JI
J. Ibarra
Author with expertise in Tick-Borne Diseases and Pathogens Transmission
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(80% Open Access)
Cited by:
607
h-index:
23
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The transcriptional regulator Lrp activates the expression of genes involved in tilivalline enterotoxin biosynthesis inKlebsiella oxytoca

Miguel Cruz et al.Mar 3, 2024
ABSTRACT The toxigenic Klebsiella oxytoca strains secret the tilivalline enterotoxin, which causes antibiotic-associated hemorrhagic colitis. The tilivalline is a non-ribosomal peptide synthesized by enzymes encoded in two divergent operons clustered in a pathogenicity island. The transcriptional regulator Lrp ( l eucine-responsive r egulatory p rotein) controls the expression of several bacterial genes involved in virulence. In this work, we determined the transcriptional expression of aroX and npsA , the first genes of each tilivalline biosynthetic operon in K. oxytoca MIT 09-7231 wild-type and its derivatives Δ lrp mutant and complemented strains. The results show that Lrp directly activates the transcription of both aroX and npsA genes by binding to the intergenic regulatory region in a leucine-dependent manner. Furthermore, the lack of Lrp significantly diminished the cytotoxicity of K. oxytoca on HeLa cells due to tilivalline reduced production. Altogether, our data highlight Lrp as a new regulator by which cytotoxin-producing K. oxytoca strains control the expression of genes involved in the biosynthesis of their main virulence factor. IMPORTANCE Tilivalline is an enterotoxin that is a hallmark for the cytotoxin-producing K. oxytoca strains, which cause antibiotic-associated hemorrhagic colitis. The biosynthesis of tilivalline is driven by enzymes encoded by the aroX - and NRPS-operons. In this study, we discovered that the transcriptional regulator Lrp directly activates expression of the aroX - and NRPS-operons and, in turn, tilivalline biosynthesis. Our results underscore a molecular mechanism by which tilivalline production by toxigenic K. oxytoca strains is regulated and shed further light on developing strategies to prevent the intestinal illness caused by this enteric pathogen.
3

Differentiation-dependent chromosomal organization changes in normal myogenic cells are absent in rhabdomyosarcoma cells

J. Ibarra et al.May 11, 2023
Myogenesis, the progression of proliferating skeletal myoblasts to terminally differentiated myotubes, regulates thousands of target genes. Uninterrupted linear arrays of such genes are differentially associated with specific chromosomes, suggesting chromosome specific regulatory roles in myogenesis. Rhabdomyosarcoma (RMS), a tumor of skeletal muscle, shares common features with normal muscle cells. We hypothesized that RMS and myogenic cells possess differences in chromosomal organization related to myogenic gene arrangement. We compared the organizational characteristics of chromosomes 2 and 18, chosen for their difference in myogenic gene arrangement, in cultured RMS cell lines and normal myoblasts and myotubes. We found chromosome-specific differences in organization during normal myogenesis, with increased area occupied and a shift in peripheral localization specifically for chromosome 2. Most strikingly, we found a differentiation-dependent difference in positioning of chromosome 2 relative to the nuclear axis, with preferential positioning along the major nuclear axis present only in myotubes. RMS cells demonstrated no preference for such axial positioning, but induced differentiation through transfection of the pro-myogenic miRNA miR-206 resulted in an increase of major axial positioning of chromosome 2. Our findings identify both a differentiation-dependent, chromosome-specific change in organization in normal myogenesis, and highlight the role of chromosomal spatial organization in myogenic differentiation.