The classification of myeloid neoplasms and acute leukemias was last updated in 2016 within a collaboration between the World Health Organization (WHO), the Society for Hematopathology, and the European Association for Haematopathology. This collaboration was primarily based on input from a clinical advisory committees (CACs) composed of pathologists, hematologists, oncologists, geneticists, and bioinformaticians from around the world. The recent advances in our understanding of the biology of hematologic malignancies, the experience with the use of the 2016 WHO classification in clinical practice, and the results of clinical trials have indicated the need for further revising and updating the classification. As a continuation of this CAC-based process, the authors, a group with expertise in the clinical, pathologic, and genetic aspects of these disorders, developed the International Consensus Classification (ICC) of myeloid neoplasms and acute leukemias. Using a multiparameter approach, the main objective of the consensus process was the definition of real disease entities, including the introduction of new entities and refined criteria for existing diagnostic categories, based on accumulated data. The ICC is aimed at facilitating diagnosis and prognostication of these neoplasms, improving treatment of affected patients, and allowing the design of innovative clinical trials.

Philadelphia chromosome–like acute lymphoblastic leukemia (Ph-like ALL) is characterized by a gene-expression profile similar to that of BCR–ABL1–positive ALL, alterations of lymphoid transcription factor genes, and a poor outcome. The frequency and spectrum of genetic alterations in Ph-like ALL and its responsiveness to tyrosine kinase inhibition are undefined, especially in adolescents and adults.

The prognosis for adults with relapsed acute lymphoblastic leukemia is poor. We sought to determine whether inotuzumab ozogamicin, an anti-CD22 antibody conjugated to calicheamicin, results in better outcomes in patients with relapsed or refractory acute lymphoblastic leukemia than does standard therapy.In this phase 3 trial, we randomly assigned adults with relapsed or refractory acute lymphoblastic leukemia to receive either inotuzumab ozogamicin (inotuzumab ozogamicin group) or standard intensive chemotherapy (standard-therapy group). The primary end points were complete remission (including complete remission with incomplete hematologic recovery) and overall survival.Of the 326 patients who underwent randomization, the first 218 (109 in each group) were included in the primary intention-to-treat analysis of complete remission. The rate of complete remission was significantly higher in the inotuzumab ozogamicin group than in the standard-therapy group (80.7% [95% confidence interval {CI}, 72.1 to 87.7] vs. 29.4% [95% CI, 21.0 to 38.8], P<0.001). Among the patients who had complete remission, a higher percentage in the inotuzumab ozogamicin group had results below the threshold for minimal residual disease (0.01% marrow blasts) (78.4% vs. 28.1%, P<0.001); the duration of remission was longer in the inotuzumab ozogamicin group (median, 4.6 months [95% CI, 3.9 to 5.4] vs. 3.1 months [95% CI, 1.4 to 4.9]; hazard ratio, 0.55 [95% CI, 0.31 to 0.96]; P=0.03). In the survival analysis, which included all 326 patients, progression-free survival was significantly longer in the inotuzumab ozogamicin group (median, 5.0 months [95% CI, 3.7 to 5.6] vs. 1.8 months [95% CI, 1.5 to 2.2]; hazard ratio, 0.45 [97.5% CI, 0.34 to 0.61]; P<0.001); the median overall survival was 7.7 months (95% CI, 6.0 to 9.2) versus 6.7 months (95% CI, 4.9 to 8.3), and the hazard ratio was 0.77 (97.5% CI, 0.58 to 1.03) (P=0.04). In the safety population, the most frequent grade 3 or higher nonhematologic adverse events with inotuzumab ozogamicin were liver-related. Veno-occlusive liver disease of any grade occurred in 15 patients (11%) who received inotuzumab ozogamicin and in 1 patient (1%) who received standard therapy.The rate of complete remission was higher with inotuzumab ozogamicin than with standard therapy, and a higher percentage of patients in the inotuzumab ozogamicin group had results below the threshold for minimal residual disease. Both progression-free and overall survival were longer with inotuzumab ozogamicin. Veno-occlusive liver disease was a major adverse event associated with inotuzumab ozogamicin. (Funded by Pfizer; INO-VATE ALL ClinicalTrials.gov number, NCT01564784.).

The molecular determinants of clinical responses to decitabine therapy in patients with acute myeloid leukemia (AML) or myelodysplastic syndromes (MDS) are unclear.

The genetic basis of hypodiploid acute lymphoblastic leukemia (ALL), a subtype of ALL characterized by aneuploidy and poor outcome, is unknown. Genomic profiling of 124 hypodiploid ALL cases, including whole-genome and exome sequencing of 40 cases, identified two subtypes that differ in the severity of aneuploidy, transcriptional profiles and submicroscopic genetic alterations. Near-haploid ALL with 24-31 chromosomes harbor alterations targeting receptor tyrosine kinase signaling and Ras signaling (71%) and the lymphoid transcription factor gene IKZF3 (encoding AIOLOS; 13%). In contrast, low-hypodiploid ALL with 32-39 chromosomes are characterized by alterations in TP53 (91.2%) that are commonly present in nontumor cells, IKZF2 (encoding HELIOS; 53%) and RB1 (41%). Both near-haploid and low-hypodiploid leukemic cells show activation of Ras-signaling and phosphoinositide 3-kinase (PI3K)-signaling pathways and are sensitive to PI3K inhibitors, indicating that these drugs should be explored as a new therapeutic strategy for this aggressive form of leukemia.

Chronic myeloid leukemia (CML) is a hematopoietic stem cell disease with distinct biological and clinical features. The biologic basis of the stereotypical progression from chronic phase through accelerated phase to blast crisis is poorly understood. We used DNA microarrays to compare gene expression in 91 cases of CML in chronic (42 cases), accelerated (17 cases), and blast phases (32 cases). Three thousand genes were found to be significantly (P < 10(-10)) associated with phase of disease. A comparison of the gene signatures of chronic, accelerated, and blast phases suggest that the progression of chronic phase CML to advanced phase (accelerated and blast crisis) CML is a two-step rather than a three-step process, with new gene expression changes occurring early in accelerated phase before the accumulation of increased numbers of leukemia blast cells. Especially noteworthy and potentially significant in the progression program were the deregulation of the WNT/beta-catenin pathway, the decreased expression of Jun B and Fos, alternative kinase deregulation, such as Arg (Abl2), and an increased expression of PRAME. Studies of CML patients who relapsed after initially successful treatment with imatinib demonstrated a gene expression pattern closely related to advanced phase disease. These studies point to specific gene pathways that might be exploited for both prognostic indicators as well as new targets for therapy.

Abstract We performed a retrospective comparison of presenting features, planned treatment, complete remission (CR) rate, and outcome of 321 adolescents and young adults (AYAs) ages 16 to 20 years with newly diagnosed acute lymphoblastic leukemia (ALL) who were treated on consecutive trials in either the Children's Cancer Group (CCG) or the Cancer and Leukemia Group B (CALGB) from 1988 to 2001. CR rates were identical, 90% for both CALGB and CCG AYAs. CCG AYAs had a 63% event-free survival (EFS) and 67% overall survival (OS) at 7 years in contrast to the CALGB AYAs, in which 7-year EFS was only 34% (P < .001; relative hazard rate [RHR] = 2.2) and OS was 46% (P < .001; RHR = 1.9). While CALGB AYAs aged 16 to 17 years achieved similar outcomes to all CCG AYAs with a 7-year EFS of 55%, the EFS for 18- to 20-year-old CALGB patients was only 29%. Comparison of the regimens showed that CCG AYAs received earlier and more intensive central nervous system prophylaxis and higher cumulative doses of nonmyelosuppressive agents. There were no differences in outcomes of those who reached maintenance therapy on time compared with those who were delayed. Based on these observations, a prospective study for AYAs with ALL using the more successful approach of the CCG has been initiated.

Recent genomic studies have identified chromosomal rearrangements defining new subtypes of B-progenitor acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), however many cases lack a known initiating genetic alteration. Using integrated genomic analysis of 1,988 childhood and adult cases, we describe a revised taxonomy of B-ALL incorporating 23 subtypes defined by chromosomal rearrangements, sequence mutations or heterogeneous genomic alterations, many of which show marked variation in prevalence according to age. Two subtypes have frequent alterations of the B lymphoid transcription-factor gene PAX5. One, PAX5alt (7.4%), has diverse PAX5 alterations (rearrangements, intragenic amplifications or mutations); a second subtype is defined by PAX5 p.Pro80Arg and biallelic PAX5 alterations. We show that p.Pro80Arg impairs B lymphoid development and promotes the development of B-ALL with biallelic Pax5 alteration in vivo. These results demonstrate the utility of transcriptome sequencing to classify B-ALL and reinforce the central role of PAX5 as a checkpoint in B lymphoid maturation and leukemogenesis. Analysis of 1,988 cases of B-cell acute lymphoblastic leukemia characterizes 23 subtypes defined by genomic features and shows that two of the subtypes have frequent PAX5 alterations.

ObjectiveThe human bone marrow contains mesenchymal stem cells capable of differentiating along multiple mesenchymal cell lineages. Using a non-human primate model, we sought to determine whether the systemic infusion of baboon-derived mesenchymal stem cells was associated with toxicity and whether these cells were capable of homing to and persisting within the bone marrow.Materials and MethodsFive baboons (Papio anubis) were administered lethal irradiation followed by intravenous autologous hematopoietic progenitor cells combined with either autologous or allogeneic mesenchymal stem cells that had been expanded in culture. In four of these baboons, the mesenchymal stem cells were genetically modified with a retroviral vector encoding either the enhanced green fluorescent protein gene or the human placental alkaline phosphatase gene for tracking purposes. A sixth animal received only intravenous gene marked autologous mesenchymal stem cells but no hematopoietic stem cells or conditioning irradiation.ResultsFollowing culture, baboon mesenchymal stem cells appeared morphologically as a homogeneous population of spindle-shaped cells that were identified by the monoclonal antibodies SH-3 and SH-4. These cells did not express the hematopoietic markers CD34 or CD45. Baboon mesenchymal stem cells isolated from primary culture were capable of differentiating along both adipogenic and osteogenic lineages. There was no acute or chronic toxicity associated with the intravenous infusion of mesenchymal stem cells. In all five recipients of gene marked mesenchymal stem cells, transgene was detected in post-transplant bone marrow biopsies. In two animals receiving autologous mesenchymal stem cells, including the one non-conditioned recipient, transgene could be detected over 1 year following infusion. In one recipient of allogeneic gene marked mesenchymal stem cells, transgene was detected in the bone marrow at 76 days following infusion.ConclusionThese data demonstrate that baboon mesenchymal stem cells: 1) are not associated with significant toxicity when administered intravenously, 2) are capable of homing to the bone marrow following intravenous infusion, and 3) have the capacity to establish residence within the bone marrow for an extended duration following systemic administration.

Purpose Philadelphia chromosome (Ph) –like acute lymphoblastic leukemia (ALL) is a high-risk subtype of childhood ALL characterized by kinase-activating alterations that are amenable to treatment with tyrosine kinase inhibitors. We sought to define the prevalence and genomic landscape of Ph-like ALL in adults and assess response to conventional chemotherapy. Patients and Methods The frequency of Ph-like ALL was assessed by gene expression profiling of 798 patients with B-cell ALL age 21 to 86 years. Event-free survival and overall survival were determined for Ph-like ALL versus non–Ph-like ALL patients. Detailed genomic analysis was performed on 180 of 194 patients with Ph-like ALL. Results Patients with Ph-like ALL accounted for more than 20% of adults with ALL, including 27.9% of young adults (age 21 to 39 years), 20.4% of adults (age 40 to 59 years), and 24.0% of older adults (age 60 to 86 years). Overall, patients with Ph-like ALL had an inferior 5-year event-free survival compared with patients with non–Ph-like ALL (22.5% [95% CI, 14.9% to 29.3%; n = 155] v 49.3% [95% CI, 42.8% to 56.2%; n = 247], respectively; P < .001). We identified kinase-activating alterations in 88% of patients with Ph-like ALL, including CRLF2 rearrangements (51%), ABL class fusions (9.8%), JAK2 or EPOR rearrangements (12.4%), other JAK-STAT sequence mutations (7.2%), other kinase alterations (4.1%), and Ras pathway mutations (3.6%). Eleven new kinase rearrangements were identified, including four involving new kinase or cytokine receptor genes and seven involving new partners for previously identified genes. Conclusion Ph-like ALL is a highly prevalent subtype of ALL in adults and is associated with poor outcome. The diverse range of kinase-activating alterations in Ph-like ALL has important therapeutic implications. Trials comparing the addition of tyrosine kinase inhibitors to conventional therapy are required to evaluate the clinical utility of these agents in the treatment of Ph-like ALL.