Abstract The BQ.1 SARS-CoV-2 variant, also known as Cerberus, is one of the most recent Omicron descendant lineages. Compared to its direct progenitor BA.5, BQ.1 carries out some additional spike mutations in some key antigenic site which confer it further immune escape ability over other circulating lineage. In such a context, here we performed a genome-based survey aimed to obtain an as complete as possible nuance of this rapidly evolving Omicron subvariant. Genetic data suggests that BQ.1 represents an evolutionary blind background, lacking of the rapid diversification which is typical of a dangerous lineage. Indeed, the evolutionary rate of BQ.1 is very similar to that of BA.5 (7.6 × 10 −4 and 7 × 10 −4 subs/site/year, respectively), which is circulating by several months. Bayesian Skyline Plot reconstruction, indicates low level of genetic variability, suggesting that the peak has been reached around September 3, 2022. Structure analyses performed by comparing the properties of BQ.1 and BA.5 RBD indicated that the impact of the BQ.1 mutations on the affinity for ACE2 may be modest. Likewise, immunoinformatic analyses showed modest differences between the BQ.1 and the BA5 potential B-cells epitope. In conclusion, genetic and structural analysis on SARS-CoV-2 BQ.1 suggest that, it does not show evidence about its particular dangerous or high expansion capability. The monitoring genome-based must continue uninterrupted for a better understanding of its descendant and all other lineages.

Abstract Recombination is the main contributor to RNA virus evolution, and SARS-CoV-2 during the pandemic produced several recombinants. The most recent SARS-CoV-2 recombinant is the lineage labeled XBB, also known as Gryphon, which arose from BJ.1 and BM. 1.1.1. Here we performed a genome-based survey aimed to compare the new recombinant with its parental lineages that never became dominant. Genetic analyses indicated that the recombinant XBB and its first descendant XBB.1 show an evolutionary condition typical of an evolutionary blind background with no further epidemiologically relevant descendant. Genetic variability and expansion capabilities are slightly higher than parental lineages. Bayesian Skyline Plot indicates that XBB reached its plateau around October 6, 2022 and after an initial rapid growth the viral population size did not further expand, and around November 10, 2022 its levels of genetic variability decreased. Simultaneously with the reduction of the XBB population size, an increase of the genetic variability of its first sub-lineage XBB.1 occurred, that in turn reached the plateau around November 9, 2022 showing a kind of vicariance with its direct progenitors. Structure analysis indicates that the affinity for ACE2 surface in XBB/XBB.1 RBDs is weaker than for BA.2 RBD. In conclusion, nowadays XBB and XBB.1 do not show evidence about a particular danger or high expansion capability. Genome-based monitoring must continue uninterrupted in order to individuate if further mutations can make XBB more dangerous or generate new subvariants with different expansion capability.

Human papillomavirus (HPV) is a widespread viral pathogen, responsible for a significant burden of cervical and other cancers worldwide. Over the past decades, the development and widespread adoption of prophylactic HPV vaccines have dramatically reduced the incidence of HPV-related diseases. However, despite the efficacy of these vaccines, global immunization efforts still face several obstacles, including low vaccination coverage in low- and middle-income countries, vaccine hesitancy, and disparities in access to healthcare. This review aims to provide a comprehensive overview of the current state of HPV vaccines, including their mechanisms of action, safety profiles, and real-world efficacy. We will explore the impact of HPV vaccines on cancer prevention, examine the challenges related to vaccine distribution and uptake, and assess the role of public health policies in improving global vaccination rates. Additionally, the review will highlight the latest advancements in therapeutic HPV vaccines, ongoing research into next-generation vaccines, and the potential of HPV vaccination strategies in the context of personalized medicine. By examining these factors, we aim to provide insights into the future directions of HPV vaccination and its role in global public health.

The Ohrid trout, Salmo letnica, is an endemic species of Lake Ohrid, one of Europe's oldest lakes, located on the Albania-North Macedonia border. This species exhibits distinct morphotypes-Salmo letnica typicus, Salmo letnica aestivalis, Salmo letnica balcanicus, and Salmo letnica lumi-that differ in morphology and spawning behaviour. However, the extent of their genetic differentiation remains unclear. This study aimed to investigate the genetic variability and population structure of Salmo letnica morphotypes using the mitochondrial Control Region as molecular marker. We obtained 127 sequences from Salmo letnica morphotypes and compared them with sequences from other species within the genus Salmo. Phylogenetic and clustering analyses revealed no significant genetic structuring among the four morphotypes, suggesting an ecological differentiation not (yet) fixed at mitochondrial level. Additionally, our findings suggest that the modern Salmo letnica population likely originated in Lake Ohrid from Salmo farioides founders through evolutionary differentiation, potentially driven by environmental changes. Future studies incorporating a larger number of samples from both Salmo letnica and Salmo farioides are essential to fully understand the evolutionary and ecological dynamics of Salmo letnica morphotypes.