RW
Ryan Walker
Author with expertise in Genetic Research on BRCA Mutations and Cancer Risk
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
1,289
h-index:
21
/
i10-index:
24
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genetic analyses of diverse populations improves discovery for complex traits

Genevieve Wojcik et al.Jun 1, 2019
Genome-wide association studies (GWAS) have laid the foundation for investigations into the biology of complex traits, drug development and clinical guidelines. However, the majority of discovery efforts are based on data from populations of European ancestry1–3. In light of the differential genetic architecture that is known to exist between populations, bias in representation can exacerbate existing disease and healthcare disparities. Critical variants may be missed if they have a low frequency or are completely absent in European populations, especially as the field shifts its attention towards rare variants, which are more likely to be population-specific4–10. Additionally, effect sizes and their derived risk prediction scores derived in one population may not accurately extrapolate to other populations11,12. Here we demonstrate the value of diverse, multi-ethnic participants in large-scale genomic studies. The Population Architecture using Genomics and Epidemiology (PAGE) study conducted a GWAS of 26 clinical and behavioural phenotypes in 49,839 non-European individuals. Using strategies tailored for analysis of multi-ethnic and admixed populations, we describe a framework for analysing diverse populations, identify 27 novel loci and 38 secondary signals at known loci, as well as replicate 1,444 GWAS catalogue associations across these traits. Our data show evidence of effect-size heterogeneity across ancestries for published GWAS associations, substantial benefits for fine-mapping using diverse cohorts and insights into clinical implications. In the United States—where minority populations have a disproportionately higher burden of chronic conditions13—the lack of representation of diverse populations in genetic research will result in inequitable access to precision medicine for those with the highest burden of disease. We strongly advocate for continued, large genome-wide efforts in diverse populations to maximize genetic discovery and reduce health disparities. Genetic analyses of ancestrally diverse populations show evidence of heterogeneity across ancestries and provide insights into clinical implications, highlighting the importance of including ancestrally diverse populations to maximize genetic discovery and reduce health disparities.
0
Citation800
0
Save
0

Fructose content in popular beverages made with and without high-fructose corn syrup

Ryan Walker et al.Apr 18, 2014
Excess fructose consumption is hypothesized to be associated with risk for metabolic disease. Actual fructose consumption levels are difficult to estimate because of the unlabeled quantity of fructose in beverages. The aims of this study were threefold: 1) re-examine the fructose content in previously tested beverages using two additional assay methods capable of detecting other sugars, especially maltose, 2) compare data across all methods to determine the actual free fructose-to-glucose ratio in beverages made either with or without high-fructose corn syrup (HFCS), and 3) expand the analysis to determine fructose content in commonly consumed juice products.Sugar-sweetened beverages (SSBs) and fruit juice drinks that were either made with or without HFCS were analyzed in separate, independent laboratories via three different methods to determine sugar profiles.For SSBs, the three independent laboratory methods showed consistent and reproducible results. In SSBs made with HFCS, fructose constituted 60.6% ± 2.7% of sugar content. In juices sweetened with HFCS, fructose accounted for 52.1% ± 5.9% of sugar content, although in some juices made from 100% fruit, fructose concentration reached 65.35 g/L accounting for 67% of sugars.Our results provide evidence of higher than expected amounts of free fructose in some beverages. Popular beverages made with HFCS have a fructose-to-glucose ratio of approximately 60:40, and thus contain 50% more fructose than glucose. Some pure fruit juices have twice as much fructose as glucose. These findings suggest that beverages made with HFCS and some juices have a sugar profile very different than sucrose, in which amounts of fructose and glucose are equivalent. Current dietary analyses may underestimate actual fructose consumption.
0

Learning from the first: a qualitative study of the psychosocial benefits and treatment burdens of long‐acting cabotegravir/rilpivirine among early adopters in three U.S. clinics

Katerina Christopoulos et al.Nov 1, 2024
Abstract Introduction Perspectives on long‐acting injectable cabotegravir/rilpivirine (CAB/RPV‐LA) from HIV health disparity populations are under‐represented in current literature yet crucial to optimize delivery. Methods Between August 2022 and May 2023, we conducted in‐depth interviews with people with HIV (PWH) at four HIV clinics in Atlanta, Chicago and San Francisco. Eligibility criteria were current CAB/RPV‐LA use with receipt of ≥3 injections or CAB/RPV‐LA discontinuation. We purposefully sampled for PWH who initiated with viraemia (plasma HIV RNA >50 copies/ml) due to adherence challenges, discontinuers, and cis and trans women. Interviews were coded and analysed using thematic methods grounded in descriptive phenomenology. Clinical data were abstracted from the medical record. Results The sample (San Francisco n = 25, Atlanta n = 20, Chicago n = 14 for total n = 59, median number of injections = 6) consisted of 48 PWH using CAB/RPV‐LA and 11 who had discontinued. The median age was 50 (range 25–73) and 40 (68%) identified as racial/ethnic minorities, 19 (32%) cis or trans women, 16 (29%) were experiencing homelessness/unstable housing, 12 (20%) had recently used methamphetamine or opioids and 11 (19%) initiated with viraemia. All participants except one (who discontinued) had evidence of viral suppression at interview. Typical benefits of CAB/RPV‐LA included increased convenience, privacy and freedom from being reminded of HIV and reduced anxiety about forgetting pills. However, PWH who became virally suppressed through CAB/RPV‐LA use also experienced an amelioration of feelings of shame and negative self‐worth related to oral adherence challenges. Regardless of baseline viral suppression status, successful use of CAB/RPV‐LA amplified positive provider/clinic relationships, and CAB/RPV‐LA was often viewed as less “work” than oral antiretroviral therapy, which created space to attend to other aspects of health and wellness. For some participants, CAB/RPV‐LA remained “work,” particularly with regard to injection site pain and visit frequency. At times, these burdens outweighed the aforementioned benefits, resulting in discontinuation. Conclusions CAB/RPV‐LA offers a range of logistical, psychosocial and care engagement benefits, which are experienced maximally by PWH initiating with viraemia due to adherence challenges; however, benefits do not always outweigh treatment burdens and can result in discontinuation. Our findings on rationales for persistence versus discontinuation can inform both initial and follow‐up patient counselling.