Standardized criteria for diagnosis and response assessment are needed to interpret and compare clinical trials and for approval of new therapeutic agents by regulatory agencies. Therefore, a National Cancer Institute-sponsored Working Group (NCI-WG) on chronic lymphocytic leukemia (CLL) published guidelines for the design and conduct of clinical trials for patients with CLL in 1988, which were updated in 1996. During the past decade, considerable progress has been achieved in defining new prognostic markers, diagnostic parameters, and treatment options. This prompted the International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (IWCLL) to provide updated recommendations for the management of CLL in clinical trials and general practice.

We have sequenced the genomes of 110 small cell lung cancers (SCLC), one of the deadliest human cancers. In nearly all the tumours analysed we found bi-allelic inactivation of TP53 and RB1, sometimes by complex genomic rearrangements. Two tumours with wild-type RB1 had evidence of chromothripsis leading to overexpression of cyclin D1 (encoded by the CCND1 gene), revealing an alternative mechanism of Rb1 deregulation. Thus, loss of the tumour suppressors TP53 and RB1 is obligatory in SCLC. We discovered somatic genomic rearrangements of TP73 that create an oncogenic version of this gene, TP73Δex2/3. In rare cases, SCLC tumours exhibited kinase gene mutations, providing a possible therapeutic opportunity for individual patients. Finally, we observed inactivating mutations in NOTCH family genes in 25% of human SCLC. Accordingly, activation of Notch signalling in a pre-clinical SCLC mouse model strikingly reduced the number of tumours and extended the survival of the mutant mice. Furthermore, neuroendocrine gene expression was abrogated by Notch activity in SCLC cells. This first comprehensive study of somatic genome alterations in SCLC uncovers several key biological processes and identifies candidate therapeutic targets in this highly lethal form of cancer.

Background On the basis of promising results that were reported in several phase 2 trials, we investigated whether the addition of the monoclonal antibody rituximab to first-line chemotherapy with fludarabine and cyclophosphamide would improve the outcome of patients with chronic lymphocytic leukaemia. Methods Treatment-naive, physically fit patients (aged 30–81 years) with CD20-positive chronic lymphocytic leukaemia were randomly assigned in a one-to-one ratio to receive six courses of intravenous fludarabine (25 mg/m2 per day) and cyclophosphamide (250 mg/m2 per day) for the first 3 days of each 28-day treatment course with or without rituximab (375 mg/m2 on day 0 of first course, and 500 mg/m2 on day 1 of second to sixth courses) in 190 centres in 11 countries. Investigators and patients were not masked to the computer-generated treatment assignment. The primary endpoint was progression-free survival (PFS). Analysis was by intention to treat. This study is registered with ClinicalTrials.gov, number NCT00281918. Findings 408 patients were assigned to fludarabine, cyclophosphamide, and rituximab (chemoimmunotherapy group) and 409 to fludarabine and cyclophosphamide (chemotherapy group); all patients were analysed. At 3 years after randomisation, 65% of patients in the chemoimmunotherapy group were free of progression compared with 45% in the chemotherapy group (hazard ratio 0·56 [95% CI 0·46–0·69], p<0·0001); 87% were alive versus 83%, respectively (0·67 [0·48–0·92]; p=0·01). Chemoimmunotherapy was more frequently associated with grade 3 and 4 neutropenia (136 [34%] of 404 vs 83 [21%] of 396; p<0·0001) and leucocytopenia (97 [24%] vs 48 [12%]; p<0·0001). Other side-effects, including severe infections, were not increased. There were eight (2%) treatment-related deaths in the chemoimmunotherapy group compared with ten (3%) in the chemotherapy group. Interpretation Chemoimmunotherapy with fludarabine, cyclophosphamide, and rituximab improves progression-free survival and overall survival in patients with chronic lymphocytic leukaemia. Moreover, the results suggest that the choice of a specific first-line treatment changes the natural course of chronic lymphocytic leukaemia. Funding F Hoffmann-La Roche.

The monoclonal anti-CD20 antibody rituximab, combined with chemotherapeutic agents, has been shown to prolong overall survival in physically fit patients with previously untreated chronic lymphocytic leukemia (CLL) but not in those with coexisting conditions. We investigated the benefit of the type 2, glycoengineered antibody obinutuzumab (also known as GA101) as compared with that of rituximab, each combined with chlorambucil, in patients with previously untreated CLL and coexisting conditions.

Roman Thomas and colleagues report exome sequencing of 29 small-cell lung cancers (SCLCs), 2 SCLC genomes and transcriptomes of 15 SCLCs. They identify recurrent mutations in the CREBBP, EP300 and MLL genes encoding histone modifiers. They identify mutations in SLIT2 and EPHA7, which have a role in axon guidance and cell migration, and focal amplifications of FGFR1. Small-cell lung cancer (SCLC) is an aggressive lung tumor subtype with poor prognosis1,2,3. We sequenced 29 SCLC exomes, 2 genomes and 15 transcriptomes and found an extremely high mutation rate of 7.4 ± 1 protein-changing mutations per million base pairs. Therefore, we conducted integrated analyses of the various data sets to identify pathogenetically relevant mutated genes. In all cases, we found evidence for inactivation of TP53 and RB1 and identified recurrent mutations in the CREBBP, EP300 and MLL genes that encode histone modifiers. Furthermore, we observed mutations in PTEN, SLIT2 and EPHA7, as well as focal amplifications of the FGFR1 tyrosine kinase gene. Finally, we detected many of the alterations found in humans in SCLC tumors from Tp53 and Rb1 double knockout mice4. Our study implicates histone modification as a major feature of SCLC, reveals potentially therapeutically tractable genomic alterations and provides a generalizable framework for the identification of biologically relevant genes in the context of high mutational background.

Abstract The previous edition of the consensus guidelines of the International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL), published in 2008, has found broad acceptance by physicians and investigators caring for patients with CLL. Recent advances including the discovery of the genomic landscape of the disease, the development of genetic tests with prognostic relevance, and the detection of minimal residual disease (MRD), coupled with the increased availability of novel targeted agents with impressive efficacy, prompted an international panel to provide updated evidence- and expert opinion–based recommendations. These recommendations include a revised version of the iwCLL response criteria, an update on the use of MRD status for clinical evaluation, and recommendations regarding the assessment and prophylaxis of viral diseases during management of CLL.

Which genetic alterations drive tumorigenesis and how they evolve over the course of disease and therapy are central questions in cancer biology. Here we identify 44 recurrently mutated genes and 11 recurrent somatic copy number variations through whole-exome sequencing of 538 chronic lymphocytic leukaemia (CLL) and matched germline DNA samples, 278 of which were collected in a prospective clinical trial. These include previously unrecognized putative cancer drivers (RPS15, IKZF3), and collectively identify RNA processing and export, MYC activity, and MAPK signalling as central pathways involved in CLL. Clonality analysis of this large data set further enabled reconstruction of temporal relationships between driver events. Direct comparison between matched pre-treatment and relapse samples from 59 patients demonstrated highly frequent clonal evolution. Thus, large sequencing data sets of clinically informative samples enable the discovery of novel genes associated with cancer, the network of relationships between the driver events, and their impact on disease relapse and clinical outcome. This study reports exome sequencing of samples from 538 individuals with chronic lymphocytic leukaemia (CLL), including 278 collected as part of a prospective clinical trial; recurrently mutated genes are identified and pathways involved in CLL are highlighted, as well as their evolution in progression and disease relapse. The results of whole-exome sequencing (WES) of samples from 538 individuals with chronic lymphocytic leukaemia (CLL), including 278 collected as part of a prospective clinical trial, identify recurrently mutated genes and highlight pathways involved in the cancer, including RNA processing and export, MYC activity and MAPK signalling. Comparisons of samples from before and after exposure to a uniform treatment demonstrate a high frequency of clonal evolution in individuals with disease relapse.

We describe a method, based on single-molecule imaging, that allows the real-time visualization of the infection pathway of single viruses in living cells, each labeled with only one fluorescent dye molecule. The tracking of single viruses removes ensemble averaging. Diffusion trajectories with high spatial and time resolution show various modes of motion of adeno-associated viruses (AAV) during their infection pathway into living HeLa cells: (i) consecutive virus touching at the cell surface and fast endocytosis; (ii) free and anomalous diffusion of the endosome and the virus in the cytoplasm and the nucleus; and (iii) directed motion by motor proteins in the cytoplasm and in nuclear tubular structures. The real-time visualization of the infection pathway of single AAVs shows a much faster infection than was generally observed so far.

FGFR1 amplification provides a therapeutic target for squamous cell lung cancer, which is resistant to other targeted lung cancer drugs.

Multiple Myeloma (Mm) is a clonal B-cell neoplasm that affects terminally differentiated B cells (ie, plasma cells) and may proceed through different phases: an inactive phase in which tumor cells are nonproliferating mature plasma cells, an active phase with a small percentage (<1%) of proliferating plasmablastic cells, and a fulminant phase with the frequent occurrence of extramedullary proliferation and an increase in plasmablastic cells. During the past years, considerable progress has been made in identifying some of the critical components of neoplastic transformation in MM. This review intends to propose a model of a stepwise malignant transformation during MM pathogenesis. Both diagnostic and therapeutic implications of this model will be discussed.