EM
E. Meyer
Author with expertise in Genetic and Clinical Aspects of Hemoglobin Disorders
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
881
h-index:
14
/
i10-index:
21
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

DALI: Defining Antibiotic Levels in Intensive Care Unit Patients: Are Current -Lactam Antibiotic Doses Sufficient for Critically Ill Patients?

Jason Roberts et al.Jan 14, 2014
Morbidity and mortality for critically ill patients with infections remains a global healthcare problem. We aimed to determine whether β-lactam antibiotic dosing in critically ill patients achieves concentrations associated with maximal activity and whether antibiotic concentrations affect patient outcome.This was a prospective, multinational pharmacokinetic point-prevalence study including 8 β-lactam antibiotics. Two blood samples were taken from each patient during a single dosing interval. The primary pharmacokinetic/pharmacodynamic targets were free antibiotic concentrations above the minimum inhibitory concentration (MIC) of the pathogen at both 50% (50% f T>MIC) and 100% (100% f T>MIC) of the dosing interval. We used skewed logistic regression to describe the effect of antibiotic exposure on patient outcome.We included 384 patients (361 evaluable patients) across 68 hospitals. The median age was 61 (interquartile range [IQR], 48-73) years, the median Acute Physiology and Chronic Health Evaluation II score was 18 (IQR, 14-24), and 65% of patients were male. Of the 248 patients treated for infection, 16% did not achieve 50% f T>MIC and these patients were 32% less likely to have a positive clinical outcome (odds ratio [OR], 0.68; P = .009). Positive clinical outcome was associated with increasing 50% f T>MIC and 100% f T>MIC ratios (OR, 1.02 and 1.56, respectively; P < .03), with significant interaction with sickness severity status.Infected critically ill patients may have adverse outcomes as a result of inadeqaute antibiotic exposure; a paradigm change to more personalized antibiotic dosing may be necessary to improve outcomes for these most seriously ill patients.
5

Novel regulatory variant in ABO intronic RUNX1 binding site inducing A3phenotype

Gian Thun et al.May 4, 2023
Abstract Background and Objectives Mixed-field agglutination in ABO phenotyping (A 3 , B 3 ) has been linked to genetically different blood cell populations like in chimerism, or to rare variants in either ABO exon 7 or regulatory regions. Clarification of such cases is challenging and would greatly benefit from sequencing technologies that allow resolving full-gene haplotypes at high resolution. Materials and Methods We used long-read sequencing by Oxford Nanopore Technologies to sequence the entire ABO gene, amplified in two overlapping long-range PCR fragments, in a blood donor presented with A 3 B phenotype. Confirmation analyses were carried out by Sanger sequencing and included samples from other family members. Results Our data revealed a novel heterozygous g.10924C>A variant on the ABO*A -allele located in the transcription factor binding site for RUNX1 in intron 1 (+5.8 kb site). Inheritance was shown by the results of the donor’s mother, who shared the novel variant and the anti-A specific mixed-field agglutination. Conclusion We discovered a regulatory variant in the 8-bp RUNX1 motif of ABO , which extends current knowledge of three other variants affecting the same motif and also leading to A 3 or B 3 phenotypes. Overall, long-range PCR combined with nanopore sequencing proved powerful and showed great potential as emerging strategy for resolving cases with cryptic ABO phenotypes.