MW
Megan Wind‐Rotolo
Author with expertise in Renal Cell Carcinoma
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
15
(80% Open Access)
Cited by:
8,321
h-index:
41
/
i10-index:
71
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Interplay of somatic alterations and immune infiltration modulates response to PD-1 blockade in advanced clear cell renal cell carcinoma

David Braun et al.May 29, 2020
PD-1 blockade has transformed the management of advanced clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), but the drivers and resistors of the PD-1 response remain incompletely elucidated. Here, we analyzed 592 tumors from patients with advanced ccRCC enrolled in prospective clinical trials of treatment with PD-1 blockade by whole-exome and RNA sequencing, integrated with immunofluorescence analysis, to uncover the immunogenomic determinants of the therapeutic response. Although conventional genomic markers (such as tumor mutation burden and neoantigen load) and the degree of CD8+ T cell infiltration were not associated with clinical response, we discovered numerous chromosomal alterations associated with response or resistance to PD-1 blockade. These advanced ccRCC tumors were highly CD8+ T cell infiltrated, with only 27% having a non-infiltrated phenotype. Our analysis revealed that infiltrated tumors are depleted of favorable PBRM1 mutations and enriched for unfavorable chromosomal losses of 9p21.3, as compared with non-infiltrated tumors, demonstrating how the potential interplay of immunophenotypes with somatic alterations impacts therapeutic efficacy.
0
Citation631
0
Save
0

Residual Human Immunodeficiency Virus Type 1 Viremia in Some Patients on Antiretroviral Therapy Is Dominated by a Small Number of Invariant Clones Rarely Found in Circulating CD4 + T Cells

Justin Bailey et al.Jun 15, 2006
ABSTRACT Antiretroviral therapy can reduce human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) viremia to below the detection limit of ultrasensitive clinical assays (50 copies of HIV-1 RNA/ml). However, latent HIV-1 persists in resting CD4 + T cells, and low residual levels of free virus are found in the plasma. Limited characterization of this residual viremia has been done because of the low number of virions per sample. Using intensive sampling, we analyzed residual viremia and compared these viruses to latent proviruses in resting CD4 + T cells in peripheral blood. For each patient, we found some viruses in the plasma that were identical to viruses in resting CD4 + T cells by pol gene sequencing. However, in a majority of patients, the most common viruses in the plasma were rarely found in resting CD4 + T cells even when the resting cell compartment was analyzed with assays that detect replication-competent viruses. Despite the large diversity of pol sequences in resting CD4 + T cells, the residual viremia was dominated by a homogeneous population of viruses with identical pol sequences. In the most extensively studied case, a predominant plasma sequence was also found in analysis of the env gene, and linkage by long-distance reverse transcriptase PCR established that these predominant plasma sequences represented a single predominant plasma virus clone. The predominant plasma clones were released for months to years without evident sequence change. Thus, in some patients on antiretroviral therapy, the major mechanism for residual viremia involves prolonged production of a small number of viral clones without evident evolution, possibly by cells other than circulating CD4 + T cells.
0
Citation405
0
Save
0

A Randomized, Double-Blind, Placebo-Controlled Assessment of BMS-936558, a Fully Human Monoclonal Antibody to Programmed Death-1 (PD-1), in Patients with Chronic Hepatitis C Virus Infection

David Gardiner et al.May 22, 2013
Expression of the programmed death 1 (PD-1) receptor and its ligands are implicated in the T cell exhaustion phenotype which contributes to the persistence of several chronic viral infections, including human hepatitis C virus (HCV). The antiviral potential of BMS-936558 (MDX-1106) - a fully human anti-PD-1 monoclonal immunoglobulin-G4 that blocks ligand binding - was explored in a proof-of-concept, placebo-controlled single-ascending-dose study in patients (N = 54) with chronic HCV infection. Interferon-alfa treatment-experienced patients (n = 42) were randomized 5∶1 to receive a single infusion of BMS-936558 (0.03, 0.1, 0.3, 1.0, 3.0 mg/kg [n = 5 each] or 10 mg/kg [n = 10]) or of placebo (n = 7). An additional 12 HCV treatment-naïve patients were randomized to receive 10 mg/kg BMS-936558 (n = 10) or placebo (n = 2). Patients were followed for 85 days post-dose. Five patients who received BMS-936558 (0.1 [n = 1] or 10 mg/kg) and one placebo patient achieved the primary study endpoint of a reduction in HCV RNA ≥0.5 log10 IU/mL on at least 2 consecutive visits; 3 (10 mg/kg) achieved a >4 log10 reduction. Two patients (10 mg/kg) achieved HCV RNA below the lower limit of quantitation (25 IU/mL), one of whom (a prior null-responder) remained RNA-undetectable 1 year post-study. Transient reductions in CD4(+), CD8(+) and CD19(+) cells, including both naïve and memory CD4(+) and CD8(+) subsets, were observed at Day 2 without evidence of immune deficit. No clinically relevant changes in immunoglobulin subsets or treatment-related trends in circulating cytokines were noted. BMS-936558 exhibited dose-related exposure increases, with a half-life of 20-24 days. BMS-936558 was mostly well tolerated. One patient (10 mg/kg) experienced an asymptomatic grade 4 ALT elevation coincident with the onset of a 4-log viral load reduction. Six patients exhibited immune-related adverse events of mild-to-moderate intensity, including two cases of hyperthyroidism consistent with autoimmune thyroiditis. Further investigation of PD-1 pathway blockade in chronic viral disease is warranted.ClinicalTrials.gov NCT00703469.
0
Citation222
0
Save
0

Efficacy of an Interferon- and Ribavirin-Free Regimen of Daclatasvir, Asunaprevir, and BMS-791325 in Treatment-Naive Patients With HCV Genotype 1 Infection

Gregory Everson et al.Oct 30, 2013
The combination of peginterferon and ribavirin with telaprevir or boceprevir is the standard treatment of hepatitis C virus (HCV) genotype 1 infection. However, these drugs are not well tolerated because of their side effects and suboptimal virologic responses. In a phase 2a, open-label study, we examined the safety and efficacy of an interferon-free, ribavirin-free regimen of direct-acting antivirals, comprising daclatasvir (an NS5A replication complex inhibitor), asunaprevir (an NS3 protease inhibitor), and BMS-791325 (a non-nucleoside NS5B inhibitor), in patients with chronic HCV infection.We analyzed data from 66 treatment-naive patients with HCV genotype 1 infection without cirrhosis who were assigned randomly to groups given daclatasvir (60 mg, once daily), asunaprevir (200 mg, twice daily), and BMS-791325 (75 or 150 mg, twice daily) for 12 or 24 weeks. The primary end point was an HCV-RNA level less than 25 IU/mL at 12 weeks after treatment (sustained virologic response at 12 weeks [SVR12]).In 64 patients, HCV-RNA levels were less than 25 IU/mL by week 4 of treatment (including 48 of 49 patients with HCV genotype 1a infection and 45 of 46 patients with the non-CC interleukin 28B genotype). Sixty-one patients (92%) achieved SVR12, based on a modified intention-to-treat analysis. Virologic responses were similar between 12 and 24 weeks of treatment. During the study, 2 patients experienced viral breakthrough and 1 patient relapsed. There were no grade 3-4 increases in levels of alanine or aspartate aminotransferases or bilirubin; there were no deaths or discontinuations resulting from serious adverse events or adverse events related to the treatment regimen. The most common adverse events were headache, asthenia, and gastrointestinal symptoms.In a phase 2a study, the all-oral, interferon-free, and ribavirin-free regimen of daclatasvir, asunaprevir, and BMS-791325 was well tolerated and achieved high rates of SVR12 in patients with HCV genotype 1 infection. Further studies of this regimen are warranted. ClinicalTrials.gov, number NCT01455090.
0

Integrative Molecular Characterization of Sarcomatoid and Rhabdoid Renal Cell Carcinoma Reveals Determinants of Poor Prognosis and Response to Immune Checkpoint Inhibitors

Ziad Bakouny et al.May 30, 2020
Abstract Sarcomatoid and rhabdoid (S/R) renal cell carcinoma (RCC) are highly aggressive tumors with limited molecular and clinical characterization. Emerging evidence suggests immune checkpoint inhibitors (ICI) are particularly effective for these tumors 1–3 , although the biological basis for this property is largely unknown. Here, we evaluate multiple clinical trial and real-world cohorts of S/R RCC to characterize their molecular features, clinical outcomes, and immunologic characteristics. We find that S/R RCC tumors harbor distinctive molecular features that may account for their aggressive behavior, including BAP1 mutations, CDKN2A deletions, and increased expression of MYC transcriptional programs. We show that these tumors are highly responsive to ICI and that they exhibit an immune-inflamed phenotype characterized by immune activation, increased cytotoxic immune infiltration, upregulation of antigen presentation machinery genes, and PD-L1 expression. Our findings shed light on the molecular drivers of aggressivity and responsiveness to immune checkpoint inhibitors of S/R RCC tumors.
0
Citation3
0
Save
Load More