IA
Isaac Alter
Author with expertise in MicroRNA Regulation in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
4
h-index:
4
/
i10-index:
4
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
9

Single-cell transcriptomic profiling of healthy and fibrotic adult zebrafish liver reveals conserved cell identities and stellate cell activation phenotypes with human liver

Joshua Morrison et al.Aug 6, 2021
Abstract Liver fibrosis is the excessive accumulation of extracellular matrix that can progress to cirrhosis and failure if untreated (1). The mechanisms of fibrogenesis are multi-faceted and remain elusive with no approved antifibrotic treatments available (2). Here we use single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of the adult zebrafish liver to study the molecular and cellular dynamics of the liver at a single-cell level and demonstrate the value of the adult zebrafish as a model for studying liver fibrosis. scRNA-seq reveals transcriptionally unique populations of hepatic cell types that comprise the zebrafish liver. Joint clustering with human liver scRNA-seq data demonstrates high conservation of transcriptional profiles and human marker genes in zebrafish cell types. Human and zebrafish hepatic stellate cells (HSCs), the driver cell in liver fibrosis (3), specifically show conservation of transcriptional profiles and we uncover Colec11 as a novel, conserved marker for zebrafish HSCs. To demonstrate the power of scRNA-seq to study liver fibrosis, we performed scRNA-seq on our zebrafish model of a pediatric liver disease with characteristic early, progressive liver fibrosis caused by mutation in mannose phosphate isomerase (MPI) (4–6). Comparison of differentially expressed genes from human and zebrafish MPI mutant HSC datasets demonstrated similar activation of fibrosis signaling pathways and upstream regulators. CellPhoneDB analysis revealed important receptor-ligand interactions within normal and fibrotic states. This study establishes the first scRNA-seq atlas of the adult zebrafish liver, highlights the high degree of similarity to the human liver, and strengthens its value as a model to study liver fibrosis. Significance Statement To our knowledge, this is the first single-cell characterization of the adult zebrafish liver, both in a normal physiologic state and in the setting of liver fibrosis. We identify transcriptionally distinct zebrafish liver cell populations and a high degree of transcriptional conservation between human and zebrafish cells across the majority of hepatic cell types. Furthermore, using this scRNA transcriptome, we identify key signaling pathways in zebrafish HSCs that are replicated in human HSCs and implicated in the regulation of liver fibrosis. Our work provides a useful resource that can be used to aid research using the zebrafish liver and asserts the usefulness of the adult zebrafish to study liver fibrosis.
9
Citation4
0
Save
0

Speech Quality Perception in Unilateral Cochlear Implant Users With Single‐Sided Deafness

Scott Kelly et al.Aug 9, 2024
Abstract Objective Cochlear implant (CI) users frequently complain about speech quality perception (SQP). In patients undergoing cochlear implantation for single‐sided deafness, there is concern that poor SQP from the implanted ear will negatively impact binaural (CI + normal hearing [NH]) SQP. In this study, we investigate if binaural SQP is measurably different than unimplanted NH alone. Study Design Cross‐sectional study. Setting Tertiary care center. Methods Fifteen unilateral CI users with NH in the contralateral ear completed the validated Columbia Speech Quality Instrument. This instrument consists of 9 audio clips rated across 14 specific speech qualities using a 10‐point visual analog scale. SQP was assessed in 3 conditions: CI only, NH only, and CI + NH. Results Median speech quality scores were worse in the CI only condition compared to the NH only (50.0 vs 72.6, P = .0003) and binaural (50.0 vs 71.0, P = .007) conditions. Median speech quality scores were not significantly different between the NH only and binaural conditions (72.6 vs 71, P = .8). Compared to NH, CI speech quality sounded less clear, less natural, and more mechanical. Conclusion Compared to NH, SQP is poorer with a CI alone. However, in contrast to expectation, there is no significant difference between NH and binaural SQP. This suggests poorer CI speech perception does not negatively impact binaural SQP in patients undergoing cochlear implantation for single‐sided deafness.
0

Mannose Supplementation Curbs Liver Steatosis and Fibrosis in Murine MASH by Inhibiting Fructose Metabolism

John Hong et al.Jan 17, 2024
Abstract Metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH) can progress to cirrhosis and liver cancer. There are no approved medical therapies to prevent or reverse disease progression. Fructose and its metabolism in the liver play integral roles in MASH pathogenesis and progression. Here we focus on mannose, a simple sugar, which dampens hepatic stellate cell activation and mitigates alcoholic liver disease in vitro and in vivo . In the well-validated FAT-MASH murine model, oral mannose supplementation improved both liver steatosis and fibrosis at low and high doses, whether administered either at the onset of the model (“Prevention”) or at week 6 of the 12-week MASH regimen (“Reversal”). The in vivo anti-fibrotic effects of mannose supplementation were validated in a second model of carbon tetrachloride-induced liver fibrosis. In vitro human and mouse primary hepatocytes revealed that the anti-steatotic effects of mannose are dependent on the presence of fructose, which attenuates expression of ketohexokinase (KHK), the main enzyme in fructolysis. KHK is decreased with mannose supplementation in vivo and in vitro, and overexpression of KHK abrogated the anti-steatotic effects of mannose. Our study identifies mannose as a simple, novel therapeutic candidate for MASH that mitigates metabolic dysregulation and exerts anti-fibrotic effects.
0

Perspective: Improving the understanding of sleep deprivation and strategies for fatigue management across the medical education continuum: a call to action

Isaac Alter et al.Nov 26, 2024
Free AccessREM: A Publication for Residents and FellowsPerspective: Improving the understanding of sleep deprivation and strategies for fatigue management across the medical education continuum: a call to action Isaac L. Alter, AB, Rachel B. Kutler, BA, Yi Cai, MD, Ilene M. Rosen, MD, MSCE Isaac L. Alter, AB Department of Otolaryngology – Head and Neck Surgery, Columbia University Irving Medical Center, New York, NY Columbia University Vagelos College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York, NY , Rachel B. Kutler, BA Department of Otolaryngology – Head and Neck Surgery, Columbia University Irving Medical Center, New York, NY Columbia University Vagelos College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York, NY , Yi Cai, MD Department of Otolaryngology – Head and Neck Surgery, Columbia University Irving Medical Center, New York, NY Columbia University Vagelos College of Physicians and Surgeons, Columbia University, New York, NY , Ilene M. Rosen, MD, MSCE Division of Sleep Medicine, Department of Medicine, Perelman School of Medicine at the University of Pennsylvania, Philadelphia, PA Published Online:November 26, 2024https://doi.org/10.5664/jcsm.11502SectionsEpubPDF ShareShare onFacebookXLinkedInRedditEmail ToolsAdd to favoritesDownload CitationsTrack Citations About Previous article Next article FiguresReferencesRelatedDetails ISSN (print): 1550-9389ISSN (online): 1550-9397Frequency: Monthly Metrics History Published onlineNovember 26, 2024 Information© 2024 American Academy of Sleep MedicinePDF download