Abstract Brain swelling occurs in cerebral malaria (CM) and may either reverse or result in fatal outcome. It is currently unknown how brain swelling in CM reverses, as investigations have been hampered by inadequate animal models. In this study, we show that reversible brain swelling in experimental murine cerebral malaria (ECM) can be induced reliably after single vaccination with radiation-attenuated sporozoites as revealed by in vivo high-field (9.4T) magnetic resonance imaging. Our results provide evidence that parenchymal fluid increase and consecutive brain swelling results from transcellular blood-brain barrier disruption (BBBD), as revealed by electron microscopy. This mechanism enables reversal of brain swelling but does not prevent persistent focal brain damage, evidenced by microhemorrhages, in areas of most severe BBBD. In a cohort of 27 pediatric and adult CM patients (n=4 fatal, n=23 non-fatal) two out of four fatal CM patients (50%) and 8 out of 23 non-fatal CM patients (35%) showed microhemorrhages on MRI at clinical field strength of 1.5T, emphasizing the translational potential of the experimental model. Our data suggest that targeting transcellular BBBD may represent a promising adjunct therapeutic approach in cerebral brain swelling to reduce edema and may ultimately lead to a reduced permanent brain damage and a better longtime neurological outcome. Author summary Brain swelling, which occurs in diseases such as cerebral malaria, is not necessarily fatal, and may reverse. Even upon reversal of brain swelling, neurological sequelae can still occur. The factors contributing to the reversibility of brain edema are not known, and treatment options remain therefore limited. Identifying the mechanisms leading to such reversibility could inform clinical management aimed at decreasing brain swelling and consecutive brain injury. Here we introduce a reproducible and simple animal model that allows comprehensive in vivo studies of reversible brain swelling in cerebral malaria at the peak of disease and upon recovery. We identify a specific type of blood-brain barrier disruption (BBBD) as a mechanism that occurs in brain swelling. We show that BBBD can reverse, but also highlight remaining brain damage in areas of most severe BBBD. As the ECM model introduced here bares crucial similarities to the CM in humans, our findings open strategies to study new therapeutic avenues and point to compounds that specifically target transcellular BBBD to reduce brain edema, and increase survival rates.

The progression of Parkinson's disease (PD) is associated with microstructural alterations in neural pathways, contributing to both motor and cognitive decline. However, conflicting findings have emerged due to the use of heterogeneous methods in small studies. Here we performed a large diffusion MRI study in PD, integrating data from 17 cohorts worldwide, to identify stage-specific profiles of white matter differences. Diffusion-weighted MRI data from 1654 participants diagnosed with PD (age: 20–89 years; 33% female) and 885 controls (age: 19–84 years; 47% female) were analyzed using the ENIGMA-DTI protocol to evaluate white matter microstructure. Skeletonized maps of fractional anisotropy (FA) and mean diffusivity (MD) were compared across Hoehn and Yahr (HY) disease groups and controls to reveal the profile of white matter alterations at different stages. We found an enhanced, more widespread pattern of microstructural alterations with each stage of PD, with eventually lower FA and higher MD in almost all regions of interest: Cohen's d effect sizes reached d = −1.01 for FA differences in the fornix at PD HY Stage 4/5. The early PD signature in HY stage 1 included higher FA and lower MD across the entire white matter skeleton, in a direction opposite to that typical of other neurodegenerative diseases. FA and MD were associated with motor and non-motor clinical dysfunction. While overridden by degenerative changes in the later stages of PD, early PD is associated with paradoxically higher FA and lower MD in PD, consistent with early compensatory changes associated with the disorder.

The radial unit hypothesis provides a framework for global (proliferation) and regional (distribution) expansion of the primate cerebral cortex. Using principal component analysis (PCA), we have identified cortical regions with shared variance in their surface area and cortical thickness, respectively, segmented from magnetic resonance images obtained in 23,800 participants. We then carried out meta-analyses of genome-wide association studies of the first two principal components for each phenotype. For surface area (but not cortical thickness), we have detected strong associations between each of the components and single nucleotide polymorphisms in a number of gene loci. The first (global) component was associated mainly with loci on chromosome 17 (9.5e-32 ≤ p ≤ 2.8e-10), including those detected previously as linked with intracranial volume and/or general cognitive function. The second (regional) component captured shared variation in the surface area of the primary and adjacent secondary visual cortices and showed a robust association with polymorphisms in a locus on chromosome 14 containing Disheveled Associated Activator of Morphogenesis 1 ( DAAM1 ; p =2.4e-34). DAAM1 is a key component in the planar-cell-polarity signaling pathway. In follow-up studies, we have focused on the latter finding and established that: (1) DAAM1 is highly expressed between 12th and 22nd post-conception weeks in the human cerebral cortex; (2) genes co-expressed with DAAM1 in the primary visual cortex are enriched in mitochondria-related pathways; and (3) volume of the lateral geniculate nucleus, which projects to regions of the visual cortex staining for cytochrome oxidase (a mitochondrial enzyme), correlates with the surface area of the visual cortex in major-allele homozygotes but not in carriers of the minor allele. Altogether, we speculate that, in concert with thalamocortical input to cortical subplate, DAAM1 enables migration of neurons to cytochrome-oxidase rich regions of the visual cortex, and, in turn, facilitates regional expansion of this set of cortical regions during development.

Background Brain atrophy occurs in both normal ageing and in multiple sclerosis (MS), but it occurs at a faster rate in MS, where it is the major driver of disability progression. Here, we employed a neuroimaging biomarker of structural brain ageing to explore how MS influences the brain ageing process.Methods In a longitudinal, multi-centre sample of 3,565 MRI scans in 1,204 MS/clinically isolated syndrome (CIS) patients and 150 healthy controls (HCs) (mean follow-up time: patients 3⋅41 years, HCs 1⋅97 years) we measured ‘brain-predicted age’ using T1-weighted MRI. Brain-predicted age difference (brain-PAD) was calculated as the difference between the brain-predicted age and chronological age. Positive brain-PAD indicates a brain appears older than its chronological age. We compared brain-PAD between MS/CIS patients and HCs, and between disease subtypes. In patients, the relationship between brain-PAD and Expanded Disability Status Scale (EDSS) at study entry and over time was explored.Findings Adjusted for age, sex, intracranial volume, cohort and scanner effects MS/CIS patients had markedly older-appearing brains than HCs (mean brain-PAD 11⋅8 years [95% CI 9⋅1—14⋅5] versus −0⋅01 [−3⋅0—3⋅0], p<0⋅0001). All MS subtypes had greater brain-PAD scores than HCs, with the oldest-appearing brains in secondary-progressive MS (mean brain-PAD 18⋅0 years [15⋅4—20⋅5], p<0⋅05). At baseline, higher brain-PAD was associated with a higher EDSS, longer time since diagnosis and a younger age at diagnosis. Brain-PAD at study entry significantly predicted time-to-EDSS progression (hazard ratio 1⋅02 [1⋅01—1⋅03], p<0⋅0001): for every 5 years of additional brain-PAD, the risk of progression increased by 14⋅2%.Interpretation MS increases brain ageing across all MS subtypes. An older-appearing brain at baseline was associated with more rapid disability progression, suggesting ‘brain-age’ could be an individualised prognostic biomarker from a single, cross-sectional assessment.Funding UK MS Society; National Institute for Health Research University College London Hospitals Biomedical Research Centre.

Objective: Grey matter (GM) atrophy occurs in all multiple sclerosis (MS) phenotypes. We investigated whether there is a spatiotemporal pattern of GM atrophy that is associated with faster disability accumulation in MS. Methods: We analysed 3,604 brain high-resolution T1-weighted MRI scans from 1,417 participants: 1,214 MS patients (253 clinically-isolated syndrome [CIS], 708 relapsing-remitting [RRMS], 128 secondary-progressive [SPMS], 125 primary-progressive [PPMS]), over an average follow-up of 2.41 years (standard deviation [SD]=1.97), and 203 healthy controls (HCs) [average follow-up=1.83 year, SD=1.77], attending 7 European centres. Disability was assessed with the Expanded-Disability Status Scale (EDSS). We obtained volumes of the deep GM (DGM), temporal, frontal, parietal, occipital and cerebellar GM, brainstem and cerebral white matter. Hierarchical mixed-models assessed annual percentage rate of regional tissue loss and identified regional volumes associated with time-to-EDSS progression. Results: SPMS showed the lowest baseline volumes of cortical GM and DGM. Of all baseline regional volumes, only that of the DGM predicted time-to-EDSS progression (hazard ratio=0.73, 95% CIs 0.65, 0.82; p<0.001): for every standard deviation decrease in baseline DGM volume, the risk of presenting a shorter time to EDSS worsening during follow-up increased by 27%. Of all longitudinal measures, DGM showed the fastest annual rate of atrophy, which was faster in SPMS (-1.45%), PPMS (-1.66%), and RRMS (-1.34%) than CIS (-0.88%) and HCs (-0.94%) [p<0.01]. The rate of temporal GM atrophy in SPMS (-1.21%) was significantly faster than RRMS (-0.76%), CIS (-0.75%), and HCs (-0.51%). Similarly, the rate of parietal GM atrophy in SPMS (-1.24%) was faster than CIS (-0.63%) and HCs (-0.23%) (all p values <0.05). Only the atrophy rate in DGM in patients was significantly associated with disability accumulation (beta=0.04, p<0.001). Interpretation: This large multi-centre and longitudinal study shows that DGM volume loss drives disability accumulation in MS, and that temporal cortical GM shows accelerated atrophy in SPMS than RRMS. The difference in regional GM atrophy development between phenotypes needs to be taken into account when evaluating treatment effect of therapeutic interventions.

We conducted a genome-wide association meta-analysis of two ischemic white matter disease subtypes in the brain, periventricular and deep white matter hyperintensities (PVWMH and DWMH). In 26,654 participants, we found 10 independent genome-wide significant loci only associated with PVWMH, four of which have not been described previously for total WMH burden (16q24.2, 17q21.31, 10q23.1, 7q36.1). Additionally, in both PVWMH and DWMH we observed the previous association of the 17q25.1 locus with total WMH. We found that both phenotypes have shared but also distinct genetic architectures, consistent with both different underlying and related pathophysiology. PVWMH had more extensive genetic overlap with small vessel ischemic stroke, and unique associations with several loci implicated in ischemic stroke. DWMH were characterized by associations with loci previously implicated in vascular as well as astrocytic and neuronal function. Our study confirms the utility of these phenotypes and identifies new candidate genes associated only with PVWMH.

Parameters of water diffusion in white matter derived from diffusion-weighted imaging (DWI), such as fractional anisotropy (FA), mean, axial, and radial diffusivity (MD, AD and RD), and more recently, peak width of skeletonized mean diffusivity (PSMD), have been proposed as potential markers of normal and pathological brain ageing. However, their relative evolution over the entire adult lifespan in healthy individuals remains partly unknown during early and late adulthood, and particularly for the PSMD index. Here, we gathered and meta-analyzed cross-sectional diffusion tensor imaging (DTI) data from 10 population-based cohort studies in order to establish the time course of white matter water diffusion phenotypes from post-adolescence to late adulthood. DTI data were obtained from a total of 20,005 individuals aged 18.1 to 92.6 years and analyzed with the same pipeline for computing DTI metrics. For each individual MD, AD, RD, and FA mean values were computed over their FA volume skeleton, PSMD being calculated as the 90% peak width of the MD values distribution across the FA skeleton. Mean values of each DTI metric were found to strongly vary across cohorts, most likely due to major differences in DWI acquisition protocols as well as pre-processing and DTI model fitting. However, age effects on each DTI metric were found to be highly consistent across cohorts. RD, MD and AD variations with age exhibited the same U-shape pattern, first slowly decreasing during post-adolescence until the age of 30, 40 and 50, respectively, then progressively increasing until late life. FA showed a reverse profile, initially increasing then continuously decreasing, slowly until the 70's, then sharply declining thereafter. By contrast, PSMD constantly increased, first slowly until the 60's, then more sharply. These results demonstrate that, in the general population, age affects PSMD in a manner different from that of other DTI metrics. The constant increase in PSMD throughout the entire adult life, including during post-adolescence, indicates that PSMD could be an early marker of the ageing process.

Grey matter atrophy is present from the earliest clinical stages of multiple sclerosis (MS), but the temporal ordering is poorly understood. We aimed to determine the sequence in which grey matter regions become atrophic in MS, and its association with disability accumulation. In this longitudinal study, we included 1,417 subjects: 253 with clinically-isolated syndrome (CIS), 708 relapsing-remitting MS (RRMS), 128 secondary-progressive MS (SPMS), 125 primary-progressive MS (PPMS), and 203 healthy controls from 7 European centres. Subjects underwent repeated MRI scanning (total number of scans 3,604); the mean follow-up for patients was 2.41yrs (SD1.97). Disability was scored using the Expanded Disability Status Scale (EDSS). We calculated the volume of brain grey matter regions and brainstem using an unbiased within-subject template. We used an established data-driven event-based model (EBM) to determine the sequence of occurrence of atrophy and its uncertainty. We assigned each subject to a specific EBM stage, based on the number of their atrophic regions. We used nested linear mixed-effects regression models to explore the associations between the rate of increase in the EBM stages over time, disease duration and annual rate of EDSS gain. The first regions to become atrophic in CIS and relapse-onset MS patients (RRMS and SPMS) were the posterior cingulate cortex and precuneus, followed by the middle cingulate cortex, brainstem and thalamus. The sequence of atrophy in PPMS showed a similar involvement of the thalamus, cuneus, precuneus, and pallidum, followed by the brainstem and posterior cingulate cortex. The cerebellum, caudate and putamen showed early atrophy in relapse-onset MS and late atrophy in PPMS. Patients with SPMS showed the highest EBM stages (highest number of atrophic regions, all p<0.001) at study entry. Rates of increase in EBM stages were significantly different from healthy controls in all MS phenotypes, except for CIS. The increase in the number of atrophic regions (EBM stage) was associated with disease duration in all patients. EBM stage was associated with disability accumulation in RRMS independent of disease duration (p<0.0001). This data-driven staging of atrophy progression in a large MS sample demonstrates that grey matter atrophy spreads to involve more regions over time. The sequence in which regions become atrophic is reasonably consistent across MS phenotypes. The spread of atrophy was associated with disease duration, and disability accumulation in RRMS.

Cortical thickness, surface area and volumes (MRI cortical measures) vary with age and cognitive function, and in neurological and psychiatric diseases. We examined heritability, genetic correlations and genome-wide associations of cortical measures across the whole cortex, and in 34 anatomically predefined regions. Our discovery sample comprised 22,824 individuals from 20 cohorts within the Cohorts for Heart and Aging Research in Genomic Epidemiology (CHARGE) consortium and the United Kingdom Biobank. Significant associations were replicated in the Enhancing Neuroimaging Genetics through Meta-analysis (ENIGMA) consortium, and their biological implications explored using bioinformatic annotation and pathway analyses. We identified genetic heterogeneity between cortical measures and brain regions, and 160 genome-wide significant associations pointing to wnt/β-catenin, TGF-β and sonic hedgehog pathways. There was enrichment for genes involved in anthropometric traits, hindbrain development, vascular and neurodegenerative disease and psychiatric conditions. These data are a rich resource for studies of the biological mechanisms behind cortical development and aging.