Quantifying the effect of natural disasters on society is critical for recovery of public health services and infrastructure. The death toll can be difficult to assess in the aftermath of a major disaster. In September 2017, Hurricane Maria caused massive infrastructural damage to Puerto Rico, but its effect on mortality remains contentious. The official death count is 64.

Based on results of ecological studies demonstrating that Vibrio cholerae, the etiological agent of epidemic cholera, is commensal to zooplankton, notably copepods, a simple filtration procedure was developed whereby zooplankton, most phytoplankton, and particulates >20 microm were removed from water before use. Effective deployment of this filtration procedure, from September 1999 through July 2002 in 65 villages of rural Bangladesh, of which the total population for the entire study comprised approximately 133,000 individuals, yielded a 48% reduction in cholera (P < 0.005) compared with the control.

Urban socioeconomics and mortality Santiago, Chile, is a highly segregated city with distinct zones of affluence and deprivation. This setting offers a window on how social factors propel the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic in an economically vulnerable society with high levels of income inequality. Mena et al. analyzed incidence and mortality attributed to SARS-CoV-2 to understand spatial variations in disease burden. Infection fatality rates were higher in lower-income municipalities because of comorbidities and lack of access to health care. Disparities between municipalities in the quality of their health care delivery system became apparent in testing delays and capacity. These indicators explain a large part of the variation in COVID-19 underreporting and deaths and show that these inequalities disproportionately affected younger people. Science , abg5298, this issue p. eabg5298

Human mobility connects populations and can lead to large fluctuations in population density, both of which are important drivers of epidemics. Measuring population mobility during infectious disease outbreaks is challenging, but is a particularly important goal in the context of rapidly growing and highly connected urban centers in low and middle income countries, which can act to amplify and spread local epidemics nationally and internationally. Here, we combine estimates of population movement from mobile phone data for over 4 million subscribers in the megacity of Dhaka, Bangladesh, one of the most densely populated cities globally. We combine mobility data with epidemiological data from a household survey, to understand the role of population mobility on the spatial spread of the mosquito-borne virus chikungunya within and outside Dhaka city during a large outbreak in 2017. The peak of the 2017 chikungunya outbreak in Dhaka coincided with the annual Eid holidays, during which large numbers of people traveled from Dhaka to their native region in other parts of the country. We show that regular population fluxes around Dhaka city played a significant role in determining disease risk, and that travel during Eid was crucial to the spread of the infection to the rest of the country. Our results highlight the impact of large- scale population movements, for example during holidays, on the spread of infectious diseases. These dynamics are difficult to capture using traditional approaches, and we compare our results to a standard diffusion model, to highlight the value of real-time data from mobile phones for outbreak analysis, forecasting, and surveillance.

Rotavirus, a diarrheal pathogen spread via fecal-oral transmission, is typically characterized by a winter incidence peak in most countries. Unlike for cholera and other water-borne infections, the role of environmental and socioeconomic factors on the spatial variation of rotavirus seasonality remains unclear. Here, we analyze their association with rotavirus seasonality, specifically the odds of monsoon cases, across 46 locations from 2001 to 2012 in Dhaka. Drinking water from tubewells, compared to other sources, has a clear protective effect against cases during the monsoon, when flooding and water contamination are more likely. This finding supports a significant environmental component of transmission

Malaria control programs face difficult resource allocation decisions. Of particular concern for countries aiming for malaria elimination, the regular movement of individuals to and from endemic areas undermines local interventions by reintroducing infections and sustaining local transmission. Quantifying this movement of malaria parasites around a country has become a priority for national control programs, but remains methodologically challenging, particularly in areas with highly mobile populations. Here, we combined multiple data sources to measure the geographical spread of malaria parasites, including epidemiological surveillance data, travel surveys, parasite genetic data, and anonymized mobile phone data. We collected parasite genetic barcodes and travel surveys from 2,090 patients residing in 176 unions in southeast Bangladesh. We developed a genetic mixing index to quantify the likelihood of samples being local or imported. We then inferred the direction and intensity of parasite flow between locations using an epidemiological model, and estimated the proportion of imported cases assuming mobility patterns parameterized using the travel survey and mobile phone calling data. Our results show that each data source provided related but different information about the patterns of geographic spread of parasites. We identify a consistent north/south separation of the Chittagong Hill Tracts region in Bangladesh, and found that in addition to imported infections from forested regions, frequent mixing also occurs in low transmission but highly populated areas in the southwest. Thus, unlike risk maps generated from incidence alone, our maps provide evidence that elimination programs must address ongoing movement of parasites around the lower transmission areas in the southwest.

Background: There is limited information on the roles of different age groups in propagating pertussis outbreaks, and the temporal changes in those roles since the introduction of acellular pertussis vaccines. Methods: The relative roles of different age groups in propagating the 2010 and the 2014 pertussis epidemics in California were evaluated using the RR statistic that measures the change in the proportion of the age group among all detected cases before-vs.-after the epidemic peak. Results: For the 2010-11 epidemic, evidence for a predominant transmission age group was weak, with the largest RR estimates being 1.26(95%CI (1.08,1.46)) (aged 11-13y); 1.19(1.01,1.4) (aged 9-10y); 1.17(0.86,1.59) (aged 14-15y); 1.12(0.86,1.46) (aged 16-19y); and 1.1(0.89,1.36) (aged 7-8y). The 2014 epidemic showed a strong signal of the role of older adolescents, with the highest RR estimate being in those aged 14-15y (RR=1.83(1.61,2.07)), followed by adolescents aged 16-19y (RR=1.41(1.24,1.61)) and 11-13y (RR=1.26(1.12,1.41)), with lower RR estimates in other age groups. Conclusions: As the time following introduction of acellular pertussis vaccines in California progressed, older adolescents played an increasing role in transmission during the major pertussis outbreaks. Booster pertussis vaccination for older adolescents with vaccines effective against pertussis transmission should be considered with the aim of mitigating future pertussis epidemics in the community.