ZA
Zackie Aktary
Author with expertise in Melanin Pigmentation in Mammalian Skin
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
11
/
i10-index:
13
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

G-quadruplexes inHaloferax volcanii

Zackie Aktary et al.Jan 16, 2024
ABSTRACT The archaeal domain is a taxonomically rich component of microbial communities that inhabit a wide range of habitats on Earth, including the human body. Phylogenomic analyses have indicated that archaea represent the closest known relatives of eukaryotes, thus suggesting that eukaryotes may have evolved from an archaeal ancestor. G-quadruplex structures (G4), formed by guanine rich sequences, are among the most intensively studied local DNA/RNA structures and regulate key biological processes such as replication and gene expression. A bioinformatics analysis of the genome of the salt-loving archaea H. volcanii revealed a large number of potential G4 sequences (PQS). Biophysical analyses showed that a representative panel of these sequences form stable G4 structures under physiological conditions in vitro . In addition, immunofluorescence experiments using the G4-specific antibody, BG4, detected G4s in vivo at the single-cell level with super-resolution microscopy. Moreover, we directly visualized G4 in exponentially growing or stationary cells both at the DNA and RNA levels. G4s were also observed in the RNA and DNA of the hyperthermophile archaeon T. barophilus . Finally, we identified helicases potentially involved in G4 unfolding. Together, with H. volcanii as a new model, our work helps to fill the gap between bacteria and eukaryotic organisms for G4 studies and will aid in uncovering the evolutionary history of G4 structures in the tree of life.
4

BRN2 is a non-canonical melanoma tumor-suppressor

Michael Hamm et al.Jan 13, 2021
ABSTRACT While the major drivers of melanoma initiation, including activation of NRAS/BRAF and loss of PTEN or CDKN2A , have been identified, the role of key transcription factors that impose altered transcriptional states in response to deregulated signaling is not well understood. The POU domain transcription factor BRN2 is a key regulator of melanoma invasion, yet its role in melanoma initiation remains unknown. Here, we show that BRN2 haplo-insufficiency is sufficient to promote melanoma initiation and metastasis, acting as a non-canonical tumor suppressor. Mechanistically, BRN2 directly modulates PTEN expression, and PI3K signaling, to drive tumor initiation and progression. Collectively our results reveal that somatic deletion of one BRN2 allele elicits melanoma initiation and progression. SIGNIFICANCE Here, we report frequent mono-allelic loss of the transcription factor BRN2 in human cutaneous melanoma metastases. We developed a mouse model for Brn2-deficient melanoma based on the most common alterations ( Braf V600E and Pten loss) in human melanoma and established the role of Brn2 as a functional regulator of tumor initiation, tumor growth, and the formation of metastases in vivo . Mechanistically, BRN2 loss increases PI3K-signaling through PTEN repression, either via MITF induction or not. Overall, we describe a novel tumor suppressor of high prevalence in human melanoma that regulates several steps of in vivo melanomagenesis through two previously unknown molecular mechanisms.