The new detector for data recording by the CLEO collaboration at the Cornell Electron Storage Ring is described. This detector has been designed to optimize studying e+ e− annihilation into hadronic matter at a total energy of 10 GeV. It consists of high precesion charged particle tracking chambers and an electromagnetic calorimeter together with systems for particle identification. The design of the detector and its performance over the first year and a half of operation are presented.

New measurements of the $\eta$ and $K^0$ masses have been performed using decays to 3$\pi^0$ with the NA48 detector at the CERN SPS. Using symmetric decays to reduce systematic effects, the results $M(\eta) = 547.843\pm0.051$ MeV/c$^2$ and $M(K^0) = 497.625\pm0.031$ MeV/c$^2$ were obtained.

Abstract The switch/sucrose non-fermentable (SWI/SNF) chromatin remodeling complex is frequently deregulated during progression to castration-resistant prostate cancer (CRPC). Proteolysis targeting chimera (PROTAC) therapies degrading SWI/SNF ATPases offer a novel approach to interfere with androgen receptor (AR) signaling in AR-dependent CRPC (CRPC-AR). To explore the utility of SWI/SNF therapy beyond AR-sensitive CRPC, we investigated SWI/SNF ATPase targeting agents in AR-negative CRPC. SWI/SNF targeting PROTAC treatment of cell lines and organoid models reduced the viability of not only CRPC-AR but also WNT-signaling dependent AR-negative CRPC (CRPC-WNT), which accounts for about 10% of all clinical CRPC cases. In CRPC-WNT models, we discovered that SWI/SNF ATPase SMARCA4 depletion interfered with WNT signaling via the master transcriptional regulator TCF7L2 (TCF4). Functionally, TCF7L2 maintains proliferation via the MAPK signaling axis in this subtype of CRPC by forming a complex with β-Catenin and AP-1 transcription factor c-JUN. These data suggest a mechanistic rationale for MAPK inhibition or interventions that disrupt the formation of the pro-proliferative TCF7L2-β-Catenin-JUN complex in the CRPC-WNT subclass of advanced prostate cancer.

Abstract Mounting evidence suggests that enhancer RNA (eRNA) transcription start sites (TSSs) provide higher sensitivity and specificity for enhancer identification than histone modifications and chromatin accessibility. The extent to which changes in eRNA transcription correspond to changes in enhancer activity, however, remains unclear. Here, we used precision run-on and capped RNA sequencing (PRO-cap) to assess changes in enhancer activity in response to treatment with the androgen receptor signaling inhibitor, enzalutamide (ENZ). We identified 6,189 high-confidence candidate enhancers in the human prostate cancer cell line, LNCaP; 853 of which demonstrated significant changes in activity in response to drug treatment. Notably, we found that 67% and 54% of drug-responsive enhancers did not show similar changes in activity in previous studies that utilized ChIP-seq and ATAC-seq, respectively. Strikingly, 79% of regions with increased eRNA transcription showed no other biochemical alterations, implying that PRO-cap can capture a set of precise changes in enhancer activity that classical approaches lack the sensitivity to detect. We performed in vivo functional validations of candidate enhancers and found that CRISPRi targeting of PRO-cap-specific drug-responsive enhancers impaired ENZ regulation of downstream target genes, suggesting that changes in eRNA TSSs mark true biological changes in enhancer activity with high sensitivity. Our study highlights the utility of using PRO-cap as a complementary approach to canonical biochemical methods for detecting precise changes in enhancer activity and, in particular, for better understanding disease progression and responses to treatment.

Long non-coding RNAs (lncRNAs) represent an emerging class of genes which play significant and diverse roles in human cancers. Nevertheless, the functional repertoires of lncRNAs in cancer cell subtypes remains unknown since most studies are focused on protein coding genes. Here, we explored the contribution of lncRNAs in Colorectal Cancer (CRC) heterogeneity. We analyzed 49436 single-cells from 29 CRC patients and showed that lncRNAs are significantly more cell type specific compared to protein-coding genes. We identified 996 lncRNAs strongly enriched in epithelial cells. Among these, 98 were found to be differentially expressed in tumor samples compared to normal controls, when integrating 270 bulk CRC profiles. We validated the upregulation of two of them (CASC19 and LINC00460) in CRC cell lines and showed their involvement in CRC proliferation by CRISPR-Cas9 knock down experiments. This study highlights a list of novel RNA targets for potential CRC therapeutics, substantiated through experimental validation.

ABSTRACT Recent evidence has highlighted the role of N 6 -methyladenosine (m 6 A) in the regulation of mRNA expression, stability and translation, supporting a potential role for post-transcriptional regulation mediated by m 6 A in cancer. Here we explore prostate cancer as an exemplar and demonstrate that low levels of N 6 -adenosine-methyltransferase ( METTL3 ) is associated with advanced metastatic disease. To explore this relationship, we generated the first prostate m 6 A maps, and further examined how METTL3 regulates expression at the level of transcription, translation, and protein. Significantly, transcripts encoding extracellular matrix proteins are consistently upregulated with METTL3 knockdown. We also examined the relationship between METTL3 and androgen signaling and discovered the upregulation of a hepatocyte nuclear factor-driven gene signature that is associated with therapy resistance in prostate cancer. Significantly, METTL3 knockdown rendered the cells resistant to androgen receptor antagonists, implicating changes in m 6 A as a mechanism for therapy resistance in metastatic prostate cancer.