Abstract Imported cases present a considerable challenge to the elimination of malaria. Traditionally, patient travel history has been used to identify imported cases, but the long-latency liver stages confound this approach in Plasmodium vivax . Molecular tools to identify and map imported cases offer a more robust approach, that can be combined with drug resistance and other surveillance markers in high-throughput, population-based genotyping frameworks. Using a machine learning approach incorporating hierarchical FST (HFST) and decision tree (DT) analysis applied to 831 P. vivax genomes from 20 countries, we identified a 28-Single Nucleotide Polymorphism (SNP) barcode with high capacity to predict the country of origin. The Matthews correlation coefficient (MCC), which provides a measure of the quality of the classifications, ranging from −1 (total disagreement) to 1 (perfect prediction), exceeded 0.9 in 15 countries in cross-validation evaluations. When combined with an existing 37-SNP P. vivax barcode, the 65-SNP panel exhibits MCC scores exceeding 0.9 in 17 countries with up to 30% missing data. As a secondary objective, several genes were identified with moderate MCC scores (median MCC range from 0.54-0.68), amenable as markers for rapid testing using low-throughput genotyping approaches. A likelihood-based classifier framework was established, that supports analysis of missing data and polyclonal infections. To facilitate investigator-lead analyses, the likelihood framework is provided as a web-based, open-access platform (vivaxGEN-geo) to support the analysis and interpretation of data produced either at the 28-SNP core or full 65-SNP barcode. These tools can be used by malaria control programs to identify the main reservoirs of infection so that resources can be focused to where they are needed most.

ABSTRACT The population structure of the malaria parasite Plasmodium falciparum can reveal underlying demographic and adaptive evolutionary processes. Here, we analyse population structure in 4,376 P. falciparum genomes from 21 countries across Africa. We identified a strongly differentiated cluster of parasites, comprising ∼1.2% of samples analysed, geographically distributed over 13 countries across the continent. Members of this cluster, named AF1, carry a genetic background consisting of a large number of highly differentiated variants, rarely observed outside this cluster, at a multitude of genomic loci distributed across most chromosomes. At these loci, the AF1 haplotypes appear to have common ancestry, irrespective of the sampling location; outside the shared loci, however, AF1 members are genetically similar to their sympatric parasites. AF1 parasites sharing up to 23 genomic co-inherited regions were found in all major regions of Africa, at locations over 7,000 km apart. We coined the term cryptotype to describe a complex common background which is geographically widespread, but concealed by genomic regions of local origin. Most AF1 differentiated variants are functionally related, comprising structural variations and single nucleotide polymorphisms in components of the MSP1 complex and several other genes involved in interactions with red blood cells, including invasion and erythrocyte antigen export. We propose that AF1 parasites have adapted to some as yet unidentified evolutionary niche, by acquiring a complex compendium of interacting variants that rarely circulate separately in Africa. As the cryptotype spread across the continent, it appears to have been maintained mostly intact in spite of recombination events, suggesting a selective advantage. It is possible that other cryptotypes circulate in Africa, and new analysis methods may be needed to identify them.

Adiposity can be measured using BMI (which is based on weight and height) as well as indices of abdominal adiposity. We examined the association between BMI and waist-to-height ratio (WHtR) within and across populations of different world regions and quantified how well these two metrics discriminate between people with and without hypertension.

The present study was conducted to determine the prevalence and factors associated with adherence to iron-folic acid supplementation (IFAS) among pregnant women in eastern Sudan.

Introduction: Malaria during pregnancy can lead to maternal and perinatal adverse effects. Despite the preventive measures, recent research has shown that malaria during pregnancy is still a threatening health problem, especially in Sub-Saharan African countries. The current study was conducted to determine the prevalence of and factors associated with placental malaria in Rabak Hospital in central Sudan. Methodology: A cross-sectional study was conducted from September to October 2021. Pregnant women who delivered at the Rabak Maternity Hospital in Central Sudan were included. A questionnaire was used to gather both obstetric and socio-demographic information. Blood films for malaria were prepared using the maternal, placental, and cord blood, and a placental histology was performed. A logistic regression analysis was performed. Results: For the 208 women, the medians (interquartile range) of their age and parity were 25 (21.0 ‒30.0) years and 2 (1‒4), respectively. Twenty-five (12.0%) of the women had used insecticide-treated nets. Active infection, active-chronic infection, and past-chronic infection were detected in four (1.9%), five (2.4%), and 35 (16.8%) placentas, respectively. One hundred and sixty-four (78.8%) placentas showed no signs of infection. Logistic regression analysis showed that none of the examined factors (age, parity, education, antenatal care level, use of insecticide-treated nets, and blood group) was associated with placental malaria. Conclusions: Malaria affects 20% of pregnant women, regardless of their age and parity. Preventative measures should therefore be encouraged in this area.

Introduction Clinical case reports enrich medical literature by presenting rare medical issues. However, case reports that do not adhere to a standard template often lack rigor and limit their usefulness in clinical guidance. Several guidelines for reporting case reports have been structured, while further improvements are still required. The current guideline (CaReL) aims to enhance the comprehensiveness of case reports by integrating a detailed literature review. Methods In total, 56 researchers were selected based on specific publication criteria for structuring the guidelines. The guideline development was based on a two-step consensus process, including a literature review and survey distribution. Responses underwent scrutiny to ensure reliability and validity. Content validity was assessed, with revisions made to achieve a content validity index exceeding 0.78. The guideline's feasibility and effectiveness were evaluated by pilot testing, with feedback incorporated for finalization, ensuring the robustness and practicality of the guideline. Results The CaReL guidelines can improve the quality of case reports through a comprehensive checklist with an increased emphasis on literature review. In addition to traditional sections with their subsections discussed in previous guidelines, the checklist also focuses on literature review in the abstract and discussion. Conclusion The CaReL guidelines offer a comprehensive structure for documenting case reports. They highlight the importance of incorporating a literature review to better introduce medical issues to readers and scholars and embedding reported cases into the current scientific state of the art. Implementing these guidelines can promote knowledge sharing and improve patient care

Physiological and biochemical changes during normal pregnancy may precipitate a state of insulin resistance (IR) without disrupting the body's physiology. The present study aimed to investigate the association between the indices of insulin sensitivity and blood pressure among normotensive and euglycemic pregnant women. The present cross‑sectional study was conducted between February and December, 2021. It comprised 133 normal pregnant women who were non‑diabetic and had normal blood pressure. The oral glucose tolerance test and fasting insulin levels were assessed, and the indices of insulin sensitivity and β‑cell function were computed between the 24th and 28th weeks of gestation. A multivariate linear regression analysis was conducted to investigate the factors affecting systolic and diastolic blood pressure levels, including the indices of insulin sensitivity, β‑cell function and others. Univariate linear analysis revealed that fasting insulin levels (β=0.95, P=0.027), the quantitative insulin sensitivity check index (QUICKI; β=‑24.39, P=0.012) and diastolic blood pressure (β=0.76, P<0.001) were associated with systolic blood pressure. Of note, parity (β=0.83, P=0.031), fasting insulin levels (β=0.63, P=0.010), homeostasis model assessment of IR (HOMA‑IR; β=3.19, P=0.013) and QUICKI (β=‑11.97, P=0.029) were the factors that were associated with diastolic blood pressure. In the multivariate linear regression analysis, neither fasting insulin, nor QUICKI were found to be associated with systolic blood pressure. Fasting insulin levels (β=0.48; P=0.040), HOMA‑IR (β=2.51; P=0.043) were associated with diastolic blood pressure. On the whole, in the present study, fasting insulin levels and HOMA‑IR were associated with diastolic blood pressure levels without the emergence of high blood pressure readings or gestational diabetes. Further studies with a longitudinal approach are warranted to further identify associations with IR. 

Background: Malnutrition among adolescents is a major public health issue. This problem is particularly pressing in Sudan, an African country where there is scarce published data on the nutritional status of adolescents. In this study, we aimed to assess the nutritional status of adolescents in eastern Sudan. Methods: A community-based cross-sectional survey was carried out in Gadarif, eastern Sudan. A questionnaire was used to collect sociodemographic data, and the anthropometric measurements (weight and height) of adolescent participants were recorded. Height-for-age and body mass index-for-age Z-scores were calculated using the WHO anthropometric standards. Binary and multivariate multinomial regression analyses were performed. Results: A total of 388 adolescents were included in this survey, 207 (53.4%) were female, and 181 (46.6%) were male. The median (interquartile) age was 13.9 (12.0–16.0) years. The results showed that a total of 29 (7.5%), 93 (24.0%), 33 (8.5%), and 16 (4.1%) adolescents were stunted, thin, overweight, and obese, respectively. None of the investigated factors (age, sex, parents’ education levels, and occupation) were associated with stunting. In the multivariate multinomial analysis, the male sex was associated with thinness (OR = 2.41, 95.0% CI = 1.47–3.94). Moreover, adolescents whose mothers had an education lower than secondary level were at a lower risk of overweight/obesity (OR = 0. 0.35, 95.0% CI = 0. 0.35). Conclusions: While both undernutrition and overnutrition exist in eastern Sudan, undernutrition is more common. Male sex and mothers’ education levels are associated with malnutrition.

Background: Hypertension and anemia are major health problems globally. However, data regarding the association between hypertension and hemoglobin/anemia among adults are few and controversial. Therefore, the current study aimed to investigate the associations between hemoglobin/anemia and hypertension among Sudanese adults. Methods: A community-based cross-sectional study was conducted in Northern Sudan from September to December 2022. The participants' sociodemographic characteristics were assessed using a questionnaire. Standardized procedures measured participants' weight, height, body mass index (BMI), hemoglobin, and hypertension. Multivariate regression analysis was performed to determine the association between anemia and hypertension. Results: Three hundred eighty-four adults were enrolled; 195 (50.8%) and 189 (49.2%) were males and females, respectively. The median interquartile age of the enrolled adults of age, BMI, and hemoglobin level was 45.0 (33.0‒55.8) years, 26.6 (22.6‒30.6) kg/m 2 , and 13.4 (12.4‒14.4) g/dl, respectively. Of 384 adults, 216 (56.3%) had hypertension, and 148 (38.5%) were newly diagnosed hypertensive. Eighty-six adults (22.4%) had anemia. In univariate analysis, while increasing age, being female, being unmarried, having a positive family history of hypertension, and increasing BMI were positively associated with hypertension, anemia was inversely associated with hypertension. Education, occupation, cigarette smoking, and alcohol consumption were not associated with hypertension. In multivariate analysis, age (adjusted odd ratio [AOR] = 1.05, 95% confidence interval [CI] = 1.03‒1.07), BMI (AOR= 1.07, 95% CI = 1.03‒1.12) were inversely associated with hypertension, being female (AOR = 2.92, 95% CI = 1.43‒5.94), positive family history of hypertension (AOR= 1.73, 95% CI = 1.09‒2.75), and hemoglobin level (AOR= 1.34, 95% CI = 1.12‒1.61) were associated with hypertension. Anemia (AOR = 0.58, 95% CI = 0.34‒0.99) was inversely associated with hypertension. Conclusion: Both anemia and hypertension are major public health problems in Northern Sudan. Anemia is associated with hypertension. Further research is needed to explore the complex association between hemoglobin/anemia and hypertension. Keywords: hypertension, hemoglobin, age, female, anemia, body mass index, Sudan