Gastric cancer is a major gastrointestinal malignancy for which targeted therapies are emerging as treatment options. This study sought to identify the most prevalent molecular targets in gastric cancer and to elucidate systematic patterns of exclusivity and co-occurrence among these targets, through comprehensive genomic analysis of a large panel of gastric cancers.Using high-resolution single nucleotide polymorphism arrays, copy number alterations were profiled in a panel of 233 gastric cancers (193 primary tumours, 40 cell lines) and 98 primary matched gastric non-malignant samples. For selected alterations, their impact on gene expression and clinical outcome were evaluated.22 recurrent focal alterations (13 amplifications and nine deletions) were identified. These included both known targets (FGFR2, ERBB2) and also novel genes in gastric cancer (KLF5, GATA6). Receptor tyrosine kinase (RTK)/RAS alterations were found to be frequent in gastric cancer. This study also demonstrates, for the first time, that these alterations occur in a mutually exclusive fashion, with KRAS gene amplifications highlighting a clinically relevant but previously underappreciated gastric cancer subgroup. FGFR2-amplified gastric cancers were also shown to be sensitive to dovitinib, an orally bioavailable FGFR/VEGFR targeting agent, potentially representing a subtype-specific therapy for FGFR2-amplified gastric cancers.The study demonstrates the existence of five distinct gastric cancer patient subgroups, defined by the signature genomic alterations FGFR2 (9% of tumours), KRAS (9%), EGFR (8%), ERBB2 (7%) and MET (4%). Collectively, these subgroups suggest that at least 37% of gastric cancer patients may be potentially treatable by RTK/RAS directed therapies.

Many solid cancers are known to exhibit a high degree of heterogeneity in their deregulation of different oncogenic pathways. We sought to identify major oncogenic pathways in gastric cancer (GC) with significant relationships to patient survival. Using gene expression signatures, we devised an in silico strategy to map patterns of oncogenic pathway activation in 301 primary gastric cancers, the second highest cause of global cancer mortality. We identified three oncogenic pathways (proliferation/stem cell, NF-κB, and Wnt/β-catenin) deregulated in the majority (>70%) of gastric cancers. We functionally validated these pathway predictions in a panel of gastric cancer cell lines. Patient stratification by oncogenic pathway combinations showed reproducible and significant survival differences in multiple cohorts, suggesting that pathway interactions may play an important role in influencing disease behavior. Individual GCs can be successfully taxonomized by oncogenic pathway activity into biologically and clinically relevant subgroups. Predicting pathway activity by expression signatures thus permits the study of multiple cancer-related pathways interacting simultaneously in primary cancers, at a scale not currently achievable by other platforms.

Objective

 Since the publication of the first Asia Pacific Consensus on Colorectal Cancer (CRC) in 2008, there are substantial advancements in the science and experience of implementing CRC screening. The Asia Pacific Working Group aimed to provide an updated set of consensus recommendations. 

Design

 Members from 14 Asian regions gathered to seek consensus using other national and international guidelines, and recent relevant literature published from 2008 to 2013. A modified Delphi process was adopted to develop the statements. 

Results

 Age range for CRC screening is defined as 50–75 years. Advancing age, male, family history of CRC, smoking and obesity are confirmed risk factors for CRC and advanced neoplasia. A risk-stratified scoring system is recommended for selecting high-risk patients for colonoscopy. Quantitative faecal immunochemical test (FIT) instead of guaiac-based faecal occult blood test (gFOBT) is preferred for average-risk subjects. Ancillary methods in colonoscopy, with the exception of chromoendoscopy, have not proven to be superior to high-definition white light endoscopy in identifying adenoma. Quality of colonoscopy should be upheld and quality assurance programme should be in place to audit every aspects of CRC screening. Serrated adenoma is recognised as a risk for interval cancer. There is no consensus on the recruitment of trained endoscopy nurses for CRC screening. 

Conclusions

 Based on recent data on CRC screening, an updated list of recommendations on CRC screening is prepared. These consensus statements will further enhance the implementation of CRC screening in the Asia Pacific region.

Colorectal cancer (CRC) is rapidly increasing in Asia, but screening guidelines are lacking. Through reviewing the literature and regional data, and using the modified Delphi process, the Asia Pacific Working Group on Colorectal Cancer and international experts launch consensus recommendations aiming to improve the awareness of healthcare providers of the changing epidemiology and screening tests available. The incidence, anatomical distribution and mortality of CRC among Asian populations are not different compared with Western countries. There is a trend of proximal migration of colonic polyps. Flat or depressed lesions are not uncommon. Screening for CRC should be started at the age of 50 years. Male gender, smoking, obesity and family history are risk factors for colorectal neoplasia. Faecal occult blood test (FOBT, guaiac-based and immunochemical tests), flexible sigmoidoscopy and colonoscopy are recommended for CRC screening. Double-contrast barium enema and CT colonography are not preferred. In resource-limited countries, FOBT is the first choice for CRC screening. Polyps 5–9 mm in diameter should be removed endoscopically and, following a negative colonoscopy, a repeat examination should be performed in 10 years. Screening for CRC should be a national health priority in most Asian countries. Studies on barriers to CRC screening, education for the public and engagement of primary care physicians should be undertaken. There is no consensus on whether nurses should be trained to perform endoscopic procedures for screening of colorectal neoplasia.

Background & AimsGastric cancer (GC) is a heterogeneous disease comprising multiple subtypes that have distinct biological properties and effects in patients. We sought to identify new, intrinsic subtypes of GC by gene expression analysis of a large panel of GC cell lines. We tested if these subtypes might be associated with differences in patient survival times and responses to various standard-of-care cytotoxic drugs.MethodsWe analyzed gene expression profiles for 37 GC cell lines to identify intrinsic GC subtypes. These subtypes were validated in primary tumors from 521 patients in 4 independent cohorts, where the subtypes were determined by either expression profiling or subtype-specific immunohistochemical markers (LGALS4, CDH17). In vitro sensitivity to 3 chemotherapy drugs (5-fluorouracil, cisplatin, oxaliplatin) was also assessed.ResultsUnsupervised cell line analysis identified 2 major intrinsic genomic subtypes (G-INT and G-DIF) that had distinct patterns of gene expression. The intrinsic subtypes, but not subtypes based on Lauren's histopathologic classification, were prognostic of survival, based on univariate and multivariate analysis in multiple patient cohorts. The G-INT cell lines were significantly more sensitive to 5-fluorouracil and oxaliplatin, but more resistant to cisplatin, than the G-DIF cell lines. In patients, intrinsic subtypes were associated with survival time following adjuvant, 5-fluorouracil–based therapy.ConclusionsIntrinsic subtypes of GC, based on distinct patterns of expression, are associated with patient survival and response to chemotherapy. Classification of GC based on intrinsic subtypes might be used to determine prognosis and customize therapy. Gastric cancer (GC) is a heterogeneous disease comprising multiple subtypes that have distinct biological properties and effects in patients. We sought to identify new, intrinsic subtypes of GC by gene expression analysis of a large panel of GC cell lines. We tested if these subtypes might be associated with differences in patient survival times and responses to various standard-of-care cytotoxic drugs. We analyzed gene expression profiles for 37 GC cell lines to identify intrinsic GC subtypes. These subtypes were validated in primary tumors from 521 patients in 4 independent cohorts, where the subtypes were determined by either expression profiling or subtype-specific immunohistochemical markers (LGALS4, CDH17). In vitro sensitivity to 3 chemotherapy drugs (5-fluorouracil, cisplatin, oxaliplatin) was also assessed. Unsupervised cell line analysis identified 2 major intrinsic genomic subtypes (G-INT and G-DIF) that had distinct patterns of gene expression. The intrinsic subtypes, but not subtypes based on Lauren's histopathologic classification, were prognostic of survival, based on univariate and multivariate analysis in multiple patient cohorts. The G-INT cell lines were significantly more sensitive to 5-fluorouracil and oxaliplatin, but more resistant to cisplatin, than the G-DIF cell lines. In patients, intrinsic subtypes were associated with survival time following adjuvant, 5-fluorouracil–based therapy. Intrinsic subtypes of GC, based on distinct patterns of expression, are associated with patient survival and response to chemotherapy. Classification of GC based on intrinsic subtypes might be used to determine prognosis and customize therapy.

Objective A global consensus meeting was held to review current evidence and knowledge gaps and propose collaborative studies on population-wide screening and eradication of Helicobacter pylori for prevention of gastric cancer (GC). Methods 28 experts from 11 countries reviewed the evidence and modified the statements using the Delphi method, with consensus level predefined as ≥80% of agreement on each statement. The Grading of Recommendation Assessment, Development and Evaluation (GRADE) approach was followed. Results Consensus was reached in 26 statements. At an individual level, eradication of H. pylori reduces the risk of GC in asymptomatic subjects and is recommended unless there are competing considerations. In cohorts of vulnerable subjects (eg, first-degree relatives of patients with GC), a screen-and-treat strategy is also beneficial. H. pylori eradication in patients with early GC after curative endoscopic resection reduces the risk of metachronous cancer and calls for a re-examination on the hypothesis of ‘the point of no return’. At the general population level, the strategy of screen-and-treat for H. pylori infection is most cost-effective in young adults in regions with a high incidence of GC and is recommended preferably before the development of atrophic gastritis and intestinal metaplasia. However, such a strategy may still be effective in people aged over 50, and may be integrated or included into national healthcare priorities, such as colorectal cancer screening programmes, to optimise the resources. Reliable locally effective regimens based on the principles of antibiotic stewardship are recommended. Subjects at higher risk of GC, such as those with advanced gastric atrophy or intestinal metaplasia, should receive surveillance endoscopy after eradication of H. pylori . Conclusion Evidence supports the proposal that eradication therapy should be offered to all individuals infected with H. pylori . Vulnerable subjects should be tested, and treated if the test is positive. Mass screening and eradication of H. pylori should be considered in populations at higher risk of GC.

Objective

 To develop and validate a clinical risk score predictive of risk for colorectal advanced neoplasia for Asia. 

Methods

 A prospective, cross-sectional and multicentre study was carried out in tertiary hospitals in 11 Asian cities. The subjects comprise 2752 asymptomatic patients undergoing screening colonoscopy. From a development set of 860 asymptomatic subjects undergoing screening colonoscopy, multiple logistic regression was applied to identify significant risk factors for advanced colorectal neoplasia defined as invasive carcinoma or advanced adenoma. The ORs for significant risk factors were utilised to develop a risk score ranging from 0 to 7 (Asia-Pacific Colorectal Screening (APCS) score). Three tiers of risk were arbitrarily defined: 0–1 'average risk' (AR); 2–3 'moderate risk' (MR); and 4–7 'high risk' (HR). Subjects undergoing screening colonoscopy between July 2006 and December 2007 were prospectively enrolled to form an independent validation group. Each subject had a personal APCS score calculated by summing the points attributed from the presence of risk factors in the individuals. The performance of the APCS score in predicting risk of advanced neoplasia was evaluated. 

Results

 There were 860 subjects in the derivation set and 1892 subjects in the validation set, with a baseline prevalence of advanced neoplasia of 4.5% and 3%, respectively. Applying the APCS stratification in the validation set, 559 subjects (29.5%) were in the AR tier, 966 subjects (51.1%) in the MR tier and 367 (19.4%) subjects in the HR tier. The prevalence of advanced neoplasia in the AR, MR and HR groups was 1.3, 3.2 and 5.2%, respectively. The subjects in the MR and HR tiers had 2.6-fold (95% CI 1.1 to 6.0) and 4.3-fold (95% CI 1.8 to 10.3) increased prevalence of advanced neoplasia, respectively, than those in the AR tier. 

Conclusions

 The APCS score based on age, gender, family history and smoking is useful in selecting asymptomatic Asian subjects for priority of colorectal screening.

Objective

 Differences in gastric cancer (GC) clinical outcomes between patients in Asian and non-Asian countries has been historically attributed to variability in clinical management. However, recent international Phase III trials suggest that even with standardised treatments, GC outcomes differ by geography. Here, we investigated gene expression differences between Asian and non-Asian GCs, and if these molecular differences might influence clinical outcome. 

Design

 We compared gene expression profiles of 1016 GCs from six Asian and three non-Asian GC cohorts, using a two-stage meta-analysis design and a novel biostatistical method (RUV-4) to adjust for technical variation between cohorts. We further validated our findings by computerised immunohistochemical analysis on two independent tissue microarray (TMA) cohorts from Asian and non-Asian localities (n=665). 

Results

 Gene signatures differentially expressed between Asians and non-Asian GCs were related to immune function and inflammation. Non-Asian GCs were significantly enriched in signatures related to T-cell biology, including CTLA-4 signalling. Similarly, in the TMA cohorts, non-Asian GCs showed significantly higher expression of T-cell markers (CD3, CD45R0, CD8) and lower expression of the immunosuppressive T-regulatory cell marker FOXP3 compared to Asian GCs (p<0.05). Inflammatory cell markers CD66b and CD68 also exhibited significant cohort differences (p<0.05). Exploratory analyses revealed a significant relationship between tumour immunity factors, geographic locality-specific prognosis, and postchemotherapy outcomes. 

Conclusions

 Analyses of >1600 GCs suggest that Asian and non-Asian GCs exhibit distinct tumour immunity signatures related to T-cell function. These differences may influence geographical differences in clinical outcome, and the design of future trials particularly in immuno-oncology.