Anchorage-independent growth is the ability of transformed cells to grow independently of a solid surface, and is a hallmark of carcinogenesis. The soft agar colony formation assay is a well-established method for characterizing this capability in vitro and is considered to be one of the most stringent tests for malignant transformation in cells. This assay also allows for semi-quantitative evaluation of this capability in response to various treatment conditions. Here, we will demonstrate the soft agar colony formation assay using a murine lung carcinoma cell line, CMT167, to demonstrate the tumor suppressive effects of two members of the Wnt signaling pathway, Wnt7A and Frizzled-9 (Fzd-9). Concurrent overexpression of Wnt7a and Fzd-9 caused an inhibition of colony formation in CMT167 cells. This shows that expression of Wnt7a ligand and its Frizzled-9 receptor is sufficient to suppress tumor growth in a murine lung carcinoma model.

African American/Black individuals have a disproportionate cancer burden, including the highest mortality and the lowest survival of any racial/ethnic group for most cancers. Every 3 years, the American Cancer Society estimates the number of new cancer cases and deaths for Black people in the United States and compiles the most recent data on cancer incidence (herein through 2018), mortality (through 2019), survival, screening, and risk factors using population-based data from the National Cancer Institute and the Centers for Disease Control and Prevention. In 2022, there will be approximately 224,080 new cancer cases and 73,680 cancer deaths among Black people in the United States. During the most recent 5-year period, Black men had a 6% higher incidence rate but 19% higher mortality than White men overall, including an approximately 2-fold higher risk of death from myeloma, stomach cancer, and prostate cancer. The overall cancer mortality disparity is narrowing between Black and White men because of a steeper drop in Black men for lung and prostate cancers. However, the decline in prostate cancer mortality in Black men slowed from 5% annually during 2010 through 2014 to 1.3% during 2015 through 2019, likely reflecting the 5% annual increase in advanced-stage diagnoses since 2012. Black women have an 8% lower incidence rate than White women but a 12% higher mortality; further, mortality rates are 2-fold higher for endometrial cancer and 41% higher for breast cancer despite similar or lower incidence rates. The wide breast cancer disparity reflects both later stage diagnosis (57% localized stage vs 67% in White women) and lower 5-year survival overall (82% vs 92%, respectively) and for every stage of disease (eg, 20% vs 30%, respectively, for distant stage). Breast cancer surpassed lung cancer as the leading cause of cancer death among Black women in 2019. Targeted interventions are needed to reduce stark cancer inequalities in the Black community.

Ubiquitination of histone H2A at lysine 119 residue (H2AK119ub) plays critical roles in a wide range of physiological processes, including Polycomb gene silencing

Telemedicine has routinely been used in cancer care delivery for the past 3 years. The current state of digital health provides convenience and efficiency for both health-care professional and patient, but challenges exist in equitable access to virtual services. As increasingly newer technologies are added to telehealth platforms, it is essential to eliminate barriers to access through technical, procedural, and legislative improvements. Moving forward, implementation of new strategies can help eliminate disparities in virtual cancer care, facilitate delivery of treatment in the home, and improve real-time data collection for patient safety and clinical trial participation. The ultimate goal will be to extend high-quality survival for all patients with cancer through improved digital delivery of cancer care.

Importance Rates of early-onset (before 50 years of age) colorectal cancer (EOCRC) are increasing, with notable differences across racial and ethnic groups. Limited data are available on EOCRC-related mortality differences when disaggregating racial and ethnic groups. Objective To investigate racial and ethnic differences in EOCRC mortality, including disaggregation of Asian American populations separately, including Native Hawaiian or Other Pacific Islander populations and specific Asian American groups, and to quantify the contribution of clinical and sociodemographic factors accounting for these differences. Design, Setting, and Participants This population-based cohort study included California Cancer Registry data for individuals aged 18 to 49 years with EOCRC between January 1, 2000, to December 31, 2019. Median follow-up was 4.2 (IQR, 1.6-10.0) years. The data analysis was conducted between July 1, 2021, and September 30, 2024. Exposure Race and ethnicity defined as Asian American (and 7 disaggregated subgroups), Hispanic, Native Hawaiian or Other Pacific Islander, non-Hispanic American Indian or Alaska Native, non-Hispanic Black, and non-Hispanic White. Main Outcomes and Measures Cox proportional hazards regression models were used to measure association between race and ethnicity and CRC mortality risk, yielding adjusted hazard ratios (AHRs) and 95% CIs. Associations of sociodemographic, health system, and clinical factors with differences in mortality by racial and ethnic minority group were assessed using sequential modeling. Results There were 22 834 individuals diagnosed with EOCRC between 2000 and 2019 (12 215 [53.5%] male; median age, 44 [IQR, 39-47] years). Racial and ethnic identity included 3544 (15.5%) Asian American, 6889 (30.2%) Hispanic, 135 (0.6%) Native Hawaiian or Other Pacific Islander, 125 (0.5%) non-Hispanic American Indian or Alaska Native, 1668 (7.3%) non-Hispanic Black, and 10 473 (45.9%) non-Hispanic White individuals. Compared with non-Hispanic White individuals, higher EOCRC mortality was found for Native Hawaiian or Other Pacific Islander (AHR, 1.34; 95% CI, 1.01-1.76) and non-Hispanic Black (AHR, 1.18; 95% CI, 1.07-1.29) individuals. Disaggregation of Asian American ethnic groups revealed notable heterogeneity, but no single group had increased EOCRC mortality risk after full adjustment for covariates. For Hispanic individuals, there was higher EOCRC mortality (AHR, 1.15 [95% CI, 1.08-1.22]) with the base model (adjustment for age, sex, and tumor characteristics), but the association disappeared once neighborhood socioeconomic status was added to the base model (AHR, 1.00 [95% CI, 0.94-1.06]). Similarly, there was higher EOCRC mortality among Southeast Asian individuals with the base model (AHR, 1.17 [95% CI, 1.03-1.34], but that association disappeared with the addition of insurance status to the model (AHR, 1.10 [95% CI, 0.96-1.25]). Conclusions and Relevance In this cohort study, racial and ethnic disparities in EOCRC mortality were evident, with the highest burden among Native Hawaiian or Other Pacific Islander and non-Hispanic Black individuals. These results provide evidence of the role of social determinants of health in explaining these differences.

Abstract Integrating single cell RNAseq (scRNAseq) and spatial transcriptomics (ST) data is still challenging especially when the spatial resolution is poor. For cellular resolution spatial mapping, we have developed deep learning-based SC2Spa to learn the intricate spatial mapping rules from the transcriptome to its location from ST data. Benchmarking tests show that SC2Spa uniquely recapitulates tissue architecture from scRNAseq. SC2Spa successfully mapped scRNAseq even to various low resolution Visium data. SC2Spa identified spatially variable genes and suggested negative regulatory relationships between genes. SC2Spa armored with deep learning provides a new way to map the transcriptome to its spatial location and perform subsequent analyses.

The Together for Health-Virginia (T4H-VA) Research Program aimed to advance cancer prevention, education, and outreach in Virginia. Creating a representative and inclusive cohort is critical to the program's mission and quality of outcomes. The T4H-VA Research Program utilized a multi-modal sampling approach to improve population health assessment. The current study describes the technology-based, non-probability platform developed for this purpose and compares differences between the probability-based (mail-based) and non-probability-based (e-cohort) methods with respect to participant demographics, health characteristics, and health information and technology use.

Epigenetic changes link medical, social, and environmental factors with cardiovascular and kidney disease and, more recently, with cancer. The mechanistic link between metabolic health and epigenetic changes is only starting to be investigated. In our in vitro and in vivo studies, we performed a broad analysis of the link between hyperinsulinemia and chromatin acetylation; our top "hit" was chromatin opening at H3K9ac.