KK
Ken Kubo
Author with expertise in Macrophage Activation and Polarization
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(56% Open Access)
Cited by:
1,625
h-index:
37
/
i10-index:
63
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Results of three-year mass screening programme for lung cancer using mobile low-dose spiral computed tomography scanner

Shusuke Sone et al.Jan 1, 2001
The aim of this study was to evaluate the usefulness of annual screening for lung cancer by low-dose computed tomography (CT) and the characteristics of identified lung cancers. Subjects consisted of 5483 general population aged 40–74 years, who received initial CT scans in 1996, followed by repeat annual scans for most subjects in 1997 and 1998, with a total of 13 786 scans taken during 1996–1998. Work-up examinations for patients with suspicious lesions were conducted using diagnostic CTs. The initial screening in 1996 detected suspicious nodules in 279 (5.1%) of 5483 subjects, and 22 (8%) were confirmed surgically to have lung cancer. Corresponding figures in 1997 and 1998 screening studies were 173 (3.9%) of 4425 and 25 (14%) of 173, and 136 (3.5%) of 3878 and 9 (7%) of 136, respectively. The sensitivity and specificity of detecting surgically confirmed lung cancer were 55% (22/40) and 95% (4960/5199) in 1996 and 83% (25/30) and 97% (4113/4252) in 1997 screening, respectively. 88% (55/60) of lung cancers identified on screening and surgically confirmed were AJCC stage IA. Our trial allowed detection of nearly 11 times the expected annual number of early lung cancers. Repeat CT allowed the detection of more aggressive, rapidly growing lung cancers, compared to those in the initial screening. © 2001 Cancer Research Campaign
16

Comprehensive characterization of migration profiles of murine cerebral cortical neurons during development using FlashTag labeling

Satoshi Yoshinaga et al.Oct 5, 2020
Summary In mammalian cerebral neocortex, different regions have different cytoarchitecture, neuronal birthdates and functions. In most regions, neuronal migratory profiles have been speculated similar to each other based on observations using thymidine analogues. Few reports investigated regional migratory differences from mitosis at the ventricular surface. Here, in mice, we applied FlashTag technology, in which dyes are injected intraventricularly, to describe migratory profiles. We revealed a mediolateral regional difference in migratory profiles of neurons that is dependent on the developmental stages, e.g., neurons labeled at E12.5-15.5 reached their destination earlier dorsomedially than dorsolaterally even where there were underlying ventricular surfaces, reflecting sojourning below the subplate. This difference was hardly recapitulated by thymidine analogues, which visualize neurogenic gradient, suggesting biological significance different from neurogenic gradient. These observations advance understanding of cortical development, portraying strength of FlashTag in studying migration, and are thus a resource for studies of normal and abnormal neurodevelopment.
0

Integrative Transcriptomics Reveals Layer 1 Astrocytes Altered in Schizophrenia

Julio Leon et al.Jun 28, 2024
Schizophrenia is one of the most prevalent psychiatric disorders with unclear pathophysiology despite a century-long history of intense research. Schizophrenia affects multiple networks across different brain regions. The anterior cingulate cortex (ACC) is the region that connects the limbic system to cognitive areas such as the prefrontal cortex and represents a pivotal region for the etiology of schizophrenia; however, the molecular pathology, considering its cellular and anatomical complexity, is not well understood. Here, we performed an integrative analysis of spatial and single-nucleus transcriptomics of the postmortem ACC of people with schizophrenia, together with a thorough histological analysis. The data revealed major transcriptomics signatures altered in schizophrenia, pointing at the dysregulation of glial cells, primarily in astrocytes. We further discovered a decrease in the cellular density and abundance of processes of interlaminar astrocytes, a subpopulation of astrocytes specific to primates that localize in the layer 1 and influence the superficial cortical microenvironment across layer 1 and layers 2/3 of the cortex. Our study suggests that aberrant changes in interlaminar astrocytes could explain the cell-to-cell circuit alterations found in schizophrenia and represent novel therapeutic targets to ameliorate schizophrenia-associated dysfunction.
0

A single-cell atlas of transcribed cis-regulatory elements in the human genome

Jonathan Moody et al.Jan 1, 2023
Transcribed cis-regulatory elements (tCREs), such as promoters and enhancers, are fundamental to modulate gene expression and define cell identity. The detailed mapping of tCREs at single-cell resolution is essential for understanding the regulatory mechanisms that govern cellular functions. Prior tCRE catalogs, limited by bulk analysis, have often overlooked cellular heterogeneity. We have constructed a tCRE atlas using single-cell 5-RNA-seq, capturing over 340,000 single-cells from 23 human tissues and annotating more than 175,000 tCREs, substantially enhancing the scope and granularity of existing cis-regulatory element annotations in the human genome. This atlas unveils patterns of gene regulation, revealing connections between broadly expressed promoters and cell type-specific distal tCREs. Assessing trait heritability at single-cell resolution with a novel tCRE module-based approach, we uncovered the nuanced trait-gene regulatory relationships across a continuum of cell populations, offering insights beyond traditional gene-level and bulk-sample analyses. Our study bridges the gap between gene regulation and trait heritability, underscoring the potential of single-cell analysis to elucidate the genetic foundations of complex traits. These insights set the stage for future research to investigate the impact of genetic variations on diseases at the individual level, advancing the understanding of cellular and molecular basis of trait heritability.