Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
YG
Yevgeniy Gindin
Author with expertise in Pancreatic Cancer Research and Treatment
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
260
h-index:
15
/
i10-index:
18
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The Exomes of the NCI-60 Panel: A Genomic Resource for Cancer Biology and Systems Pharmacology

Ogan Abaan et al.Jul 15, 2013
Abstract The NCI-60 cell lines are the most frequently studied human tumor cell lines in cancer research. This panel has generated the most extensive cancer pharmacology database worldwide. In addition, these cell lines have been intensely investigated, providing a unique platform for hypothesis-driven research focused on enhancing our understanding of tumor biology. Here, we report a comprehensive analysis of coding variants in the NCI-60 panel of cell lines identified by whole exome sequencing, providing a list of possible cancer specific variants for the community. Furthermore, we identify pharmacogenomic correlations between specific variants in genes such as TP53, BRAF, ERBBs, and ATAD5 and anticancer agents such as nutlin, vemurafenib, erlotinib, and bleomycin showing one of many ways the data could be used to validate and generate novel hypotheses for further investigation. As new cancer genes are identified through large-scale sequencing studies, the data presented here for the NCI-60 will be an invaluable resource for identifying cell lines with mutations in such genes for hypothesis-driven research. To enhance the utility of the data for the greater research community, the genomic variants are freely available in different formats and from multiple sources including the CellMiner and Ingenuity websites. Cancer Res; 73(14); 4372–82. Â©2013 AACR.
0
Citation260
0
Save
0

Tumor-selective effects of active RAS inhibition in pancreatic ductal adenocarcinoma

Urszula Wasko et al.Jan 1, 2023
Broad-spectrum RAS inhibition holds the potential to benefit roughly a quarter of human cancer patients whose tumors are driven by RAS mutations. However, the impact of inhibiting RAS functions in normal tissues is not known. RMC-7977 is a highly selective inhibitor of the active (GTP-bound) forms of KRAS, HRAS, and NRAS, with affinity for both mutant and wild type (WT) variants. As >90% of human pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) cases are driven by activating mutations in KRAS, we assessed the therapeutic potential of RMC-7977 in a comprehensive range of PDAC models, including human and murine cell lines, human patient-derived organoids, human PDAC explants, subcutaneous and orthotopic cell-line or patient derived xenografts, syngeneic allografts, and genetically engineered mouse models. We observed broad and pronounced anti-tumor activity across these models following direct RAS inhibition at doses and concentrations that were well-tolerated in vivo. Pharmacological analyses revealed divergent responses to RMC-7977 in tumor versus normal tissues. Treated tumors exhibited waves of apoptosis along with sustained proliferative arrest whereas normal tissues underwent only transient decreases in proliferation, with no evidence of apoptosis. Together, these data establish a strong preclinical rationale for the use of broad-spectrum RAS inhibition in the setting of PDAC.
1

Hepatic Deletion of X-box Binding Protein 1 in Farnesoid X Receptor Null Mice Leads to Enhanced Liver Injury

Xiaoying Liu et al.Mar 4, 2022
Abstract Background & Aims Farnesoid X receptor (FXR) regulates bile acid metabolism and FXR null ( Fxr -/- ) mice have elevated bile acid levels and progressive liver injury. The inositol-requiring enzyme 1α (IRE1α)/X-box binding protein 1 (XBP1) pathway is a protective pathway of the unfolded protein response (UPR) that is activated in response to ER stress. In this study we sought to determine the role of the UPR in Fxr -/- mice. Approach & Results We examined hepatic UPR gene and protein expression in 10- and 24-week-old wild type (WT) and Fxr -/- mice. Hepatic XBP1 and other UPR pathways were activated in 24-week-old Fxr -/- mice, but not WT mice. To further determine the role of the liver UPR activation in Fxr -/- mice, we generated mice with FXR and liver-specific XBP1 double knockout (DKO, Fxr -/- Xbp1 LKO ) and Fxr -/- Xbp1 fl/fl single knockout (SKO) mice and characterized their phenotypes at different ages. DKO mice demonstrated enhanced liver injury, apoptosis and fibrosis compared with SKO mice. RNA-seq revealed increased gene expression in apoptosis, inflammation and cell proliferation pathways in DKO mice. The proapoptotic C/EBP-homologous protein (CHOP) pathway was activated in DKO mice. At age 60 weeks, all DKO mice and no SKO mice spontaneously developed liver tumors. Conclusions The hepatic XBP1 pathway is activated in older Fxr -/- mice and has a protective role. The potential interaction between XBP1 and FXR signaling may be important in modulating the hepatocellular cholestatic stress responses.