Abstract Expansion of the available repertoire of reagents for visualization and manipulation of proteins will help understand their function. Short epitope tags linked to proteins of interest and recognized by existing binders such as nanobodies facilitate protein studies by obviating the need to isolate new antibodies directed against them. Nanobodies have several advantages over conventional antibodies, as they can be expressed and used as tools for visualization and manipulation of proteins in vivo . Here, we characterize two short (<15 aa) NanoTag epitopes, 127D01 and VHH05) and their corresponding high-affinity nanobodies. We demonstrate their use in Drosophila for in vivo protein detection and re-localization, direct and indirect immunofluorescence, immunoblotting, and immunoprecipitation. We further show that CRISPR-mediated gene targeting provides a straightforward approach to tagging endogenous proteins with the NanoTags. Single copies of the NanoTags, regardless of their location, suffice for detection. This versatile and validated toolbox of tags and nanobodies will serve as a resource for a wide array of applications, including functional studies in Drosophila and beyond.

A new coronavirus SARS-CoV-2, recently discovered in Wuhan, China, has caused over 74000 infection cases and 2000 deaths. Due to the rapidly growing cases and the unavailability of specific therapy, there is a desperate need for vaccines to combat the epidemic of SARS-CoV-2. In the present study, we performed an in silico approach based on the available virus genome to identify the antigenic B-cell epitopes and human-leukocyte-antigen (HLA) restricted T-cell epitopes. A total of 61 B-cell epitopes were initially identified, 19 of which with higher potential immunogenicity were used for vaccine design. 499 T-cell epitopes were predicted that showed affinity with the 34 most popular HLA alleles in Chinese population. Based on these epitopes, 30 vaccine candidates were designed and inspected against safety risks, including potential toxicity, human homologous, pharmaceutical peptides and bioactive peptides. Majority of vaccine peptides contained both B-cell and T-cell epitopes, which may interact with the most prevalent HLA alleles accounting for ~99% of Chinese population. Docking analysis showed stable hydrogen bonds of epitopes with their corresponding HLA alleles. In conclusion, these putative antigenic peptides may elicit the resistance response to the viral infection. In vitro and in vivo experiments are required to validate the effectiveness of these peptide vaccine.