Two Bacillus species were studied which produced bioemulsifiers; however, they were distinctly different compounds. Bacillus sp. strain IAF 343 produced unusually high yields of extracellular biosurfactant when grown on a medium containing only water-soluble substrates. The yield of 1 g/liter was appreciably better than those of most of the biosurfactants reported previously. This neutral lipid product, unlike most lipid biosurfactants, had significant emulsifying properties. It did not appreciably lower the surface tension of water. On the same medium, Bacillus cereus IAF 346 produced a more conventional polysaccharide bioemulsifier, but it also produced a monoglyceride biosurfactant. The bioemulsifier contained substantial amounts of glucosamine and originated as part of the capsule layer. The monoglyceride lowered the surface tension of water to 28 mN/m. It formed a strong association with the polysaccharide, and it was necessary to use ultrafiltration to effect complete separation. The removal of the monoglyceride caused the polysaccharide to precipitate. It is suggested that earlier reports of biopolymers which both stabilized emulsions and lowered surface tension were actually similar aggregates of lipid and bioemulsifier.

The lipopeptide, surfactin, is produced by Bacillus subtilis. A study has been made on large-scale production of this surfactant. A good yield was obtained from a glucose substrate fermentation by continuously removing the product by foam fractionation. The surfactin could be easily recovered from the collapsed foam by acid precipitation. The yield was also improved by the addition of either iron or manganese salts. Hydrocarbon addition to the medium, which normally increases biosurfactant production, completely inhibited surfactin production by B. subtilis.

Rhizopus arrhizus biomass was found to absorb a variety of different metal cations and anions but did not absorb alkali metal ions. The amount of uptake of the cations was directly related to ionic radii of La 3+ , Mn 2+ , Cu 2+ , Zn 2+ , Cd 2+ , Ba 2+ , Hg 2+ , Pb 2+ , UO 2 2+ , and Ag + . The uptake of all the cations is consistent with absorption of the metals by sites in the biomass containing phosphate, carboxylate, and other functional groups. The uptake of the molybdate and vanadate anions was strongly pH dependent, and it is proposed that the uptake mechanism involves electrostatic attraction to positively charged functional groups.

People convey their emotional state in their face and voice. We present an audio-visual data set uniquely suited for the study of multi-modal emotion expression and perception. The data set consists of facial and vocal emotional expressions in sentences spoken in a range of basic emotional states (happy, sad, anger, fear, disgust, and neutral). 7,442 clips of 91 actors with diverse ethnic backgrounds were rated by multiple raters in three modalities: audio, visual, and audio-visual. Categorical emotion labels and real-value intensity values for the perceived emotion were collected using crowd-sourcing from 2,443 raters. The human recognition of intended emotion for the audio-only, visual-only, and audio-visual data are 40.9%, 58.2% and 63.6% respectively. Recognition rates are highest for neutral, followed by happy, anger, disgust, fear, and sad. Average intensity levels of emotion are rated highest for visual-only perception. The accurate recognition of disgust and fear requires simultaneous audio-visual cues, while anger and happiness can be well recognized based on evidence from a single modality. The large dataset we introduce can be used to probe other questions concerning the audio-visual perception of emotion.

Abstract Med15 is a general transcriptional regulator and member of the tail module of the RNA Pol II Mediator complex. The S. cerevisiae Med15 protein has a well-structured N-terminal KIX domain, three Activator Binding Domains (ABDs) and several naturally variable polyglutamine (poly-Q) tracts (Q1, Q2, Q3) embedded in an intrinsically disordered central region, and a C-terminal Mediator Association Domain (MAD). We investigated how the presence of ABDs and changes in length and composition of poly-Q tracts influences Med15 activity and function using phenotypic, gene expression, and transcription factor interaction assays of truncation, deletion, and synthetic alleles. We found that individual Med15 activities were influenced by the number of activator binding domains (ABDs) and adjacent polyglutamine composition. We also observed that distant glutamine tracts and Med15 phosphorylation affected the activities of the KIX domain, suggesting that intramolecular interactions may be required for KIX domain interactions with transcription factors. We conclude that robust Med15 activity required at least the Q1 tract and that the length of that tract modulates activity in a context-dependent manner. We speculate that the glutamine tract provides a degree of intramolecular flexibility that is needed for Med15 function. Finally, we found that loss of Msn2-dependent transcriptional activation in Med15 Q1 tract variants correlates well with a reduction in Msn2:Med15 interaction strength.

ABSTRACT Background Selecting the best antidepressant for a patient with major depressive disorder (MDD) remains a challenge, and some have turned to genomic (and other ‘omic) data to identify an optimal therapy. In this work, we synthesized gene expression data for fluoxetine treatment in both human patients and rodent models, to better understand biological pathways affected by treatment, as well as those that may distinguish clinical or behavioral response. Methods Following the PRISMA guidelines, we searched the Gene Expression Omnibus (GEO) for studies profiling humans or rodent models with treatment of the antidepressant fluoxetine, excluding those not done in the context of depression or anxiety, in an irrelevant tissue type, or with fewer than three samples per group. Included studies were systematically reanalyzed by differential expression analysis and Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Individual pathway and gene statistics were synthesized across studies by three p-value combination methods, and then corrected for false discovery. Results Of the 74 data sets that were screened, 20 were included: 18 in rodents, and two in tissue from human patients. Studies were highly heterogeneous in the comparisons of both treated vs. control samples and responders vs. non-responders, with 737 and 356 pathways, respectively, identified as significantly different between groups in at least one study. However, 19 pathways were identified as consistently different in responders vs. non-responders, including toll-like receptor (TLR) and other immune pathways. Signal transduction pathways were identified as consistently affected by fluoxetine treatment in depressed patients and rodent models. Discussion These meta-analyses confirm known pathways and provide new hints toward antidepressant resistance, but more work is needed. Most included studies involved rodent models, and both patient studies had small cohorts. Additional large-cohort studies applying additional ‘omics technologies are necessary to understand the intricacies and heterogeneity of antidepressant response.

Med15 is a general transcriptional regulator and subunit within the tail module of the RNA Pol II Mediator complex. The S. cerevisiae Med15 protein has a well-structured N-terminal KIX domain, three Activator Binding Domains (ABDs), several naturally variable polyglutamine (poly-Q) tracts (Q1, Q2, Q3) embedded in an intrinsically disordered central region, and a C-terminal Mediator Association Domain (MAD). We investigated how the presence of ABDs and changes in length and composition of poly-Q tracts influences Med15 activity and function using phenotypic, gene expression, transcription factor interaction and phase separation assays of truncation, deletion, and synthetic alleles. We found that individual Med15 activities were influenced by the number of activator binding domains (ABDs) and adjacent polyglutamine tract composition. Robust Med15 activity required at least the Q1 tract and the length of that tract modulated activity in a context-dependent manner. We found that loss of Msn2-dependent transcriptional activation due to Med15 Q1 tract variation correlated well with a reduction in Msn2:Med15 interaction strength, but that interaction strength did not always mirror the propensity for phase separation. We also observed that distant glutamine tracts and Med15 phosphorylation affected the activities of the KIX domain, suggesting that intramolecular interactions may affect some Med15-transcription factor interactions. Further, two-hybrid based interaction studies revealed intramolecular interactions between the N-terminal KIX domain and the Q1R domain of Med15.