Rare copy-number variation (CNV) is an important source of risk for autism spectrum disorders (ASDs). We analyzed 2,446 ASD-affected families and confirmed an excess of genic deletions and duplications in affected versus control groups (1.41-fold, p = 1.0 × 10−5) and an increase in affected subjects carrying exonic pathogenic CNVs overlapping known loci associated with dominant or X-linked ASD and intellectual disability (odds ratio = 12.62, p = 2.7 × 10−15, ∼3% of ASD subjects). Pathogenic CNVs, often showing variable expressivity, included rare de novo and inherited events at 36 loci, implicating ASD-associated genes (CHD2, HDAC4, and GDI1) previously linked to other neurodevelopmental disorders, as well as other genes such as SETD5, MIR137, and HDAC9. Consistent with hypothesized gender-specific modulators, females with ASD were more likely to have highly penetrant CNVs (p = 0.017) and were also overrepresented among subjects with fragile X syndrome protein targets (p = 0.02). Genes affected by de novo CNVs and/or loss-of-function single-nucleotide variants converged on networks related to neuronal signaling and development, synapse function, and chromatin regulation. Rare copy-number variation (CNV) is an important source of risk for autism spectrum disorders (ASDs). We analyzed 2,446 ASD-affected families and confirmed an excess of genic deletions and duplications in affected versus control groups (1.41-fold, p = 1.0 × 10−5) and an increase in affected subjects carrying exonic pathogenic CNVs overlapping known loci associated with dominant or X-linked ASD and intellectual disability (odds ratio = 12.62, p = 2.7 × 10−15, ∼3% of ASD subjects). Pathogenic CNVs, often showing variable expressivity, included rare de novo and inherited events at 36 loci, implicating ASD-associated genes (CHD2, HDAC4, and GDI1) previously linked to other neurodevelopmental disorders, as well as other genes such as SETD5, MIR137, and HDAC9. Consistent with hypothesized gender-specific modulators, females with ASD were more likely to have highly penetrant CNVs (p = 0.017) and were also overrepresented among subjects with fragile X syndrome protein targets (p = 0.02). Genes affected by de novo CNVs and/or loss-of-function single-nucleotide variants converged on networks related to neuronal signaling and development, synapse function, and chromatin regulation.

Autism spectrum disorders (ASD) are a heterogeneous group of neurodevelopmental disorders with a complex inheritance pattern. While many rare variants in synaptic proteins have been identified in patients with ASD, little is known about their effects at the synapse and their interactions with other genetic variations. Here, following the discovery of two de novo SHANK2 deletions by the Autism Genome Project, we identified a novel 421 kb de novo SHANK2 deletion in a patient with autism. We then sequenced SHANK2 in 455 patients with ASD and 431 controls and integrated these results with those reported by Berkel et al. 2010 (n = 396 patients and n = 659 controls). We observed a significant enrichment of variants affecting conserved amino acids in 29 of 851 (3.4%) patients and in 16 of 1,090 (1.5%) controls (P = 0.004, OR = 2.37, 95% CI = 1.23–4.70). In neuronal cell cultures, the variants identified in patients were associated with a reduced synaptic density at dendrites compared to the variants only detected in controls (P = 0.0013). Interestingly, the three patients with de novo SHANK2 deletions also carried inherited CNVs at 15q11–q13 previously associated with neuropsychiatric disorders. In two cases, the nicotinic receptor CHRNA7 was duplicated and in one case the synaptic translation repressor CYFIP1 was deleted. These results strengthen the role of synaptic gene dysfunction in ASD but also highlight the presence of putative modifier genes, which is in keeping with the “multiple hit model” for ASD. A better knowledge of these genetic interactions will be necessary to understand the complex inheritance pattern of ASD.

Abstract The information-processing capability of the brain’s cellular network depends on the physical wiring pattern between neurons and their molecular and functional characteristics. Mapping neurons and resolving their individual synaptic connections can be achieved by volumetric imaging at nanoscale resolution with dense cellular labeling. Light microscopy is uniquely positioned to visualize specific molecules but dense, synapse-level circuit reconstruction by light microscopy has been out of reach due to limitations in resolution, contrast, and volumetric imaging capability. Here we developed light-microscopy based connectomics (LICONN). We integrated specifically engineered hydrogel embedding and expansion with comprehensive deep-learning based segmentation and analysis of connectivity, thus directly incorporating molecular information in synapse-level brain tissue reconstructions. LICONN will allow synapse-level brain tissue phenotyping in biological experiments in a readily adoptable manner. One-Sentence Summary Hydrogel expansion enables molecularly informed reconstruction of brain tissue at synaptic resolution with light microscopy.

ABSTRACT Coelomocytes is a generic name for a collection of cellular morphotypes, present in many coelomate animals, that has been reported as highly variable across echinoderm classes. The roles attributed to the major types of the free circulating cells present in the coelomic fluid of echinoderms include immune response, phagocytic digestion and clotting. The main aim of the present study is the thorough characterization of coelomocytes present in the coelomic fluid of Marthasterias glacialis (class Asteroidea) through the combined use of flow cytometry (FC) and fluorescence plus transmission electron microscopy. Two coelomocyte populations (here named P1 and P2) were identified by flow cytometry and subsequently studied in terms of abundance, morphology, ultrastructure, cell viability and cell cycle profiles. Ultrastructurally, P2 diploid cells showed two main morphotypes, similar to phagocytes and vertebrate thrombocytes, whereas the small P1 haploid cellular population was characterized by a low mitotic activity, relatively undifferentiated cytotype and a high nucleus/cytoplasm ratio. These last cells resemble stem-cell types present in other animals. P1 and P2 cells differ also in cell viability and cell cycle profiles. Additionally, two other morphotypes were only detected by fluorescence microscopy and a third one when using a combined microscopy/FC approach.

The objectives of the study were to: 1) Describe characteristics and lifestyle factors of individuals who have achieved type 2 diabetes (T2D) remission (sub-diabetes glucose levels without glucose-lowering medications for ≥3 months) through changes to diet and exercise behaviour in real-world settings; 2) Investigate continuous glucose monitoring (CGM) profiles of these individuals and explore how dietary pattern may influence glucose regulation metrics. This cross-sectional study recruited individuals living with T2D who achieved remission via changes to diet or exercise behaviours. Various questionnaires were used to assess overall health and participants wore a blinded CGM for 14 days to assess glucose profiles and filled out three-day food records. A total of 21 adults (57 ± 8 years of age) who were recently diagnosed with T2D (4±3 years) with a A1c of 5.7±0.4% volunteered to participate. Participants achieved remission through various means (e.g., combination of diet and exercise/physical activity) and self-reported following different diets, including 52% following a low-carbohydrate or very low-carbohydrate diet, 14% following a "ketovore/carnivore" diet, 10% using a meal replacement diet, 5% following Weight Watcher's diet, and 19% no defined dietary pattern. The 24-hour average CGM glucose value was 5.0 [4.8-5.6] mmol/L (median [IQR]) with 92 [85-97]% of time spent in range (between 4.0-9.9 mmol/). 24-hour average CGM glucose (r=0.692; P=0.001), as well as A1c (r=0.470; P=0.049), were correlated with the daily percentage of energy intake from carbohydrate. Remission of T2D appears achievable through various means, including adoption of different dietary approaches and a more active lifestyle underpinning the importance of a patient-centred care.

Este artigo examina a contabilidade gerencial como uma ferramenta fundamental para o orçamento corporativo e o planejamento estratégico. O objetivo principal é demonstrar como a contabilidade gerencial pode contribuir para a tomada de decisões informadas, otimizar recursos financeiros e operacionais, e, consequentemente, melhorar a competitividade e a sustentabilidade das organizações no mercado atual. O percurso metodológico adotado para a pesquisa se baseou em uma abordagem qualitativa, de natureza exploratória, com revisão bibliográfica de artigos científicos e obras de referência em Contabilidade, acessados por meio de plataformas acadêmicas. O estudo analisou ferramentas como controle de custos, avaliação de desempenho e análise de preços, discutindo seu papel no alinhamento entre orçamento empresarial, planejamento estratégico e resultados organizacionais. Os achados destacam que a contabilidade gerencial não apenas apoia uma gestão eficaz, mas também é crucial para coordenar recursos e objetivos estratégicos, promovendo a eficiência, o crescimento sustentável e a competitividade no longo prazo.

Abstract Chromodomain helicase DNA-binding 8 ( CHD8 ) is one of the most frequently mutated genes causative of autism spectrum disorder (ASD). While its phenotypic spectrum often encompasses macrocephaly and hence implicates cortical abnormalities in this form of ASD, the neurodevelopmental impact of human CHD8 haploinsufficiency remains unexplored. Here we combined human cerebral organoids and single cell transcriptomics to define the effect of ASD-linked CHD8 mutations on human cortical development. We found that C HD8 haploinsufficiency causes a major disruption of neurodevelopmental trajectories with an accelerated generation of inhibitory neurons and a delayed production of excitatory neurons alongside the ensuing protraction of the proliferation phase. This imbalance leads to a significant enlargement of cerebral organoids aligned to the macrocephaly observed in patients with CHD8 mutations. By adopting an isogenic design of patient-specific mutations and mosaic cerebral organoids, we define genotype-phenotype relationships and uncover their cell-autonomous nature. Finally, our results assign different CHD8 -dependent molecular defects to particular cell types, pointing to an abnormal and extended program of proliferation and alternative splicing specifically affected in, respectively, the radial glial and immature neuronal compartments. By identifying temporally restricted cell-type specific effects of human CHD8 mutations, our study uncovers developmental alterations as reproducible endophenotypes for neurodevelopmental disease modelling.