MS
Melissa Schepers
Author with expertise in Epigenetic Modifications and Their Functional Implications
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(40% Open Access)
Cited by:
347
h-index:
16
/
i10-index:
20
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Marked differences in survival rate between smokers and nonsmokers with HPV 16‐associated tonsillar carcinomas

Harriët Hafkamp et al.Mar 21, 2008
Abstract Oncogenic human papillomavirus (HPV) is a causative agent in a subgroup of head and neck carcinomas, particularly tonsillar squamous cell carcinomas (TSCC). This study was undertaken because controversial data exist on the physical status of HPV‐DNA and the use of p16 INK4A overexpression as surrogate HPV marker, and to examine the impact of HPV and tobacco consumption on the clinical course of TSCC. Tissue sections of 81 TSCC were analyzed by HPV 16‐specific fluorescence in situ hybridization (FISH) and p16 INK4A ‐specific immunohistochemistry. Results were correlated with clinical and demographic data. HPV 16 integration was detected by FISH as punctate signals in 33 out of 81 (41%) TSCC, 32 of which showed p16 INK4A accumulation. Only 5 out of 48 HPV‐negative tumors showed p16 INK4A immunostaining ( p < 0.0001). The presence of HPV furthermore correlates significantly with low tobacco ( p = 0.002) and alcohol intake ( p = 0.011), poor differentiation grade ( p = 0.019), small tumor size ( p = 0.024), presence of a local metastasis ( p = 0.001) and a decreased (loco)regional recurrence rate ( p = 0.039). Statistical analysis revealed that smoking significantly increases the risk of cancer death from TSCC and that non‐smoking patients with HPV‐containing TSCC show a remarkably better disease‐specific survival rate. HPV 16 is integrated in 41% of TSCC and strongly correlates with p16 INK4A overexpression, implicating the latter to be a reliable HPV biomarker. Patients with HPV‐positive tumors show a favorable prognosis as compared to those with HPV‐negative tumors, but tobacco use is the strongest prognostic indicator. These findings indicate that oncogenic processes in the tonsils of non‐smokers differ from those occurring in smokers, the former being related to HPV 16 infection. © 2008 Wiley‐Liss, Inc.
0
Citation344
0
Save
12

From methylation to myelination: epigenomic and transcriptomic profiling of chronic inactive demyelinated multiple sclerosis lesions

Assia Tiane et al.Jan 13, 2023
Abstract Introduction In the progressive phase of multiple sclerosis (MS), the hampered differentiation capacity of oligodendrocyte precursor cells (OPCs) eventually results in remyelination failure. We have previously shown that DNA methylation of Id2/Id4 is highly involved in OPC differentiation and remyelination. In this study, we took an unbiased approach by determining genome-wide DNA methylation patterns within chronically demyelinated MS lesions and investigated how certain epigenetic signatures relate to OPC differentiation capacity. Methods We compared genome-wide DNA methylation and transcriptional profiles between chronically demyelinated MS lesions and matched normal-appearing white matter (NAWM), making use of post-mortem brain tissue (n=9/group). DNA methylation differences that inversely correlated with mRNA expression of their corresponding genes were validated for their cell-type specificity in laser-captured OPCs using pyrosequencing. The CRISPR-dCas9-DNMT3a/TET1 system was used to epigenetically edit human-iPSC-derived oligodendrocytes to assess the effect on cellular differentiation. Results Our data show hypermethylation of CpGs within genes that cluster in gene ontologies related to myelination and axon ensheathment. Cell type-specific validation indicates a region-dependent hypermethylation of MBP , encoding for myelin basic protein, in OPCs obtained from white matter lesions compared to NAWM-derived OPCs. By altering the DNA methylation state of specific CpGs within the promotor region of MBP , using epigenetic editing, we show that cellular differentiation can be bidirectionally manipulated using the CRISPR-dCas9-DNMT3a/TET1 system in vitro . Conclusion Our data indicate that OPCs within chronically demyelinated MS lesions acquire an inhibitory phenotype, which translates into hypermethylation of crucial myelination related genes. Altering the epigenetic status of MBP can restore the differentiation capacity of OPCs and possibly boost (re)myelination.
12
Citation3
0
Save
4

Amelioration of Functional and Histopathological Consequences after Spinal Cord Injury through Phosphodiesterase 4D (PDE4D) Inhibition

Melissa Schepers et al.Jan 1, 2023
Spinal cord injury (SCI) severely impacts the patient9s quality of life. Two key strategies are currently being considered to improve clinical outcomes after SCI: modulation of the neuroinflammatory response, which exacerbates the primary injury, and stimulation of neuro-regenerative repair mechanisms to improve functional recovery. Cyclic adenosine monophosphate (cAMP) is a second messenger involved in both processes. Following SCI, intracellular levels of cAMP are known to decrease over time. Therefore, preventing cAMP degradation represents a promising strategy to suppress inflammation while stimulating regeneration. Intracellular cAMP levels are controlled by its hydrolyzing enzymes phosphodiesterases (PDEs). The PDE4 family is most abundantly expressed in the central nervous system (CNS) and its inhibition has been shown to be therapeutically relevant for managing SCI pathology. Unfortunately, the use of full PDE4 inhibitors at therapeutic doses is associated with severe emetic side effects, hampering their translation toward clinical applications. Therefore, in this study, we evaluated the effect of inhibiting specific PDE4 subtypes (PDE4B and PDE4D) on inflammatory and regenerative processes following SCI, as inhibitors selective for these subtypes have been demonstrated to be well-tolerated. We reveal that administration of the PDE4D inhibitor Gebr32a, but not the PDE4B inhibitor A33, improved functional as well as histopathological outcomes after SCI, comparable to results obtained with the full PDE4 inhibitor roflumilast. Furthermore, using a luminescent human iPSC-derived neurospheroid model, we show that PDE4D inhibition stabilizes neural viability by preventing apoptosis and stimulating neuronal differentiation. These findings strongly suggest that specific PDE4D inhibition offers a novel therapeutic approach for SCI.