SL
Sang-goo Lee
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
12
(75% Open Access)
Cited by:
1,454
h-index:
30
/
i10-index:
57
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genome analysis reveals insights into physiology and longevity of the Brandt’s bat Myotis brandtii

Inge Seim et al.Aug 20, 2013
Bats account for one-fifth of mammalian species, are the only mammals with powered flight, and are among the few animals that echolocate. The insect-eating Brandt’s bat (Myotis brandtii) is the longest-lived bat species known to date (lifespan exceeds 40 years) and, at 4–8 g adult body weight, is the most extreme mammal with regard to disparity between body mass and longevity. Here we report sequencing and analysis of the Brandt’s bat genome and transcriptome, which suggest adaptations consistent with echolocation and hibernation, as well as altered metabolism, reproduction and visual function. Unique sequence changes in growth hormone and insulin-like growth factor 1 receptors are also observed. The data suggest that an altered growth hormone/insulin-like growth factor 1 axis, which may be common to other long-lived bat species, together with adaptations such as hibernation and low reproductive rate, contribute to the exceptional lifespan of the Brandt’s bat. Bats account for 20 per cent of all mammals, these are the only mammals with powered flight, and are among the few animals that echolocate. Here, Seim et al. sequence the genome of the long-lived (>40 years) Brandt’s bat, Myotis brandtiiand provide clues to its evolution, longevity and other traits.
0
Citation256
0
Save
0

Adaptations to a Subterranean Environment and Longevity Revealed by the Analysis of Mole Rat Genomes

Xiaodong Fang et al.Aug 28, 2014
Subterranean mammals spend their lives in dark, unventilated environments that are rich in carbon dioxide and ammonia and low in oxygen. Many of these animals are also long-lived and exhibit reduced aging-associated diseases, such as neurodegenerative disorders and cancer. We sequenced the genome of the Damaraland mole rat (DMR, Fukomys damarensis) and improved the genome assembly of the naked mole rat (NMR, Heterocephalus glaber). Comparative genome analyses, along with the transcriptomes of related subterranean rodents, revealed candidate molecular adaptations for subterranean life and longevity, including a divergent insulin peptide, expression of oxygen-carrying globins in the brain, prevention of high CO2-induced pain perception, and enhanced ammonia detoxification. Juxtaposition of the genomes of DMR and other more conventional animals with the genome of NMR revealed several truly exceptional NMR features: unusual thermogenesis, an aberrant melatonin system, pain insensitivity, and unique processing of 28S rRNA. Together, these genomes and transcriptomes extend our understanding of subterranean adaptations, stress resistance, and longevity.
0
Citation188
0
Save
0

Investigations of high-Performance Ultrasonic Transducers based on PMN-PT Single Crystals

Thomas Herzog et al.May 24, 2024
Ultrasonic transducers for NDE applications are commonly based on Lead Zirconate Titanate or PZT, an inorganic compound and ceramic perovskite material. Until now the advantages of PMN-PT are used in medical applications, but are not implemented in NDE. Lead Magnesium Niobate-Lead Titanate (PMN-PT) is well known for its high sensitivity and broad frequency spectrum. While conventional PZT materials have an electromechanical coupling factor K33 (a measure of the conversion between electrical and acoustic energy) of about 0.72, PMN-PT materials reach peak values of more than 0.93. For applications with low signal amplitudes, high electronic noise and small transducer elements, the performance of ultrasonic probes can be significantly enhanced by using Lead Magnesium Niobate-Lead Titanate (PMN-PT) instead of PZT. This single-crystal material offers significantly better piezo parameters and leads to a higher sensitivity and larger bandwidth. There is a better depth resolution possible with this transducers as practical tests have shown. Similar to PZT it can also be fabricated in 1-3 piezo- composite technology. In a cooperation between Fraunhofer IKTS, iBULe Photonics, and IFU Diagnostic Systems, PMN-PT ultrasonic transducers are developed and optimized. The performance of phased array probes and single element transducers was measured by a so called PCUS® pro electronic front end from Fraunhofer and compared with equivalent PZT-based probes. As a result various single element and phased array transducers with im-proved performances are available for NDT of typical aerospace materials and applications. These test setups were used to weigh up the advantages and disadvantages, such as achievable precision or costs, for the implementation of a PMN-PT-based UT matrix probe. Based on this, a wiring variant adapted to the PMN-PT was developed and optimised for the matrix setups by pre- assembling the matching layers. The most favourable setup turned out to be bonding the PMN- PT composites to the prefabricated matching layers together with a rigid-flexible PCB frame. This enabled direct wire bonding of 64 matrix elements to the matching PCB pads on the rigid frame.
199

Universal DNA methylation age across mammalian tissues

A.T. Lu et al.Jan 19, 2021
ABSTRACT Aging is often perceived as a degenerative process resulting from random accrual of cellular damage over time. Despite this, age can be accurately estimated by epigenetic clocks based on DNA methylation profiles from almost any tissue of the body. Since such pan-tissue epigenetic clocks have been successfully developed for several different species, we hypothesized that one can build pan-mammalian clocks that measure age in all mammalian species. To address this, we generated data using 11,754 methylation arrays, each profiling up to 36 thousand cytosines in highly-conserved stretches of DNA, from 59 tissue-types derived from 185 mammalian species. From these methylation profiles, we constructed three age predictors, each with a single mathematical formula, termed universal pan-mammalian clocks that are accurate in estimating the age (r>0.96) of any mammalian tissue. Deviations between epigenetic age and chronological age relate to mortality risk in humans, mutations that affect the somatotropic axis in mice, and caloric restriction. We characterized specific cytosines, whose methylation levels change with age across most mammalian species. These cytosines are greatly enriched in polycomb repressive complex 2-binding sites, are located in regions that gradually lose chromatin accessibility with age and are proximal to genes that play a role in mammalian development, cancer, human obesity, and human longevity. Collectively, these results support the notion that aging is indeed evolutionarily conserved and coupled to developmental processes across all mammalian species - a notion that was long-debated without the benefit of this new compelling evidence. SUMMARY This study identifies and characterizes evolutionarily conserved cytosines implicated in the aging process across mammals and establishes pan mammalian epigenetic clocks.
Load More