/business/eu-exports-medical-equipment.htmlDate: March 7, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar WHO called for a 40% increase in the production of protective equipment, including face masks.9WHOShortage of personal protective equipment endangering health workers worldwide.https://www.who.int/news-room/detail/03-03-2020-shortage-of-personal-protective-equipment-endangering-health-workers-worldwideDate: March 3, 2020Date accessed: March 17, 2020Google Scholar Meanwhile, health authorities should optimise face mask distribution to prioritise the needs of frontline health-care workers and the most vulnerable populations in communities who are more susceptible to infection and mortality if infected, including older adults (particularly those older than 65 years) and people with underlying health conditions. People in some regions (eg, Thailand, China, and Japan) opted for makeshift alternatives or repeated usage of disposable surgical masks. Notably, improper use of face masks, such as not changing disposable masks, could jeopardise the protective effect and even increase the risk of infection. Consideration should also be given to variations in societal and cultural paradigms of mask usage. The contrast between face mask use as hygienic practice (ie, in many Asian countries) or as something only people who are unwell do (ie, in European and North American countries) has induced stigmatisation and racial aggravations, for which further public education is needed. One advantage of universal use of face masks is that it prevents discrimination of individuals who wear masks when unwell because everybody is wearing a mask. It is time for governments and public health agencies to make rational recommendations on appropriate face mask use to complement their recommendations on other preventive measures, such as hand hygiene. WHO currently recommends that people should wear face masks if they have respiratory symptoms or if they are caring for somebody with symptoms. Perhaps it would also be rational to recommend that people in quarantine wear face masks if they need to leave home for any reason, to prevent potential asymptomatic or presymptomatic transmission. In addition, vulnerable populations, such as older adults and those with underlying medical conditions, should wear face masks if available. Universal use of face masks could be considered if supplies permit. In parallel, urgent research on the duration of protection of face masks, the measures to prolong life of disposable masks, and the invention on reusable masks should be encouraged. Taiwan had the foresight to create a large stockpile of face masks; other countries or regions might now consider this as part of future pandemic plans. We declare no competing interests. Editorial note: the Lancet Group takes a neutral position with respect to territorial claims in published maps and institutional affiliations.
0
Citation1,361
0
Save
0

Impact assessment of non-pharmaceutical interventions against coronavirus disease 2019 and influenza in Hong Kong: an observational study

Benjamin Cowling et al.Apr 17, 2020
BackgroundA range of public health measures have been implemented to suppress local transmission of coronavirus disease 2019 (COVID-19) in Hong Kong. We examined the effect of these interventions and behavioural changes of the public on the incidence of COVID-19, as well as on influenza virus infections, which might share some aspects of transmission dynamics with COVID-19.MethodsWe analysed data on laboratory-confirmed COVID-19 cases, influenza surveillance data in outpatients of all ages, and influenza hospitalisations in children. We estimated the daily effective reproduction number (Rt) for COVID-19 and influenza A H1N1 to estimate changes in transmissibility over time. Attitudes towards COVID-19 and changes in population behaviours were reviewed through three telephone surveys done on Jan 20–23, Feb 11–14, and March 10–13, 2020.FindingsCOVID-19 transmissibility measured by Rt has remained at approximately 1 for 8 weeks in Hong Kong. Influenza transmission declined substantially after the implementation of social distancing measures and changes in population behaviours in late January, with a 44% (95% CI 34–53%) reduction in transmissibility in the community, from an estimated Rt of 1·28 (95% CI 1·26–1·30) before the start of the school closures to 0·72 (0·70–0·74) during the closure weeks. Similarly, a 33% (24–43%) reduction in transmissibility was seen based on paediatric hospitalisation rates, from an Rt of 1·10 (1·06–1·12) before the start of the school closures to 0·73 (0·68–0·77) after school closures. Among respondents to the surveys, 74·5%, 97·5%, and 98·8% reported wearing masks when going out, and 61·3%, 90·2%, and 85·1% reported avoiding crowded places in surveys 1 (n=1008), 2 (n=1000), and 3 (n=1005), respectively.InterpretationOur study shows that non-pharmaceutical interventions (including border restrictions, quarantine and isolation, distancing, and changes in population behaviour) were associated with reduced transmission of COVID-19 in Hong Kong, and are also likely to have substantially reduced influenza transmission in early February, 2020.FundingHealth and Medical Research Fund, Hong Kong.
0

Hand, foot, and mouth disease in China, 2008–12: an epidemiological study

Weijia Xing et al.Feb 1, 2014
BackgroundHand, foot, and mouth disease is a common childhood illness caused by enteroviruses. Increasingly, the disease has a substantial burden throughout east and southeast Asia. To better inform vaccine and other interventions, we characterised the epidemiology of hand, foot, and mouth disease in China on the basis of enhanced surveillance.MethodsWe extracted epidemiological, clinical, and laboratory data from cases of hand, foot, and mouth disease reported to the Chinese Center for Disease Control and Prevention between Jan 1, 2008, and Dec 31, 2012. We then compiled climatic, geographical, and demographic information. All analyses were stratified by age, disease severity, laboratory confirmation status, and enterovirus serotype.FindingsThe surveillance registry included 7 200 092 probable cases of hand, foot, and mouth disease (annual incidence, 1·2 per 1000 person-years from 2010–12), of which 267 942 (3·7%) were laboratory confirmed and 2457 (0·03%) were fatal. Incidence and mortality were highest in children aged 12–23 months (38·2 cases per 1000 person-years and 1·5 deaths per 100 000 person-years in 2012). Median duration from onset to diagnosis was 1·5 days (IQR 0·5–2·5) and median duration from onset to death was 3·5 days (2·5–4·5). The absolute number of patients with cardiopulmonary or neurological complications was 82 486 (case-severity rate 1·1%), and 2457 of 82486 patients with severe disease died (fatality rate 3·0%); 1617 of 1737 laboratory confirmed deaths (93%) were associated with enterovirus 71. Every year in June, hand, foot, and mouth disease peaked in north China, whereas southern China had semiannual outbreaks in May and September–October. Geographical differences in seasonal patterns were weakly associated with climate and demographic factors (variance explained 8–23% and 3–19%, respectively).InterpretationThis is the largest population-based study up to now of the epidemiology of hand, foot, and mouth disease. Future mitigation policies should take into account the heterogeneities of disease burden identified. Additional epidemiological and serological studies are warranted to elucidate the dynamics and immunity patterns of local hand, foot, and mouth disease and to optimise interventions.FundingChina–US Collaborative Program on Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, WHO, The Li Ka Shing Oxford Global Health Programme and Wellcome Trust, Harvard Center for Communicable Disease Dynamics, and Health and Medical Research Fund, Government of Hong Kong Special Administrative Region.
0
Citation826
0
Save
0

The Age-Specific Cumulative Incidence of Infection with Pandemic Influenza H1N1 2009 Was Similar in Various Countries Prior to Vaccination

Heath Kelly et al.Aug 5, 2011
Background During the influenza pandemic of 2009 estimates of symptomatic and asymptomatic infection were needed to guide vaccination policies and inform other control measures. Serological studies are the most reliable way to measure influenza infection independent of symptoms. We reviewed all published serological studies that estimated the cumulative incidence of infection with pandemic influenza H1N1 2009 prior to the initiation of population-based vaccination against the pandemic strain. Methodology and Principal Findings We searched for studies that estimated the cumulative incidence of pandemic influenza infection in the wider community. We excluded studies that did not include both pre- and post-pandemic serological sampling and studies that included response to vaccination. We identified 47 potentially eligible studies and included 12 of them in the review. Where there had been a significant first wave, the cumulative incidence of pandemic influenza infection was reported in the range 16%–28% in pre-school aged children, 34%–43% in school aged children and 12%–15% in young adults. Only 2%–3% of older adults were infected. The proportion of the entire population infected ranged from 11%–18%. We re-estimated the cumulative incidence to account for the small proportion of infections that may not have been detected by serology, and performed direct age-standardisation to the study population. For those countries where it could be calculated, this suggested a population cumulative incidence in the range 11%–21%. Conclusions and Significance Around the world, the cumulative incidence of infection (which is higher than the cumulative incidence of clinical disease) was below that anticipated prior to the pandemic. Serological studies need to be routine in order to be sufficiently timely to provide support for decisions about vaccination.
0

Evolving epidemiology and transmission dynamics of coronavirus disease 2019 outside Hubei province, China: a descriptive and modelling study

Juanjuan Zhang et al.Apr 2, 2020
BackgroundThe coronavirus disease 2019 (COVID-19) epidemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), began in Wuhan city, Hubei province, in December, 2019, and has spread throughout China. Understanding the evolving epidemiology and transmission dynamics of the outbreak beyond Hubei would provide timely information to guide intervention policy.MethodsWe collected individual information from official public sources on laboratory-confirmed cases reported outside Hubei in mainland China for the period of Jan 19 to Feb 17, 2020. We used the date of the fourth revision of the case definition (Jan 27) to divide the epidemic into two time periods (Dec 24 to Jan 27, and Jan 28 to Feb 17) as the date of symptom onset. We estimated trends in the demographic characteristics of cases and key time-to-event intervals. We used a Bayesian approach to estimate the dynamics of the net reproduction number (Rt) at the provincial level.FindingsWe collected data on 8579 cases from 30 provinces. The median age of cases was 44 years (33–56), with an increasing proportion of cases in younger age groups and in elderly people (ie, aged >64 years) as the epidemic progressed. The mean time from symptom onset to hospital admission decreased from 4·4 days (95% CI 0·0–14·0) for the period of Dec 24 to Jan 27, to 2·6 days (0·0–9·0) for the period of Jan 28 to Feb 17. The mean incubation period for the entire period was estimated at 5·2 days (1·8–12·4) and the mean serial interval at 5·1 days (1·3–11·6). The epidemic dynamics in provinces outside Hubei were highly variable but consistently included a mixture of case importations and local transmission. We estimated that the epidemic was self-sustained for less than 3 weeks, with mean Rt reaching peaks between 1·08 (95% CI 0·74–1·54) in Shenzhen city of Guangdong province and 1·71 (1·32–2·17) in Shandong province. In all the locations for which we had sufficient data coverage of Rt, Rt was estimated to be below the epidemic threshold (ie, <1) after Jan 30.InterpretationOur estimates of the incubation period and serial interval were similar, suggesting an early peak of infectiousness, with possible transmission before the onset of symptoms. Our results also indicate that, as the epidemic progressed, infectious individuals were isolated more quickly, thus shortening the window of transmission in the community. Overall, our findings indicate that strict containment measures, movement restrictions, and increased awareness of the population might have contributed to interrupt local transmission of SARS-CoV-2 outside Hubei province.FundingNational Science Fund for Distinguished Young Scholars, National Institute of General Medical Sciences, and European Commission Horizon 2020.
Load More