JK
Jan‐Willem Koten
Author with expertise in Analysis of Brain Functional Connectivity Networks
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
25
/
i10-index:
49
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Occurrence of non-western magic in the European brain

Jan‐Willem Koten et al.Aug 20, 2018
ABSTRACT Timecourses that exhibit identical behaviour at distinct measurement occasions are reliable. Voodoo connectivity occurs when connectivity among brain regions exceeds within subject timecourse reliability. Thus, timecourse reliability limits the true detectable connectivity. We reproduced a working memory related connectome consisting of 561 paths obtained from 67 individuals. We tested >100000 fc-MRI pipelines and show that Savitzky Golay (SG) filters maximize true connectivity while conserving cognitively relevant changes of signals. This is noteworthy for approaches that focus on rapidly changing aspects of connectomes. Furthermore, SG filters detect zombie activity. These “resting state oscillations” are not under human control and contaminate working state signals. SPM pipelines exhibit more voodoo connectivity than SG pipelines. With the SPM pipeline, we observed a connectivity of r=0.44 and a poor true connectivity of r=0.23, but with the SG pipeline we observed a connectivity of r=0.59 and a fair true connectivity of r=0.43. The number of paths detected with fair true connectivity (r >0.4) was 4 for the SPM pipeline but 352 for the SG based pipeline. However, superior statistical properties of SG pipelines may not reflect neural reality. Hence, causal external validation of fc-MRI pipelines is crucial. Without such studies, different pipelines produce at best “alternative maps”.
0

When most fMRI connectivity cannot be detected: insights from time course reliability

Jan‐Willem Koten et al.Feb 21, 2024
ABSTRACT The level of correlation between two phenomena is limited by the accuracy at which these phenomena are measured. Despite numerous group reliability studies, the strength of the fMRI connectivity correlation that can be detected given underlying within subject time course reliability remains elusive. Moreover, it is unclear how within subject time course reliability limits the robust detection of connectivity on the group level. We estimated connectivity from 50 individuals engaged in a working memory task. The grand mean connectivity of the connectome equaled r =0.41 (95% CI 0.31-0.50) for the test run and r =0.40 (95% CI 0.29-0.49) for the retest run. However, mean connectivity was reduced to r=0.09 (95% C.I. 0.03-0.16) when test-retest reliability and residual auto-correlations of single time courses were considered, suggesting that less than a quarter of the observed connectivity is reliably detectable. Null hypothesis significance testing (NHST)-based analysis revealed that within subject time course reliability markedly affects the significance levels at which paths can be detected at the group level. This was in particular the case when samples were small or connectome coordinates were randomly selected. With a sample of 50 individuals, the connectome of a test session was completely reproduced in retest sessions at P < 2.54e -6 . Despite perfect group reproducibility at conservative p-values, on average only 0.81 percent of the observed connectivity could be attributed to working memory-related time course fluctuations after corrections. Time course reliability can offer valuable insights on the detectable connectivity and should be assessed more frequently in fMRI investigations.