We assessed the prevalence of alien species as a driver of recent extinctions in five major taxa (plants, amphibians, reptiles, birds and mammals), using data from the IUCN Red List. Our results show that alien species are the second most common threat associated with species that have gone completely extinct from these taxa since AD 1500. Aliens are the most common threat associated with extinctions in three of the five taxa analysed, and for vertebrate extinctions overall.

The widely held hypothesis that enlarged brains have evolved as an adaptation to cope with novel or altered environmental conditions lacks firm empirical support. Here, we test this hypothesis for a major animal group (birds) by examining whether large-brained species show higher survival than small-brained species when introduced to nonnative locations. Using a global database documenting the outcome of >600 introduction events, we confirm that avian species with larger brains, relative to their body mass, tend to be more successful at establishing themselves in novel environments. Moreover, we provide evidence that larger brains help birds respond to novel conditions by enhancing their innovation propensity rather than indirectly through noncognitive mechanisms. These findings provide strong evidence for the hypothesis that enlarged brains function, and hence may have evolved, to deal with changes in the environment.

The arrival of humans on oceanic islands has precipitated a wave of extinctions among the islands' native birds. Nevertheless, the magnitude of this extinction event varies markedly between avifaunas. We show that the probability that a bird species has been extirpated from each of 220 oceanic islands is positively correlated with the number of exotic predatory mammal species established on those islands after European colonization and that the effect of these predators is greater on island endemic species. In contrast, the proportions of currently threatened species are independent of the numbers of exotic mammalian predator species, suggesting that the principal threat to island birds has changed through time as species susceptible to exotic predators have been driven extinct.

Abstract Aim We argue that ‘propagule pressure’, a key term in invasion biology, has been attributed at least three distinct definitions (with usage of a related term causing additional confusion). All of the definitions refer to fundamental concepts within the invasion process, with the result that the distinct importance of these different concepts has been at best diluted, and at worst lost. Location Global. Methods We reviewed pertinent literature on propagule pressure to resolve confusion about different uses of the term ‘propagule pressure’ and we introduced a new term for one variant, colonization pressure. We conducted a computer simulation whereby the introduction of species is represented as a simple sampling process to elucidate the relationship between propagule and colonization pressure. Results We defined colonization pressure as the number of species introduced or released to a single location, some of which will go on to establish a self‐sustaining population and some of which will not. We subsequently argued that colonization pressure should serve as a null hypothesis for understanding temporal or spatial differences in exotic species richness, as the more species that are introduced, the more we should expect to establish. Finally, using a simple simulation, we showed that propagule pressure is related to colonization pressure, but in a non‐linear manner. Main conclusion We suggest that the nature of the relationship between propagule pressure and colonization pressure, as well as the efficacy of various proxy measures of each, require more detailed exploration if invasion ecology is to continue to develop into a more predictive science.

Human-mediated transport beyond biogeographic barriers has led to the introduction and establishment of alien species in new regions worldwide. However, we lack a global picture of established alien species richness for multiple taxonomic groups. Here, we assess global patterns and potential drivers of established alien species richness across eight taxonomic groups (amphibians, ants, birds, freshwater fishes, mammals, vascular plants, reptiles and spiders) for 186 islands and 423 mainland regions. Hotspots of established alien species richness are predominantly island and coastal mainland regions. Regions with greater gross domestic product per capita, human population density, and area have higher established alien richness, with strongest effects emerging for islands. Ants and reptiles, birds and mammals, and vascular plants and spiders form pairs of taxonomic groups with the highest spatial congruence in established alien richness, but drivers explaining richness differ between the taxa in each pair. Across all taxonomic groups, our results highlight the need to prioritize prevention of further alien species introductions to island and coastal mainland regions globally. Analysis of eight taxonomic groups across 186 islands and 423 mainland regions reveals that those with the greatest gross domestic product per capita, human population density and area have the highest established alien species richness, with the strongest effects on islands.

Abstract The European starling, Sturnus vulgaris , is an ecologically significant, globally invasive avian species that is also suffering from a major decline in its native range. Here, we present the genome assembly and long-read transcriptome of an Australian-sourced European starling ( S. vulgaris vAU), and a second North American genome ( S. vulgaris vNA), as complementary reference genomes for population genetic and evolutionary characterisation. S. vulgaris vAU combined 10x Genomics linked-reads, low-coverage Nanopore sequencing, and PacBio Iso-Seq full-length transcript scaffolding to generate a 1050 Mb assembly on 1,628 scaffolds (72.5 Mb scaffold N50). Species-specific transcript mapping and gene annotation revealed high structural and functional completeness (94.6% BUSCO completeness). Further scaffolding against the high-quality zebra finch ( Taeniopygia guttata ) genome assigned 98.6% of the assembly to 32 putative nuclear chromosome scaffolds. Rapid, recent advances in sequencing technologies and bioinformatics software have highlighted the need for evidence-based assessment of assembly decisions on a case-by-case basis. Using S. vulgaris vAU, we demonstrate how the multifunctional use of PacBio Iso-Seq transcript data and complementary homology-based annotation of sequential assembly steps (assessed using a new tool, SAAGA) can be used to assess, inform, and validate assembly workflow decisions. We also highlight some counter-intuitive behaviour in traditional BUSCO metrics, and present B uscomp , a complementary tool for assembly comparison designed to be robust to differences in assembly size and base-calling quality. Finally, we present a second starling assembly, S. vulgaris vNA, to facilitate comparative analysis and global genomic research on this ecologically important species.

Abstract A species’ success during the invasion of new areas hinges on an interplay between demographic processes and the outcome of localized selection. Invasive European Starlings ( Sturnus vulgaris ) established populations in Australia and North America in the 19 th century. Here, we compare whole-genome sequences among native and independently introduced European Starling populations from three continents to determine how demographic processes interact with rapid adaptive evolution to generate similar genetic patterns in these recent and replicated invasions. Our results confirm that a post-bottleneck expansion may in fact support local adaptation. We find that specific genomic regions have differentiated even on this short evolutionary timescale, and suggest that selection best explains differentiation in at least two of these regions. This infamous and highly mobile invader adapted to novel selection (e.g., extrinsic factors), perhaps in part due to the demographic boom intrinsic to many invasions.

Abstract Invasive rodents, including house mice, are a major cause of environmental damage and biodiversity loss, particularly in island ecosystems. Eradication can be achieved through the distribution of rodenticide, but this approach is expensive to apply at scale, can have negative impacts (e.g. on non-target species, or through contamination), has animal ethics concerns, and has restrictions on where it can be used. Gene drives, which exhibit biased inheritance, have been proposed as a next generation strategy to control invasive alien pests and disease vectors. However, synthetic gene drives including CRISPR homing drives have proven to be technically challenging to develop in mice. The t haplotype is a naturally-occurring segregation distortion locus with highly biased transmission from heterozygous males. Here we propose a novel gene drive strategy for population suppression, t CRISPR , that leverages t haplotype bias and an embedded SpCas9/gRNA transgene to spread inactivating mutations in a haplosufficient female fertility gene. Using spatially explicit individual-based in silico modelling, we show that polyandry, sperm competition, dispersal, and transmission bias are critical factors for t CRISPR -mediated population suppression. Modelling of realistic parameter values indicates that t CRISPR can eradicate an island population of 200,000 mice while the unmodified t haplotype fails under the same conditions. We also demonstrate feasibility of this approach by engineering t CRISPR mice in a safe split drive format. t CRISPR mice exhibit high transmission of the modified t haplotype, and efficient generation and transmission of inactivating mutations in a recessive female fertility gene, crucially, at levels for which the modelling predicts that population eradication can occur. This is the first example of a feasible gene drive system for invasive alien rodent population control.

Reptiles and amphibians are popular in the exotic pet trade, where Australian species are valued for their rarity and uniqueness. Despite a near-complete ban on the export of Australian wildlife, smuggling and subsequent international trade frequently occur in an unregulated and unmonitored manner. In 2022, Australia listed over 100 squamates in Appendix III of the Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora (CITES) to better monitor this trade. We investigated current trade and assessed the value of this Australian CITES listing using web-scraping methods to monitor the online pet trade in Australian reptiles and amphibians, with additional data from published papers, trade databases, and seizure records. Despite the export ban, we identified 170 endemic herpetofauna (reptile and amphibian) species in international trade, 33 of which were not recorded previously in the international market, including 6 newly recorded genera. Ninety-two traded species were included in CITES appendices (59 added in 2022), but at least 78 other traded species remained unregulated. Among these, 5 of the 10 traded threatened species were unlisted, and we recommend they be considered for inclusion in CITES Appendix III. We also recommend the listing of all Diplodactylidae genera in Appendix III. Despite this family representing the greatest number of Australian species in trade, only one genus (of 7 traded) was included in the recent CITES amendments. Overall, a large number of Australian reptile and amphibian species are traded internationally and, although we acknowledge the value of Australia's recent CITES listing, we recommend the consideration of other taxa for similar inclusion in CITES.