YW
Yongdong Wang
Author with expertise in Evolution and Classification of Flowering Plants
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
10
(40% Open Access)
Cited by:
201
h-index:
33
/
i10-index:
134
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Bioorthogonal labeling and enrichment of histone monoaminylation reveal its accumulation and regulatory function in cancer cell chromatin

Nan Zhang et al.Mar 20, 2024
Abstract Histone monoaminylation ( i . e ., serotonylation and dopaminylation) is an emerging category of epigenetic mark occurring on the fifth glutamine (Q5) residue of H3 N-terminal tail, which plays significant roles in gene transcription. Current analysis of histone monoaminylation is mainly based on site-specific antibodies and mass spectrometry, which either lacks high resolution or is time-consuming. In this study, we report the development of chemical probes for bioorthogonal labeling and enrichment of histone serotonylation and dopaminylation. These probes were successfully applied for the monoaminylation analysis of in vitro biochemical assays, cells, and tissue samples. The enrichment of monoaminylated histones by the probes further confirmed the crosstalk between H3Q5 monoaminylation and H3K4 methylation. Finally, combining the ex vivo and in vitro analyses based on the developed probes, we have shown that both histone serotonylation and dopaminylation are highly enriched in tumor tissues that overexpress transglutaminase 2 (TGM2) and regulate the three-dimensional architecture of cellular chromatin. TOC
0
Citation2
0
Save
0

三叠纪末期四川盆地湖泊风暴记录及其驱动机制

Jianli Ceng et al.May 1, 2024
风暴岩是由风暴形成的事件性沉积序列. 风暴的形成理论上要求水体温度26.5 ℃ 以上. 由于宽度和水温的限制, 湖泊上空不太可能形成热带气旋并出现风暴岩. 四川盆地上三叠统须家河组为一套辫状河三角洲-湖泊相建造, 近年来广泛报导有风暴沉积记录. 广元紫兰坝剖面须五段古土壤层面的原位树木化石材料提供了风暴的新证据. 9例材料中6份原位树木的倒塌方向集中呈北西向, 与下伏地层中古水流数据相反, 推测广元地区三叠纪末期曾盛行东南风. 新店子剖面和四川盆地须家河组内砂岩内普遍发育有呈撕裂状或具塑性变形的泥砾. 泥砾无搬运痕迹, 显"八"字型特征, 被解释为风暴滞留沉积. 表明须家河组沉积时期曾普遍受到风暴作用的影响. 晚三叠世期间盛行 "巨型季风" 气候, "巨型季风" 因其表面风最大风速低, 并非四川盆地须家河组风暴沉积的原因. "巨型季风" 气候体制下, 须家河组风暴岩的驱动机制是特提斯洋上空热带气旋东移登陆四川盆地西缘的结果. 环特提斯域风暴岩对比统计数据显示, 三叠纪末期特提斯低纬度地区普遍出现大规模风暴潮, 四川盆地须家河组顶部广泛出现的风暴岩很可能是三叠纪末期极热事件的沉积响应.
0

The effect of different amendments on Cd availability and bacterial community after three-year consecutive application in Cd-contaminated paddy soils

Huagang Huang et al.Jun 26, 2024
In situ immobilization is a widely used measure for passivating Cd-contaminated soils. Amendments need to be continuously applied to achieve stable remediation effects. However, few studies have evaluated the impact of consecutive application of amendments on soil health and the microecological environment. A field experiment was conducted in a Cd-contaminated paddy (available Cd concentration 0.40 mg kg-1) on the Chengdu Plain to investigate the changes in soil Cd availability and response characteristics of soil bacterial communities after consecutive application of rice straw biochar (SW), fly ash (FM) and marble powder (YH) amendments from 2018 to 2020. Compared with control treatment without amendments (CK), soil pH increased by 0.6, 0.5 and 1.5 under SW, FM and YH amendments, respectively, and the soil available Cd concentration decreased by 10.71%, 21.42% and 25.00%, respectively. The Cd concentration in rice grain was less than 0.2 mg kg-1 under YH amendment, which was within the Chinese Contaminant Limit in Food of National Food Safety Standards (GB2762-2022) in the second and third years. The three amendments had different effects on the transformation of Cd fractions in soil, which may be relevant to the specific bacterial communities shaped under different treatments. The proportion of Fe-Mn oxide-bound fraction Cd (OX-Cd) increased by 11% under YH treatment, which may be due to the promotion of Fe(III) and Cd binding by some enriched iron-oxidizing bacteria, such as Lysobacter, uncultured_Pelobacter sp. and Sulfurifusis. Candidatus_Tenderia and Sideroxydans were enriched under SW and FM amendments, respectively, and were likely beneficial for reducing Cd availability in soil through Cd immobilization. These results revealed the significance of the bacterial community in soil Cd immobilization after consecutive application of amendments and highlighted the potential of applying YH amendment to ensure the safe production of rice in Cd-contaminated soil.
0

The Early Cretaceous tree fern Acanthopteris (Dicksoniaceae): New insight into fossil records, species diversity, palaeogeography and palaeoclimate

Meng Yuan et al.May 29, 2024
Acanthopteris is a fossil fern genus that was established by H.C. Sze in 1931 based on leaf remains from the Lower Cretaceous of the Fuxin Basin in Liaoning Province, China. Traditionally, Acanthopteris is considered to belong to the tree fern family Dicksoniaceae and has been mainly found in the Lower Cretaceous of Fuxin Basin, Huolinhe Basin, and other coeval basins in Northeast China. Since this genus was founded, five fossil species have been described, including A. gothani Sze, A. acutata (Samylina) Zhang, A. alata (Fontaine) Zhang, A. onychioides (Vassilevskaja et Kara-Mursa) Zhang, and A. szei Cao. Based on reinvestigations on the newly collected fossil specimens of Acanthopteris, a reassessment of the systematics, fossil record and the examination of other specimens data is performed by using both morphological and cluster analysis approaches. The emendation of generic diagnosis of Acanthopteris is provided herein. Geographically, Acanthopteris shows limited distribution in North and NE China, Siberia and the Inner Zone of Japan. Compared to other period of the Cretaceous, Acanthopteris is restricted to the Aptian-Albian period, representing a climate index fossil for a warm and humid climate condition of tropical to subtropical zones during the Early Cretaceous.
0
0
Save
0

Spatial distribution patterns and drivers of above- and below- biomass in Chinese terrestrial ecosystems

Yusen Chen et al.Sep 1, 2024
Unraveling the dynamics of the global carbon cycle and assessing the sustainability of terrestrial ecosystems are critically dependent on a comprehensive understanding of vegetation biomass. This exploration delves into the pivotal role of biomass within vegetation communities, emphasizing its impact on ecosystem health, productivity, and community structure development. These insights are invaluable for advancing ecological science and conservation efforts. The synthesis of aboveground (AGB) and belowground (BGB) biomass data from 4485 and 3442 locations across China, respectively, collates a wide range of published sources. Integrating this extensive dataset with environmental parameters and applying advanced machine learning techniques facilitated an in-depth analysis of AGB and BGB spatial patterns within China. Techniques such as variance decomposition analysis and piecewise structural equation modeling were employed to dissect the factors contributing to the spatial variability of vegetation biomass. Significant spatial heterogeneity in biomass distribution was uncovered, with vegetation biomass in the northwest markedly lower than in the southern and northeastern regions. It was observed that AGB consistently surpassed BGB. Climatic conditions, soil characteristics, and soil nutrients were found to significantly explain 53 % and 48 % of the total variance in AGB and BGB, respectively. Specifically, solar radiation and soil total nitrogen were identified as critical factors influencing variations in AGB and BGB. The findings offer profound contributions to the understanding of the global carbon balance and the evaluation of terrestrial ecosystems sustainability. Moreover, they provide essential insights into the ecosystems' response mechanisms to global changes, serving as a fundamental reference for future studies on terrestrial ecosystem carbon cycling and carbon sequestration potentials.