JA
Jelle Atema
Author with expertise in Impacts of Climate Change on Marine Fisheries
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(50% Open Access)
Cited by:
428
h-index:
58
/
i10-index:
139
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Smelling home can prevent dispersal of reef fish larvae

Gabriele Gerlach et al.Jan 10, 2007
+2
M
J
G
Many marine fish and invertebrates show a dual life history where settled adults produce dispersing larvae. The planktonic nature of the early larval stages suggests a passive dispersal model where ocean currents would quickly cause panmixis over large spatial scales and prevent isolation of populations, a prerequisite for speciation. However, high biodiversity and species abundance in coral reefs contradict this panmixis hypothesis. Although ocean currents are a major force in larval dispersal, recent studies show far greater retention than predicted by advection models. We investigated the role of animal behavior in retention and homing of coral reef fish larvae resulting in two important discoveries: ( i ) Settling larvae are capable of olfactory discrimination and prefer the odor of their home reef, thereby demonstrating to us that nearby reefs smell different. ( ii ) Whereas one species showed panmixis as predicted from our advection model, another species showed significant genetic population substructure suggestive of strong homing. Thus, the smell of reefs could allow larvae to choose currents that return them to reefs in general and natal reefs in particular. As a consequence, reef populations can develop genetic differences that might lead to reproductive isolation.
0
Paper
Citation428
0
Save
0

Sex matters in Massive Parallel Sequencing: Evidence for biases in genetic parameter estimation and investigation of sex determination systems

Laura Benestan et al.Dec 22, 2016
+11
B
J
L
Using massively parallel sequencing data from two species with different life history traits -- American lobster (Homarus americans) and Arctic Char (Salvelinus alpinus) -- we highlighted how an unbalanced sex ratio in the samples combined with a few sex-linked markers may lead to false interpretations of population structure and thus to potentially erroneous management recommendations. Multivariate analyses revealed two genetic clusters that separated males and females instead of showing the expected pattern of genetic differentiation among ecologically divergent (inshore vs. offshore in lobster) or geographically distant (east vs. west in Arctic Char) sampling locations. We created several subsamples artificially varying the sex ratio in the inshore/offshore and east/west groups, and then demonstrated that significant genetic differentiation could be observed despite panmixia for lobster, and that Fst values were overestimated for Arctic Char. This pattern was due to 12 and 94 sex-linked markers driving differentiation for lobster and Arctic Char, respectively. Removing sex-linked markers led to non- significant genetic structure (lobster) and a more accurate estimation of Fst (Arctic Char). We further characterized the putative functions of sex-linked markers. Given that only 9.6% of all marine/diadromous population genomic studies to date reported sex information, we urge researchers to collect and consider individual sex information. In summary, we argue that sex information is useful to (i) control sex ratio in sampling, (ii) overcome sex-ratio biases that can lead to spurious genetic differentiation signals and (iii) fill knowledge gaps regarding sex determining systems.