HT
Hongmei Tang
Author with expertise in RNA Methylation and Modification in Gene Expression
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(75% Open Access)
Cited by:
259
h-index:
14
/
i10-index:
17
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
5

In-depth analysis reveals complex molecular etiology of idiopathic cerebral palsy

Na Li et al.Aug 18, 2020
Abstract Cerebral palsy (CP), the most prevalent physical disability in children, has long been ignored with regard to its inherent molecular mechanism. In this work, we performed in-depth clinical and molecular analysis on 120 idiopathic CP families, and identified in half of the patients the underlying risk factors. By a compilation of 117 CP-related genes, we recognized the characteristic features in terms of inheritance and function, and proposed a dichotomous classification system according to the expression patterns. In two patients with both CP and intellectual disability, we revealed that the defective TYW1, a tRNA hypermodification enzyme, caused microcephaly and problems in motion and cognition by hindering neuronal proliferation and migration. We developed an algorithm and proved in mice brain that this malfunctioning hypermodification specifically perturbed the translation of a subset of proteins involved in cell cycling. In a CP patient with normal intelligence, we identified a mitochondrial enzyme GPAM, the hypomorphic form of which led to hypomyelination of corticospinal tract. We confirmed that the aberrant Gpam in mice perturbed the lipid metabolism in astrocyte, resulting in suppressed astrocyte proliferation and a shortage of lipid contents supplied for oligodendrocyte myelination. This work broadened the scope of understanding of CP etiology and paved a way for innovative therapeutic strategies.
5
Citation4
0
Save
0

Establishment of a UPLC-MS method for quantitative analysis of tryptophan-kynurenine metabolism in IBS-D model rats

Qin Lu et al.Dec 1, 2024
Background and Aims Abnormalities in tryptophan (TRP) metabolism induce abdominal pain and intestinal motility disorders. The study of TRP metabolism in diarrhea-predominant-irritable bowel syndrome (IBS-D) is important for the prevention, diagnosis, and treatment of this disease. In this study, a rapid and reliable ultra performance liquid chromatography-mass spectrometry (UPLC-MS) method was established to quantify tryptophan-kynurenine (TRP-Kyn) metabolism in the colon of a rat model with IBS-D. Methods The proteins were precipitated by methanol, chromatographically separated on a Welch Ultimate® Polar RP column with a gradient elution for 12 min, and detected by high-resolution tandem mass spectrometry. Pure water were used as an alternative mechanism for standard calibration, and the stable structural analog 2-Cl-Phe was used as an internal standard. Results Within a certain range, the r of TRP, kynurenine (Kyn) and quinolinic acid (QA), kynurenic acid (KA) are greater than 0.99, were found to be accurate and precise. The metabolism of TRP was significantly up-regulated along the Kyn pathway in the IBS-D model rats and normalized after treatment with pivacurium bromide. Conclusion This study investigates the mechanisms of IBS-D gastrointestinal dysfunction from the perspective of colonic TRP metabolism, and also provides new directions for the diagnosis and therapeutic approach of this disease.
0

Integrated multi-omics analysis ofKlebsiella pneumoniaerevealed the discrepancy in flavonoid effect against strain growth between Rutin and Luteolin

Jinbo Liu et al.Feb 23, 2024
Abstract The emergence of drug resistant pathogenic bacteria is increasingly challenging conventional antibiotics. Plant derived flavonoids are always considered as potential alternatives to antibiotics due to their antimicrobial properties. However, the molecular mechanisms by which flavonoids inhibit pathogenic microorganisms’ growth are not fully understood. In order to better understand the inhibitory mechanism of flavonoids, two flavonoids were used to incubate Klebsiella pneumoniae ATCC700603. After incubation for 4 hours, both the metabolomic and transcriptomic analysis were performed. In present study, 5,483 genes and 882 metabolites were measured. Compared to wild control, the Rutin and Luteolin induced 507 and 374 differentially expressed genes (DEGs), respectively. However, the number of differential abundant metabolites (DAMs) were the same. The correlation between DEGs and DAMs were studied. The top 10 correlated DEGs and DAMs were identified in each comparative groups. Our results showed that, compared to Luteolin, Rutin induced the accumulation of metabolites and suppressed genes’ expression. Our results provided an explanation for the disparate effects of two flavonoids and demonstrated the inhibitory mechanism of Rutin on strain growth.