Abstract RNA-seq approach can provide useful information about gene expression. Although several studies have been conducted in the parasite Schistosoma mansoni , the gene expression data is often limited to differential analysis between certain life stages. A recent meta-analysis of RNA-seq studies generated valuable expression data across all life stages of S. mansoni . To facilitate the use and visualisation of these data, we established an interactive web portal implementing not only data from above-mentioned analysis, but also functional aspects including conserved domains and associated pathways, as a complement to main databases for S. mansoni . Users can also visualise and analyse their own data via the web portal. The interactive visualisation implemented in the web portal can facilitate characterising schistosome genes for the research community.

Abstract Three-dimensional molecular imaging of living organisms and cells plays a significant role in modern biology. Yet, current volumetric imaging modalities are largely fluorescence-based and thus lack chemical content information. Mid-infrared photothermal microscopy as a new chemical imaging technology provides infrared spectroscopic information at sub-micrometer spatial resolution. Here, by harnessing thermosensitive fluorescent dyes to sense the mid-infrared photothermal effect, we demonstrate mid-infrared photothermal Fourier light field (MIP-FLF) microscopy for single-shot volumetric infrared spectroscopic imaging at the speed of 8 volumes per second and sub-micron spatial resolution. Protein contents in bacteria and lipid droplets in living pancreatic cancer cells are visualized. Altered lipid metabolism in drug-resistant pancreatic cancer cells is observed with the MIP-FLF microscope.