Abstract Optogenetics has been harnessed to shed new mechanistic light on current therapies and to develop future treatment strategies. This has been to date achieved by the correction of electrical signals in neuronal cells and neural circuits that are affected by disease. In contrast, the optogenetic delivery of trophic biochemical signals, which support cell survival and thereby may modify progression of degenerative disorders, has never been demonstrated in an animal disease model. Here, we reengineered the human and Drosophila melanogaster REarranged during Transfection (hRET and dRET) receptors to be activated by light, creating one-component optogenetic tools termed Opto-hRET and Opto-dRET. Upon blue light stimulation, these receptors robustly induced the MAPK/ERK proliferative signaling pathway in cultured cells. In PINK1 B9 flies that exhibit loss of PTEN-induced putative kinase 1 (PINK1), a kinase associated with familial Parkinson’s disease (PD), light activation of Opto-dRET suppressed mitochondrial defects, tissue degeneration and behavioral deficits. In human cells with PINK1 loss-of-function, mitochondrial fragmentation was rescued using Opto-dRET via the PI3K/NF-кB pathway. Our results demonstrate that a light-activated receptor can ameliorate disease hallmarks in a genetic model of PD. The optogenetic delivery of trophic signals is cell type-specific and reversible and thus has the potential to overcome limitations of current strategies towards a spatio-temporal regulation of tissue repair. Significance Statement The death of physiologically important cell populations underlies of a wide range of degenerative disorders, including Parkinson’s disease (PD). Two major strategies to counter cell degeneration, soluble growth factor injection and growth factor gene therapy, can lead to the undesired activation of bystander cells and non-natural permanent signaling responses. Here, we employed optogenetics to deliver cell type-specific pro-survival signals in a genetic model of PD. In Drosophila and human cells exhibiting loss of the PINK1 kinase, akin to autosomal recessive PD, we efficiently suppressed disease phenotypes using a light-activated tyrosine kinase receptor. This work demonstrates a spatio-temporally precise strategy to interfere with degeneration and may open new avenues towards tissue repair in disease models.

ABSTRACT NEMO is a ubiquitin-binding protein which regulates canonical NF-κB pathway activation in innate immune signaling, cell death regulation and host-pathogen interactions. Here we identified an NF-κB-independent function of NEMO in proteostasis regulation by promoting autophagosomal clearance of protein aggregates. NEMO-deficient cells accumulate misfolded proteins upon proteotoxic stress and are vulnerable to proteostasis challenges. Moreover, a patient with a mutation in the NEMO gene resulting in defective binding of NEMO to linear ubiquitin chains, developed a widespread mixed brain proteinopathy, including α-synuclein, tau and TDP-43 pathology. NEMO amplifies linear ubiquitylation at α-synuclein aggregates and promotes the local concentration of p62 into foci. In vitro, NEMO lowers the threshold concentrations required for ubiquitin-dependent phase transition of p62. In summary, NEMO reshapes the aggregate surface for efficient autophagosomal clearance by providing a mobile phase at the aggregate interphase favoring co-condensation with p62.