Abstract The healthy prostate is a relatively quiescent tissue. Yet, prostate epithelium overgrowth is a common condition during ageing, associated with urinary dysfunction and tumorigenesis. For over thirty years, TGF-β ligands have been known to induce cytostasis in a large variety of epithelia, but the intracellular pathway mediating this signal in the prostate, as well as its relevance for quiescence, have remained elusive. Here, using mouse prostate organoids to model epithelial progenitors, we found that intra-epithelial non-canonical Activin A signalling inhibited cell proliferation in a Smad-independent manner. Mechanistically, Activin A triggered Tak1 and p38 MAPK activity, leading to p16 and p21 nuclear import. Spontaneous evasion from this quiescent state occurred upon prolonged culture, due to reduced Activin A secretion, a condition associated with DNA replication stress and aneuploidy. Organoids capable to escape quiescence in vitro were also able to implant with increased frequency into immunocompetent mice. Our study demonstrates that non-canonical Activin A signalling safeguards epithelial quiescence in the healthy prostate, with potential implications for the understanding of cancer initiation, and the development of therapies targeting quiescent tumour progenitors.

Retinoic acid (RA) signaling is a master regulator of vertebrate development with crucial roles in directing body axis orientation and tissue differentiation, including in the reproductive system. However, a mechanistic understanding of how RA signaling promotes cell lineage identity in different tissues is often missing. Here, leveraging prostate organoid technology, we demonstrated that RA signaling orchestrates the commitment of adult mouse prostate progenitors to glandular identity, epithelial barrier integrity, and ultimately, proper specification of the prostatic lumen. Mechanistically, RA-dependent RARγ activation promotes the expression of the pioneer factor Foxa1, which synergizes with the androgen pathway for proper luminal expansion, cytoarchitecture and function.

A vast portion of the mammalian genome is transcribed as long non-coding RNAs (lncRNAs) acting in the cytoplasm with largely unknown functions. Surprisingly, lncRNAs have been shown to interact with ribosomes, encode uncharacterized proteins, or act as ribosome sponges. These functions still remain mostly undetected and understudied owing to the lack of efficient tools for genome-wide simultaneous identification of ribosome-associated lncRNAs and peptide-producing lncRNAs. Here we present AHARIBO, a method for the detection of lncRNAs either untranslated but associated with ribosomes or encoding small peptides. Using AHARIBO in mouse embryonic stem cells during neuronal differentiation, we isolated ribosome-protected RNA fragments, translated RNAs and corresponding de novo synthesized polypeptides. Besides identifying mRNAs under active translation and associated ribosomes, we found and distinguished between lncRNAs acting as ribosome sponges or encoding micropeptides, laying the ground for a better functional understanding of hundreds lncRNAs.### Competing Interest StatementM.C. is the founder of, director of, and a shareholder in IMMAGINA BioTechnology S.r.l., a company engaged in the development of new technologies for gene expression analysis at the ribosomal level. L.M, A.P, C.F., A.D.P., P.B are employees of IMMAGINA BioTechnology S.r.l. A.Q and G.G. are shareholders of IMMAGINA BioTechnology S.r.l. G.V is a scientific advisor of IMMAGINA BioTechnology S.r.l. All of the other authors declare no competing interests.